| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,139,669 | +C | coding (233/330 nt) coding (132/159 nt) |
yijI → b4558 ← |
hypothetical protein hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,139,667 | 1 | . | C | 99.6% | 1839.5 / ‑1.5 | 469 | coding (231/330 nt) coding (134/159 nt) | yijI b4558 | hypothetical protein hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base C (219/248); total (220/249) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
Only 100 of 527 total aligned reads displayed.
TGCGCTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTG‑CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTA > NC_000913/4139572‑4139757 | tGCGCTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTg < 2:7963655/96‑1 (MQ=255)tGCGCTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTg < 2:5653720/96‑1 (MQ=255)tGCGCTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTg < 2:304197/96‑1 (MQ=255) gcgcTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCACCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTG‑c > 1:12104401/1‑96 (MQ=255) cTTCCTGTTCGGCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGGATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTG‑ccct > 1:5956987/1‑94 (MQ=255) tCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAGCTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTG‑cccttg > 2:13885571/1‑92 (MQ=255) tCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTACCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTG‑cccttg < 2:5315953/96‑5 (MQ=255) ccTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATAAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGGTTC‑CCTTGc > 1:9264990/1‑96 (MQ=255) cTGTTCGGCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCg < 1:8014624/96‑1 (MQ=255) tGTTCGTCGGCGCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCgg > 2:8697252/1‑96 (MQ=255) cgtcgGCCCCGGAACTCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAg < 1:14358346/96‑1 (MQ=255) cgtcgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAg > 2:1485657/1‑96 (MQ=255) gtcgGCCCCGGAAATCAGGAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCGTGCGGTCAGt > 1:13509493/1‑96 (MQ=255) tcgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAgcg < 1:8648031/96‑3 (MQ=255) cgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTgc < 2:1221619/96‑1 (MQ=255) ggCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTgcg < 2:10325071/96‑1 (MQ=255) ccccGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTgccga > 1:12878413/1‑93 (MQ=255) cccGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTgcgctg < 1:3353688/96‑3 (MQ=255) cacGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAg > 1:11855582/3‑96 (MQ=255) ccGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAgg > 1:1832249/1‑96 (MQ=255) aaaTCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCTGTGCGCAGGGTAt > 2:7679350/1‑96 (MQ=255) aaaTCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAt < 2:10814922/96‑1 (MQ=255) aaTCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGCGCGCAGGTTATg > 1:14000775/1‑96 (MQ=255) aTCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGc < 1:10844783/96‑1 (MQ=255) tCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCATGGCGCAGGTTATGcc > 1:6843284/1‑96 (MQ=255) tCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGcc > 1:10395100/1‑96 (MQ=255) tCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGcc > 2:11018650/1‑96 (MQ=255) cAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCa > 2:14096133/1‑96 (MQ=255) cAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCa < 1:9661340/96‑1 (MQ=255) aGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGAGCTTTTGGA‑GTTGACCTTGCGGTGAGTGCGCAGGTTATGCCAc > 1:1298179/1‑96 (MQ=255) gTACCTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACt < 1:2932368/96‑1 (MQ=255) gTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACt < 2:6651308/96‑1 (MQ=255) tAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTc < 1:3757542/96‑1 (MQ=255) tAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTCGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTc < 2:11608312/96‑1 (MQ=255) aaCTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCATGTTATGCCACTcc < 1:11411482/96‑2 (MQ=255) aaCTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCa < 1:50828/96‑1 (MQ=255) tGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAAtt > 2:9656497/1‑96 (MQ=255) tGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAAtt > 1:4089204/1‑96 (MQ=255) cgTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAGGGGCGCTTTTGGC‑TTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTtgtg < 1:3566229/95‑1 (MQ=255) aGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTtgtg > 1:7331446/1‑96 (MQ=255) aGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTtgtg > 2:1339714/1‑96 (MQ=255) aGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTtgtg > 2:12653952/1‑96 (MQ=255) gTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGtga > 2:6795528/1‑96 (MQ=255) ttATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGtgat < 2:2654093/96‑1 (MQ=255) tATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGtgatg < 2:5922673/96‑1 (MQ=255) tATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGtgatg < 1:3126747/96‑1 (MQ=255) aTCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGtgatga < 2:8893356/96‑1 (MQ=255) tctcccgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GGTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaa < 1:4856353/93‑1 (MQ=255) gcccgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaaaa < 1:14200537/96‑1 (MQ=255) cccgccAGCGTATCGGTGCCACTCAGCGCGAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaaaaa < 1:1939440/96‑1 (MQ=255) ccgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAg > 2:4966179/1‑96 (MQ=255) cgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGt < 2:6190499/96‑1 (MQ=255) cgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGt > 2:13167652/1‑96 (MQ=255) ccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTAt < 1:8538817/96‑1 (MQ=255) ccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTAt < 2:9243/96‑1 (MQ=255) cAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTAtt > 1:8972200/1‑96 (MQ=255) aGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTa > 2:3560778/1‑96 (MQ=255) ggaTCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTacac > 1:4620195/3‑96 (MQ=255) tATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCCCTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTAcaca < 2:1626256/96‑1 (MQ=255) tATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTAcaca < 2:4574429/96‑1 (MQ=255) tATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTAcaca < 1:7663676/96‑1 (MQ=255) aTCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAg < 2:9478960/96‑1 (MQ=255) tCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGc < 2:822552/96‑1 (MQ=255) cGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCg < 1:10105853/96‑1 (MQ=255) cGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCg < 2:12454161/96‑1 (MQ=255) ggTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGt > 1:7205393/1‑96 (MQ=255) ggTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGt < 1:11702757/96‑1 (MQ=255) ggTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGt < 1:5257518/96‑1 (MQ=255) gCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTc > 1:7845413/1‑96 (MQ=255) ccAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTct < 1:8829020/96‑2 (MQ=255) 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aGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTgg > 1:8333598/1‑96 (MQ=255) gcAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCtt > 2:11346206/1‑96 (MQ=255) gcAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCtt > 2:8419137/1‑96 (MQ=255) gcAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCtt < 2:7233195/96‑1 (MQ=255) cAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTg > 1:5581869/1‑96 (MQ=255) cAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTg > 1:1068696/1‑96 (MQ=255) cAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTg > 1:5870820/1‑96 (MQ=255) aaGGGCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGc < 1:7574906/96‑1 (MQ=255) ggCGCTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACAGAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCgg > 1:12511657/1‑96 (MQ=255) gcgcTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCggg > 2:4176436/1‑95 (MQ=255) gcgcTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGa > 2:12836208/1‑96 (MQ=255) gcgcTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGa > 2:4012627/1‑96 (MQ=255) cgcTTTTTGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAAGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGAc < 1:4237869/96‑1 (MQ=255) cgcTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGAc < 1:6599556/96‑1 (MQ=255) cgcTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGAc < 2:1866026/96‑1 (MQ=255) cTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGAcgc < 2:6540429/96‑1 (MQ=255) cTTTTGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGAcgc < 1:1481426/96‑1 (MQ=255) tgttGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGAcgcg > 1:11095200/3‑96 (MQ=255) tttGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACgcgc < 1:2554909/96‑1 (MQ=255) ttGGC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCa > 2:4727358/1‑96 (MQ=255) gC‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGt < 2:2867020/96‑1 (MQ=255) c‑GTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTa < 2:2334185/96‑1 (MQ=255) | TGCGCTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGC‑GTTG‑CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTA > NC_000913/4139572‑4139757 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |