Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,008,469 | +G | intergenic (+36/‑197) | b4555 → / → yigM | hypothetical protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,008,466 | 1 | . | G | 98.8% | 1317.2 / 4.4 | 334 | intergenic (+33/‑200) | b4555/yigM | hypothetical protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/0); new base G (166/163); total (170/164) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.23e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 |
Only 100 of 344 total aligned reads displayed.
CTGGCTACAG‑CTGAAGGATT‑G‑ATTGC‑GTT‑‑GTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑C‑GGG‑‑AAA‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGGCCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑GAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCG > NC_000913/4008401‑4008554 | tgggCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTg > 1:1895113/3‑96 (MQ=255) tgggCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTg > 1:14066289/3‑96 (MQ=255) gggCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTgc < 1:8225197/95‑2 (MQ=255) gggCTACAGCCTGAAGCATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTgc < 1:12784877/95‑2 (MQ=255) ggCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTgcg > 1:7076684/1‑94 (MQ=255) gCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTgcgc > 2:3580414/1‑93 (MQ=255) gCTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTgcgc > 1:3829029/1‑93 (MQ=255) cTACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTgcgca > 2:12933630/1‑92 (MQ=255) tACAGCCTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCAttgt < 1:14250077/83‑3 (MQ=255) cagccTGAAGGATT‑GTATTGCGGTTG‑GTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCgcacca > 2:1354987/5‑96 (MQ=255) cagccTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCgcacca < 2:6322331/92‑1 (MQ=255) cagccTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCgcacca < 1:5473224/92‑1 (MQ=255) aagccTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCgcacca > 1:11336053/5‑96 (MQ=255) gccTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGc < 1:13232428/94‑1 (MQ=255) gccTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGc < 2:9198338/94‑1 (MQ=255) gccTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGc > 2:7169485/3‑96 (MQ=255) gccTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑C‑GGGGCAAG‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGc > 2:3006521/3‑96 (MQ=255) ccTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCg < 1:13504482/95‑1 (MQ=255) cTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGt < 2:9029904/96‑1 (MQ=255) cTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGt > 2:13422741/1‑96 (MQ=255) cTGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGt > 1:4717965/1‑96 (MQ=255) cTGAAGGAAT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGt > 1:6490533/1‑96 (MQ=255) tGAAGGTTT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGGCC‑GGC‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGAGCACCAGCGTc > 1:10000040/1‑96 (MQ=255) tGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTc > 2:12779655/1‑96 (MQ=255) tGAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTc < 2:3460345/96‑1 (MQ=255) gAAGGATTGG‑ATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTAGGGGCAGTGCGCACCAGCGTCt > 1:7330067/1‑96 (MQ=255) gAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCt < 2:1408321/96‑1 (MQ=255) gAAGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCt < 2:3199527/96‑1 (MQ=255) aGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGa > 1:9182962/1‑96 (MQ=255) aGGATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGa > 2:11942376/1‑96 (MQ=255) ggATT‑GTATTGC‑GTTTGGTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGaa > 1:6141413/1‑96 (MQ=255) tttggtgACGGGATGAACGCCGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCTCCAGCGTCTGAAAGACCTTCATccc < 2:3506327/92‑1 (MQ=255) ttggtgACGGGATGAACGCCGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTTCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCg < 1:12545049/93‑1 (MQ=255) ttggtgACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCg < 1:2646397/93‑1 (MQ=255) ttggtgACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCg < 1:3178172/93‑1 (MQ=255) ttggtgACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CGGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCg > 2:667754/4‑96 (MQ=255) t‑‑gtgACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAA‑GTCTCCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAg < 2:4064943/96‑1 (MQ=255) tggtgACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGa > 2:12278771/3‑96 (MQ=255) ggtgACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAg < 1:6969881/95‑1 (MQ=255) gtgACGGGATGAGCGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGacc < 1:11482786/96‑3 (MQ=255) tgACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCt < 2:8539751/96‑1 (MQ=255) gACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑g > 1:12337876/1‑96 (MQ=255) gACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑g > 2:11053208/1‑96 (MQ=255) gACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑g > 2:13018573/1‑96 (MQ=255) aCGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑gg < 1:8733893/96‑2 (MQ=255) cGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑gga < 2:4637065/96‑3 (MQ=255) gggATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑ggaa > 2:2391646/1‑93 (MQ=255) ggATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑ggaag > 2:9374012/1‑92 (MQ=255) aTGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTAATCCCGAGCTGGAAGTg > 1:4419668/1‑96 (MQ=255) tGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGa < 2:7039376/96‑1 (MQ=255) aaCGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGAtt > 2:9511239/1‑96 (MQ=255) aaCGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGAtt > 2:13336172/1‑96 (MQ=255) acgacgCCGACATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTg < 1:10446427/96‑1 (MQ=255) acgacgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTg < 1:13336172/96‑1 (MQ=255) gacgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGt > 1:10646822/1‑96 (MQ=255) gacgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGt < 2:5353643/96‑1 (MQ=255) gacgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGt > 2:6507244/1‑96 (MQ=255) acgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTa > 1:5201485/1‑96 (MQ=255) acgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTa < 1:7685925/96‑1 (MQ=255) acgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTa > 2:198522/1‑96 (MQ=255) cgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTAc > 1:5771707/1‑96 (MQ=255) cgCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTAc > 2:2121151/1‑96 (MQ=255) gCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACt > 2:10252081/1‑96 (MQ=255) gCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACt < 2:4288595/96‑1 (MQ=255) gCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGGGATTGGTACt > 1:2883237/1‑96 (MQ=255) gCCGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCACCCCGGGCTGGAAGTGATTGGTACt < 1:4551446/96‑1 (MQ=255) ccGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGATGTGATTGGTACTa > 2:4844077/1‑96 (MQ=255) ccGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTa < 1:9500971/96‑1 (MQ=255) ccGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTa < 2:583212/96‑1 (MQ=255) ccGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTa > 2:11270071/1‑96 (MQ=255) cGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTat < 1:13811971/96‑2 (MQ=255) cGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTaa < 1:3470877/96‑1 (MQ=255) cGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTaa > 2:5020324/1‑96 (MQ=255) cGAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCAATATGGGAAGTGCGCACAAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGtaataa > 1:98990/1‑96 (MQ=255) cGAAATGCTGTCGAGGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTaa > 1:5114308/1‑96 (MQ=255) gAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAAt < 2:3402901/96‑1 (MQ=255) gAAATGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGGCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAAt > 2:1055763/1‑96 (MQ=255) aaaTGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATg > 1:4869010/1‑96 (MQ=255) aaaTGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATg < 1:11681880/96‑1 (MQ=255) aaaTGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATg > 2:9593158/1‑96 (MQ=255) aaTGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGc > 2:11462068/1‑96 (MQ=255) aaTGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGc > 2:1425508/1‑96 (MQ=255) aTGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGcc > 2:12513252/1‑96 (MQ=255) aTGCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGcc < 2:7786172/96‑1 (MQ=255) gCTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcga < 1:3942414/96‑1 (MQ=255) cTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgac > 2:4433339/1‑96 (MQ=255) cTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgac > 1:4267876/1‑96 (MQ=255) cTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgac > 1:6755947/1‑96 (MQ=255) cTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgac > 1:2051768/1‑96 (MQ=255) cTGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgac < 1:9543973/96‑1 (MQ=255) tGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgacg < 2:7485192/96‑1 (MQ=255) tGTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgacg < 2:9733551/96‑1 (MQ=255) gTCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCcgacga > 2:11764882/1‑96 (MQ=255) tCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCgacgac < 2:8218914/96‑1 (MQ=255) tCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCgacgac > 2:13664577/1‑96 (MQ=255) tCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCgacgac < 1:1976898/96‑1 (MQ=255) tCGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCgacgac < 2:6029483/96‑1 (MQ=255) cGATGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGCCCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGacgacg < 2:5730852/96‑1 (MQ=255) aTGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGAcgcg < 1:8879941/96‑1 (MQ=255) aTGG‑CGGGG‑‑AAAGG‑CTGCATTATGGGCAGTGCGCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCTGGAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGAcgcg > 1:12033079/1‑96 (MQ=255) | CTGGCTACAG‑CTGAAGGATT‑G‑ATTGC‑GTT‑‑GTGACGGGATGAACGACGCCGAAATGCTGTCGATGG‑C‑GGG‑‑AAA‑G‑CTGCATTATGGGCAGTGGCCACCAGCGTCTGAAAGACCTTCATCCCGAGCT‑GAAGTGATTGGTACTAATGCCGACGACGCG > NC_000913/4008401‑4008554 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |