| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP009273 | 4,442,780 | C→T | I130I (ATC→ATT) | ytfT → | ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP009273 | 4,442,780 | 0 | C | T | 100.0% | 438.5 / NA | 116 | I130I (ATC→ATT) | ytfT | ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (61/55); total (61/55) | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
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gtcAGGTGGTGCTTCAGGGTGGGCTTTTGTTCGGTAGCCCAATAGCCATTCTTAACCGGGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGAGTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGCACCGGCATCCTGGCGGGATTGTGGAACGGCATACTGGTAGCGATTCTCAAAATTCAGCCGTTTGTCGc < 2:725884/287‑1 (MQ=255) tggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGCACCGGCATCCTGGCGGGATTGTGGAACGGCATACTGGTAGCGATTCTCAAAATTCAGCCGTTTGTCGCCAc > 1:965242/1‑286 (MQ=255) cTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGCACCGGCATCCTGGCGGGATTGTGGAACGGCATACTGGTAGCGATTCTCAAAATTCAGCCGTTTGTCGc > 1:64805/1‑278 (MQ=255) cTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGCACCGGCATCCTGGCGGGATTGTGGAACGGCATACTGGTAGCGATTCTCAAAATTCAGCCGTTTGTCGc < 2:64805/278‑1 (MQ=255) ggATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGCACCGGCATCCTGGCGGGATTGTGGAACGGCATACTGGTAGCGATTCTCAAAATTCAGCCGTTTGTCGCCACTCTGATCCTGATg > 1:261696/1‑289 (MQ=255) tggTTCGGTGGTCCCATAGACGTTCTTAACCGTGCAGCGCCCTGTGAGTTACGGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCGCCGGTGGGATTGATCTCGCCGTAGGGGCGGTGATGGCTAGCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGCACCGGCATCCTGGCGGGATTGTGGAACGGCATACTGGTAGCGATTCTCAAAATTCAGCCGTTTGTCGCCACTCTGATCCTGATGGTCGCCGGgc < 2:746074/287‑1 (MQ=255) cccATAGACCTTCTTAACCGTGCCGGTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGCACCGGCATCCTGGCGGGATTGTGGAACGGCATACTGGTAGCGATTCTCAAAATTCAGCCGTTTGTCGCCACTCTGATCCTGATGGTCGCCGGGCGCGGCGTGgcg < 2:375786/288‑1 (MQ=255) cATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGCACCGGCATCCTGGCGGGATTGTGGAACGGCATACTGGTAGCGATTCTCAAAATTCAGCCGTTTGTCGCCACTCTGATCCTGATGGTCGCCGGGCGCGGCGTGGCGCAACTGAt < 1:1087578/288‑1 (MQ=255) aTTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGCACCGGCATCCTGGCGGGATTGTGGAACGGCATACTGGTAGCGATTCTCAAAATTCAGCCGTTTGTCGCCACTCTGATCCTGATGGTCGCCGGGCGCGGCGTGGCGCAACTGAt < 1:813300/287‑1 (MQ=255) 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cGCTGGTGATAGCCACCGGTGGGATTGATCTAGCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGGGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGCACCGGCATCCTGGCGGGATTGTGGAACGGCATACTGGTAGCGATTCTCAAAATTCAGCCGTTTGTCGCCACTCTGATCCTGATGGTCGCCGGGCGCGGCGTGGCGCAACTGATCACCGCCGGGCAGATCGTCACGTTTAACTCGCCGGATCTCTCATGGtt < 2:965242/289‑1 (MQ=255) tGGTGTTCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTGGGGGCGGTGCTGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGCACCGGCATCCTGGCGGGATTGTGGAACGGCATACTGGTAGCGATTCTCAAAATTCAGCCGTTTGTCGCCACTCTGATCCTGATGGTCGCCGGGCGCGGCGTGGCGCAACTGATCACCGCCGGGCAGATCGTCACGTTTAACTCGCCGGATCTCTCATGGTTCgg < 1:175134/289‑1 (MQ=255) gTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGCACCGGCATCCGGGCGGGGTTGTGGAACGGCATCATGGTAGTGATTCTAAAAATTCAGCCGTTTGTCGCCGATCTGATCCTGATGGTCGCCGGGAGCGGCGTGGCGGCACTGATCACCGCCGGGCACATCGTCACGGTTAACTCGACGGATCTCGCATGGTTCGGCa > 2:175134/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |