| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,152,247 | +C | intergenic (+10/+29) | yghB → / ← yqhC | hypothetical protein/putative ARAC‑type regulatory protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,152,244 | 1 | . | C | 99.5% | 796.1 / ‑4.1 | 216 | intergenic (+7/+32) | yghB/yqhC | hypothetical protein/putative ARAC‑type regulatory protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (129/86); total (129/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
TGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTT‑C‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAA > NC_000913/3152152‑3152332 | atgatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTtt‑c‑c > 1:1942849/1‑93 (MQ=255) tgatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTtt‑c‑cc < 1:3021359/93‑1 (MQ=255) tgatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTtt‑c‑cc > 2:2766572/1‑93 (MQ=255) gatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTtt‑c‑ccc < 1:1028094/93‑2 (MQ=255) gatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTtt‑c‑ccc < 2:3218162/93‑2 (MQ=255) atCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTtt‑c‑cccg > 2:2568514/1‑91 (MQ=255) ccTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACCCCTGACGATTtt‑c‑cccggt > 2:2313356/1‑89 (MQ=255) tGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTtcc‑ccgttcc > 1:274330/1‑93 (MQ=255) tGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTtcc‑ccgttcc > 1:5961609/1‑93 (MQ=255) tGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTtcc‑ccgttcc > 2:3059080/1‑93 (MQ=255) tGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTtcc‑ccgttcc > 2:1959201/1‑93 (MQ=255) ccAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTtcc‑ccgttcccg > 2:5122471/1‑93 (MQ=255) cAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTtcc‑ccgttccccg > 1:3422865/1‑91 (MQ=255) caatGCCTTTTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGt < 2:6547768/90‑1 (MQ=255) aaTTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGt > 1:4275124/1‑93 (MQ=255) aaTTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGt < 2:4656930/93‑1 (MQ=255) aaTTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGt < 1:3302397/93‑1 (MQ=255) aaTTCCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGt < 2:1217160/93‑1 (MQ=255) gCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCt < 1:6037091/93‑1 (MQ=255) ccTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTg < 2:1164821/93‑1 (MQ=255) ttGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTa > 1:2790126/1‑93 (MQ=255) tGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTAc < 1:1422201/93‑1 (MQ=255) tGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTAc > 1:5560228/1‑93 (MQ=255) gTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTAcc > 2:1824032/1‑93 (MQ=255) tAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCgg > 1:2215781/1‑93 (MQ=255) aaCCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCggg > 2:640610/1‑93 (MQ=255) aaCCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGGTGCTGTAACggg > 1:4890748/1‑93 (MQ=255) aCCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGa > 1:4545869/1‑93 (MQ=255) aCCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGGTCCCGGGTGCTGTACCGGGa > 1:4622457/1‑93 (MQ=255) cGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAAAAACGGTAAGGCCGGCCATTTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCGTTACCGGGaa > 2:1330526/1‑93 (MQ=255) gCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACg > 2:214038/1‑93 (MQ=255) cTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGt > 1:832157/1‑93 (MQ=255) tGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTa > 1:3264522/1‑93 (MQ=255) gCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTAtt > 2:585337/1‑93 (MQ=255) cTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATCCTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGGACGTAttt < 2:4388990/93‑1 (MQ=255) tGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTaa < 2:1043178/93‑1 (MQ=255) gTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAAt > 1:6499024/1‑93 (MQ=255) tAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGGTCCCGGTTGCTGGACCGGGAACGTATTTAATTc > 1:6238018/1‑93 (MQ=255) ggCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTccc < 1:2497272/93‑1 (MQ=255) aCGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTg > 2:2039307/1‑93 (MQ=255) aCGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTg > 1:2807942/1‑93 (MQ=255) cGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGc < 2:5992593/93‑1 (MQ=255) cGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGGATTTAATTCCCCTGc > 1:1375346/1‑93 (MQ=255) gCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCa > 1:1484694/1‑93 (MQ=255) gCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCa > 1:5210896/1‑93 (MQ=255) cTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCAt < 2:5046839/93‑1 (MQ=255) cTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTACGCTGCAt > 1:5376563/1‑93 (MQ=255) tGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATc > 1:1744883/1‑93 (MQ=255) gTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCg > 2:6618885/1‑93 (MQ=255) gTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCg > 1:5129670/1‑93 (MQ=255) gTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCg > 1:2007552/1‑93 (MQ=255) tttGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGc > 2:5276328/1‑93 (MQ=255) tttGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGc > 2:1389348/1‑93 (MQ=255) tgtgGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGccc < 1:3710309/93‑1 (MQ=255) tgtgGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCCTTCCCCGGTTCTGTACCCGGGACGTATTTTATTTCCCTCCATCGccc > 2:4529911/1‑93 (MQ=255) ggtgATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCa > 2:6506480/1‑93 (MQ=255) ggtgATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCa < 2:4055872/93‑1 (MQ=255) gtgATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCAt < 2:6043087/93‑1 (MQ=255) tgATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCAtt < 2:3320903/93‑1 (MQ=255) gATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTc < 2:3400080/93‑1 (MQ=255) aTT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCt > 1:1099370/1‑93 (MQ=255) aTT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCt > 1:2251310/1‑93 (MQ=255) aTT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCt > 1:4026415/1‑93 (MQ=255) tt‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCtt < 1:5817345/93‑1 (MQ=255) tt‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCtt < 1:5269731/93‑1 (MQ=255) tt‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCtt > 2:1563205/1‑93 (MQ=255) t‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTg > 2:6476321/1‑93 (MQ=255) aaaaaaaaaTACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGc < 1:6450207/93‑1 (MQ=255) aaaaaaaaTACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGcc > 2:2693267/1‑93 (MQ=255) aaaaaaaTACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCg > 2:5471843/1‑93 (MQ=255) aaTACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCt < 1:4095385/93‑1 (MQ=255) aaTACTGTAACGCCTGACGATTTT‑CGCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCt < 2:6421893/93‑1 (MQ=255) aTACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCtt > 2:4901671/1‑93 (MQ=255) aTACTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGACCGCATTCTTGCCGCATCtt > 2:298320/1‑93 (MQ=255) cTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTccc < 2:3619183/93‑1 (MQ=255) cTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTccc < 1:5053074/93‑1 (MQ=255) cTGTAACGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGGATTTAATTTCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTccc > 1:3586965/1‑93 (MQ=255) tGTAGCGCCTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTcccc < 2:3917492/93‑1 (MQ=255) 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cTGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTca < 2:2880953/93‑1 (MQ=255) tGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcac < 1:4410512/93‑1 (MQ=255) tGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcac < 2:3544186/93‑1 (MQ=255) tGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcac < 1:158693/93‑1 (MQ=255) tGACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGGTGCTGTACCGGGGACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCCGCGTcac > 1:4749489/1‑93 (MQ=255) gACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcaca > 2:3797775/1‑93 (MQ=255) gACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcaca > 1:376820/1‑93 (MQ=255) gACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcaca > 1:6355101/1‑93 (MQ=255) gACGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcaca > 1:717743/1‑93 (MQ=255) aCGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCacac > 2:2247046/1‑93 (MQ=255) cGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACAcc < 2:784482/93‑1 (MQ=255) cGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACAcc < 1:2521268/93‑1 (MQ=255) cGATTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACAcc < 1:3068418/93‑1 (MQ=255) ttttc‑C‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGaa < 2:6117651/92‑1 (MQ=255) | TGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTT‑C‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAA > NC_000913/3152152‑3152332 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |