| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,013,772 | +C | intergenic (‑53/‑246) | ysgA ← / → udp | hypothetical protein/uridine phosphorylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,013,770 | 1 | . | C | 99.1% | 802.0 / ‑1.8 | 218 | intergenic (‑51/‑248) | ysgA/udp | hypothetical protein/uridine phosphorylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/2); new base C (119/97); total (119/99) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
GCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGC‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑C‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCT > NC_000913/4013679‑4013856 | gtcgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑c‑c > 1:3598774/1‑93 (MQ=255) tcgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑c‑cc > 2:6386576/1‑92 (MQ=255) gcgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑c‑cc < 2:1179349/92‑2 (MQ=255) cgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑c‑cct < 1:2578078/93‑3 (MQ=255) tcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑c‑cctta > 2:2153041/1‑89 (MQ=255) tcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑c‑cctta < 1:571709/93‑5 (MQ=255) cGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTtata > 1:4889864/1‑93 (MQ=255) cGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑CTCTtata > 2:3863470/1‑93 (MQ=255) ggggTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATaa > 2:1622161/1‑93 (MQ=255) ggTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATaaaa < 1:2694260/93‑1 (MQ=255) ggTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATaaaa < 1:4991811/93‑1 (MQ=255) cTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATg > 1:17262/1‑93 (MQ=255) tGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGt < 1:6277513/93‑1 (MQ=255) gAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGtt < 1:2114441/93‑1 (MQ=255) gAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGtt < 1:3900781/93‑1 (MQ=255) gAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGtt > 2:2881877/1‑93 (MQ=255) aCGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTgc < 1:4222315/93‑1 (MQ=255) aCGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTgc < 2:3283029/93‑1 (MQ=255) aCGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTgc > 2:6043477/1‑93 (MQ=255) aCGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTgc < 1:3058134/93‑1 (MQ=255) cGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTgcg > 2:6148647/1‑93 (MQ=255) cGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTgcg < 1:1152995/93‑1 (MQ=255) gATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTgcgc > 2:2552105/1‑93 (MQ=255) aTGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCa > 1:1458985/1‑93 (MQ=255) tGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCaa > 1:942328/1‑93 (MQ=255) gTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATg > 2:1849939/1‑93 (MQ=255) tCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGt < 2:2932177/93‑1 (MQ=255) gAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTa > 1:3728558/1‑93 (MQ=255) aaGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTaa < 2:5946445/93‑1 (MQ=255) aaGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTaa > 1:3527759/1‑93 (MQ=255) aaGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTaa > 2:3538248/1‑93 (MQ=255) aGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAAc > 2:3822629/1‑93 (MQ=255) gCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACt < 2:1273658/93‑1 (MQ=255) gCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACt > 1:2864677/1‑93 (MQ=255) gCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACt < 1:5434150/93‑1 (MQ=255) cGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACta < 2:145812/93‑1 (MQ=255) gagaGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACtat > 1:2920202/1‑93 (MQ=255) gagaGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACtat > 1:1817645/1‑93 (MQ=255) ggcgaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTc < 1:3227148/89‑1 (MQ=255) gaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGc > 1:5243936/2‑93 (MQ=255) aTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCa > 2:238793/1‑93 (MQ=255) tGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCAt < 2:141558/93‑1 (MQ=255) tGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCAt > 2:2840033/1‑93 (MQ=255) gcagcaAGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATg < 2:1147703/93‑1 (MQ=255) cagcagGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGc > 2:5855159/1‑93 (MQ=255) gcagGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGcaa < 1:937215/93‑1 (MQ=255) ggTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGcaacaa > 1:1141218/1‑93 (MQ=255) gTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACaaa < 2:5591813/93‑1 (MQ=255) gTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACaaa < 2:82178/93‑1 (MQ=255) gTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACaaa > 2:1015216/1‑93 (MQ=255) tGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAAt < 1:3426971/93‑1 (MQ=255) tGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAAt > 1:1776032/1‑93 (MQ=255) cAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATca > 2:3957519/1‑93 (MQ=255) aaaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATcac > 1:3196736/1‑93 (MQ=255) aaaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATcac > 1:609385/1‑93 (MQ=255) aaaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATcac < 2:5470134/93‑1 (MQ=255) aTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAt < 1:669710/93‑1 (MQ=255) tCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAtt < 2:4014620/93‑1 (MQ=255) ccAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTg < 2:4741019/93‑1 (MQ=255) cAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGc > 2:4325428/1‑93 (MQ=255) cAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGc > 1:1657537/1‑93 (MQ=255) aGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGcc > 1:3048856/1‑93 (MQ=255) gATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCt > 1:5386303/1‑93 (MQ=255) gATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCt < 2:1608429/93‑1 (MQ=255) aTTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTg > 1:5584109/1‑93 (MQ=255) aTTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTg > 2:4633709/1‑93 (MQ=255) ttgttgTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGa > 2:6318386/1‑93 (MQ=255) gttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAAt < 1:2514892/93‑1 (MQ=255) gttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAAt < 2:3339937/93‑1 (MQ=255) gttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAAt < 1:5979699/93‑1 (MQ=255) ttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATc < 1:6486528/93‑1 (MQ=255) ttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATc < 1:1909169/93‑1 (MQ=255) ttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATc < 1:1650396/93‑1 (MQ=255) gttgttGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCt > 2:5771382/1‑93 (MQ=255) ttgttgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTc < 1:2440450/93‑1 (MQ=255) ttgttgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTc > 1:5134598/1‑93 (MQ=255) gttgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCAt > 2:2350821/1‑93 (MQ=255) ttgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATc < 2:6598139/93‑1 (MQ=255) ttgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATc < 1:2326971/93‑1 (MQ=255) ttgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATc < 2:4227959/93‑1 (MQ=255) tgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCt < 1:5741816/93‑1 (MQ=255) tgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCt < 2:1310619/93‑1 (MQ=255) tgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCt < 2:3442044/93‑1 (MQ=255) ccATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTCAATCGGCTCATCttt > 1:1874105/1‑93 (MQ=255) aTGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTTCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTa > 2:2684480/1‑93 (MQ=255) aTGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTa < 2:4155229/93‑1 (MQ=255) aTGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTa > 1:1360181/1‑93 (MQ=255) aTGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTa > 1:5618016/1‑93 (MQ=255) tGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAt < 2:1997175/93‑1 (MQ=255) tGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAt > 1:3310227/1‑93 (MQ=255) tGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAt > 1:4714795/1‑93 (MQ=255) ggTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATg > 1:2843523/1‑93 (MQ=255) gTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGc > 2:4302242/1‑93 (MQ=255) tATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCa > 1:3985440/1‑93 (MQ=255) tATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCa > 1:1071035/1‑93 (MQ=255) ttCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGt > 2:5323159/1‑93 (MQ=255) ttCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGt > 1:2071275/1‑93 (MQ=255) ttCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGt > 2:2256612/1‑93 (MQ=255) tctcCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTc < 1:1585193/93‑1 (MQ=255) tcCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCt > 1:6149877/1‑93 (MQ=255) | GCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGC‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑C‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCT > NC_000913/4013679‑4013856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |