Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,930,677 | +G | intergenic (+175/‑264) | kup → / → rbsD | low affinity potassium transport system/RbsD |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,930,676 | 1 | . | G | 99.6% | 1964.8 / ‑4.5 | 502 | intergenic (+174/‑265) | kup/rbsD | low affinity potassium transport system/RbsD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); major base G (251/249); minor base T (2/0); total (253/249) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 569 total aligned reads displayed.
AACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCC > NC_000913/3930581‑3930766 | aCGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑g < 1:11095883/96‑1 (MQ=255) cGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑gg < 1:11593011/96‑2 (MQ=255) gTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggc < 1:10447776/96‑3 (MQ=255) tAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggca > 2:14152628/1‑93 (MQ=255) agaagaAGTTTTCCACCGCTGCGGGCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACATCCTTCTTTATGTCGCATGATTCGTTGATCCTC‑ggcaa > 2:4028419/1‑92 (MQ=255) aagaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAAc > 1:5926632/1‑96 (MQ=255) aagaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAAc < 2:812806/96‑1 (MQ=255) aagaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAAc < 1:12457834/96‑1 (MQ=255) agaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACg < 1:5214414/96‑1 (MQ=255) gaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGc > 2:5474347/1‑96 (MQ=255) gaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGc > 2:2243921/1‑96 (MQ=255) aagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGcc < 1:1232027/96‑1 (MQ=255) aagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGcc < 1:1803853/96‑1 (MQ=255) agTTTTCCCCCGCTGCGGTCTGGAATTATTAAGTTGCCGGATGATGGAATCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGccc < 1:1518596/96‑1 (MQ=255) agTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑GTCAAACGccc > 1:9856914/1‑96 (MQ=255) gatttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCg > 1:10718985/3‑96 (MQ=255) tttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTg > 2:8793525/1‑96 (MQ=255) tttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTg < 2:13993776/96‑1 (MQ=255) tttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTg < 2:13150358/96‑1 (MQ=255) ttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTgg > 2:10244615/1‑96 (MQ=255) cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTAt < 2:2404391/96‑1 (MQ=255) cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTAt < 2:5820905/96‑1 (MQ=255) ccGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTAttt < 2:6203444/96‑1 (MQ=255) cGCTGCGGTCTGGAAGGGTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTg > 1:1395888/1‑96 (MQ=255) cGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTg > 1:13364420/1‑96 (MQ=255) gatGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCGTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGGGGTATTTGc > 1:3068264/3‑96 (MQ=255) gCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGc > 1:2330002/1‑96 (MQ=255) gCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGc < 1:5531979/96‑1 (MQ=255) gCTACGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGc > 2:12593108/1‑96 (MQ=255) gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAGCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTc < 2:12324480/96‑1 (MQ=255) gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTc > 2:4497737/1‑96 (MQ=255) gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTc > 1:5023644/1‑96 (MQ=255) cgttCTGGAATGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCt < 1:4192394/93‑1 (MQ=255) cGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCt < 1:4534868/96‑1 (MQ=255) gTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgc > 1:6257108/1‑96 (MQ=255) tCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcg > 1:468052/1‑96 (MQ=255) cTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcgc < 2:776975/96‑1 (MQ=255) tGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGcgcg < 1:8675020/96‑1 (MQ=255) gAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGc < 1:1003156/96‑1 (MQ=255) acggATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCa > 1:11668955/3‑96 (MQ=255) aaGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCa > 2:910736/1‑96 (MQ=255) aaGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCa > 1:255485/1‑96 (MQ=255) aaGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCa < 1:14122144/96‑1 (MQ=255) aGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCaa < 2:3369254/96‑1 (MQ=255) ggATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAg < 1:2001217/96‑1 (MQ=255) gATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGc > 2:600554/1‑96 (MQ=255) aTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCt > 1:13218917/1‑96 (MQ=255) aTTAAGGTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCt > 2:13691865/1‑96 (MQ=255) tAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGt > 2:290561/1‑96 (MQ=255) tAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGt < 2:4975543/96‑1 (MQ=255) aGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc < 1:13761004/96‑1 (MQ=255) aGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc < 2:1281292/96‑1 (MQ=255) aGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc < 2:9759492/96‑1 (MQ=255) ttGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACtt < 1:10244615/96‑1 (MQ=255) tGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtg > 2:8583267/1‑96 (MQ=255) gCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc > 1:12017945/1‑96 (MQ=255) ccGGATGATGGAACCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgct < 1:6581522/96‑1 (MQ=255) cGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctg > 2:5321529/1‑96 (MQ=255) ggATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgc < 2:8336395/96‑1 (MQ=255) gatgatGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgct > 2:6710747/1‑96 (MQ=255) attatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgctg < 1:9267485/93‑1 (MQ=255) atgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgctg > 2:1905894/1‑96 (MQ=255) gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa < 2:5117770/96‑1 (MQ=255) gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa > 1:3152673/1‑96 (MQ=255) gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa < 1:5701301/96‑1 (MQ=255) gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa < 1:4407008/96‑1 (MQ=255) gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa < 2:7488619/96‑1 (MQ=255) tgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAc > 1:12992219/1‑96 (MQ=255) tgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAc > 2:9464150/1‑96 (MQ=255) tgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAc > 2:10655056/1‑96 (MQ=255) gAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGt > 1:13570359/1‑96 (MQ=255) aaaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCTG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTa > 1:334746/1‑96 (MQ=255) aaaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTa > 2:1583389/1‑96 (MQ=255) atcctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTaa > 1:7774976/3‑96 (MQ=255) aCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTTCTGCAACGTAAt > 1:3903698/1‑96 (MQ=255) aCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAt < 1:14295287/96‑1 (MQ=255) aCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGGCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAt > 2:11889389/1‑96 (MQ=255) cctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATg < 2:3601946/96‑1 (MQ=255) cctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATg > 1:5298997/1‑96 (MQ=255) ctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgc < 2:14338591/96‑1 (MQ=255) cctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcgc > 2:7180869/1‑96 (MQ=255) cttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCt < 1:3737096/96‑1 (MQ=255) cttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGGGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTGATGCGCt > 1:7626618/1‑96 (MQ=255) ttATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTg > 2:10796218/1‑96 (MQ=255) tATGGCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGc < 2:6905918/96‑1 (MQ=255) tctCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAc > 1:6830899/3‑96 (MQ=255) tCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCa < 2:468052/96‑1 (MQ=255) cGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAg < 1:8784130/96‑1 (MQ=255) cGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAg > 1:9677242/1‑96 (MQ=255) cGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAg > 2:12228036/1‑96 (MQ=255) cATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGac < 1:11271356/96‑2 (MQ=255) cATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAt > 1:492771/1‑96 (MQ=255) aTGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATc < 2:5551683/96‑1 (MQ=255) gTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAGtt > 1:8161637/1‑96 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |