| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_008463 | 96,621 | (GGCTGT)12→13 | pseudogene (13/723 nt) pseudogene (789/894 nt) |
tagH ← tagH ← |
type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_008463 | = 96548 | 2 (0.010) | 254 (0.500) +TGGCTG |
83/142 | 2.0 | 79.0% | pseudogene (86/723 nt) pseudogene (862/894 nt) |
tagH tagH |
type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
| ? | NC_008463 | 96549 = | 137 (0.260) | pseudogene (85/723 nt) pseudogene (861/894 nt) |
tagH tagH |
type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
|||||
Only 100 of 554 total aligned reads displayed.
AGGTGCGTCGGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑A‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCTGGACGACGGGCGT > NC_008463/96399‑96698 | agctGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGACCGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgcgggc > 1:4151456/4‑151 (MQ=255)agctGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgctggc < 1:10038554/148‑1 (MQ=255) gctgcGGCCGATGGCTTCCCTCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑ACCTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCt < 1:10286333‑M1/149‑2 (MQ=255) ctgCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCGGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGGCGCGGCGGCGCTTGGCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGGTGGCtg > 1:6653755‑M1/2‑149 (MQ=255) cggccgatggcTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGGAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggcg > 1:193339‑M1/6‑146 (MQ=255) ggccgatggCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCgggctg > 2:6968207‑M1/5‑145 (MQ=255) tGGCTTCCCTCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctg < 1:5131749‑M1/151‑13 (MQ=255) cTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGGCGGCGCCGCCACGCGGGCtggctgtggctgtgg > 1:7817546‑M1/1‑136 (MQ=255) ttCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggc < 1:171673‑M1/151‑17 (MQ=255) gtcCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCGTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggc > 1:6420754‑M1/2‑135 (MQ=255) cATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgt < 2:9812944‑M1/151‑20 (MQ=255) cATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgt < 1:11221089‑M1/151‑20 (MQ=255) cgcTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgt > 2:10810560‑M1/1‑126 (MQ=255) cTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtgg < 2:6202285‑M1/151‑28 (MQ=255) cTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtgg < 2:2126824‑M1/151‑28 (MQ=255) cGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 1:709840‑M1/151‑31 (MQ=255) ggCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt > 1:1779019‑M1/1‑120 (MQ=255) gcgcCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg < 1:3755034‑M1/151‑33 (MQ=255) gcgcCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg < 1:5502683‑M1/151‑33 (MQ=255) cgcCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgg < 1:10754878‑M1/151‑34 (MQ=255) cggccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg > 1:10573100‑M1/1‑115 (MQ=255) ggccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCCGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctggggctgtggcggtggcggt > 2:9446397‑M1/1‑114 (MQ=255) ggccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt < 1:4408927‑M1/151‑38 (MQ=255) gccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg < 2:5273937‑M1/151‑39 (MQ=255) gccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg > 2:8733928‑M1/1‑113 (MQ=255) ccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgg < 1:2230699‑M1/151‑40 (MQ=255) ccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgg < 1:6184004‑M1/151‑40 (MQ=255) cggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCGTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggcgggggctgtggctgaggctgtggctgtggctgtggc > 2:11026807‑M1/1‑111 (MQ=255) gTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGCACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctggggctgtggctgtggctgt > 2:2307111‑M1/1‑108 (MQ=255) gTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt > 2:2970551‑M1/1‑108 (MQ=255) gTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt > 2:9096201‑M1/1‑108 (MQ=255) gACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCTGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCGGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggcggtggctggggctgtggctgtggctgtggc > 2:10327000‑M1/1‑105 (MQ=255) gACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc < 1:3071364‑M1/151‑47 (MQ=255) ccatcaa‑ctgggtCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 1:11568754‑M1/145‑49 (MQ=255) cttcaa‑ctgggTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt > 1:9836270‑M1/6‑102 (MQ=255) aa‑cTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggcggtggcg > 1:9058639‑M1/2‑98 (MQ=255) aa‑cTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGATTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggcggtggctgtggcggtggctgtggcggtggctgtggctgtggct > 1:7536511‑M1/2‑98 (MQ=255) a‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 2:610388‑M1/151‑55 (MQ=255) a‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggcggtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg > 1:8205596‑M1/1‑97 (MQ=255) cTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt < 1:3358174‑M1/151‑56 (MQ=255) ggTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc < 1:4787895‑M1/151‑59 (MQ=255) aTGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg < 2:3394960‑M1/151‑63 (MQ=255) ggCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt < 1:9425456‑M1/151‑68 (MQ=255) gccgcGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTGGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc < 2:1170858‑M1/151‑71 (MQ=255) cgcgCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 1:7121221‑M1/151‑73 (MQ=255) aGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 2:11477651‑M1/151‑78 (MQ=255) ggAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 1:8472201‑M1/151‑79 (MQ=255) ggAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCGGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 1:2669385‑M1/151‑79 (MQ=255) aaCGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCgggcggtggcggtggctgtggctgtggctggggcgggggcggtggctgtggcgggggcggtggctggggcggtggcgggt > 2:6042050‑M1/1‑71 (MQ=255) aCGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttg < 1:5847187‑M1/151‑82 (MQ=255) aCGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttg < 2:8448064‑M1/151‑82 (MQ=255) aCGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGAt < 2:6435395/151‑1 (MQ=255) ccTGCAGCAGGGCGCCGCCGGCGGTCGCGGCCGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggt < 2:257352‑M1/151‑85 (MQ=255) 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cGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggt < 1:1583365‑M1/151‑125 (MQ=255) cGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggt < 2:11327124‑M1/151‑125 (MQ=255) gggCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcg < 1:8751468‑M1/151‑128 (MQ=255) gggCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcg < 1:2849059‑M1/151‑128 (MQ=255) gggCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCTGTGGCTGTGGGGTGATCCCCGGGTCGGCGTCGGGCATCGCCCGCGGCGTCGGTTCGGCCgct > 2:4107207/1‑151 (MQ=37) ggCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgttccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcgg > 2:3115014‑M1/1‑23 (MQ=255) gCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggc < 2:6368834‑M1/151‑130 (MQ=255) gCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggc < 2:3357840‑M1/151‑130 (MQ=255) cGTCGGCGCCGCCACGCTGGCgggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggcc < 1:3910041‑M1/151‑131 (MQ=255) cGTCGGCGCCGCCACGCGGGCTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCgctggc < 2:8894334/151‑1 (MQ=255) gTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccg < 2:9618435‑M1/151‑132 (MQ=255) tCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCgctggctg > 2:3962799/1‑151 (MQ=255) tCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCgctggctg < 2:7501434/151‑1 (MQ=255) cGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccgct > 1:7432679‑M1/1‑18 (MQ=255) ggCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGGTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCg > 1:8002826/1‑151 (MQ=255) 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tggctggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccgctggctgcggctggac < 1:8932093‑M1/151‑148 (MQ=255) ctggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccgctggctgcggctggacgac > 1:3212192‑M1/1‑1 (MQ=255) | AGGTGCGTCGGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑A‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGCTGGACGACGGGCGT > NC_008463/96399‑96698 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |