New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 269765 = | NA (NA) | 245 (0.950) | 127/184 | 0.4 | 98.8% | coding (300/405 nt) | yi91a | hypothetical protein |
? | NC_000913 | = 370983 | 3 (0.010) | coding (536/882 nt) | mhpC | 2‑hydroxy‑6‑ketonona‑2,4‑dienedioic acid hydrolase |
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
TCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAA > NC_000913/269673‑269854 | tCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACt < 1:5908739/93‑1 (MQ=255) tCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACt < 2:5607146/93‑1 (MQ=255) ccccATTGCCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGt < 2:247862/93‑1 (MQ=255) ccccATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGt < 1:4139845/93‑1 (MQ=255) cccATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTa > 2:5694521/1‑93 (MQ=255) cccATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTa < 2:1672447/93‑1 (MQ=255) 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aaaTTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAAc > 2:26809/1‑93 (MQ=255) aaaTTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAAc > 2:4908452/1‑93 (MQ=255) aaaTTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAAc > 1:1284004/1‑93 (MQ=255) aaTTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACg > 1:5607922/1‑93 (MQ=255) gAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAAc > 1:3029144/1‑93 (MQ=255) gAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAAc < 1:880442/93‑1 (MQ=255) tCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGtt < 1:406224/93‑1 (MQ=255) tCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGtt > 1:2382363/1‑93 (MQ=255) ccGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTa > 1:4652986/1‑93 (MQ=255) cGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTAt > 1:1852529/1‑93 (MQ=255) gTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTAtg > 1:6011220/1‑93 (MQ=255) tGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTAtgt < 1:4498912/93‑1 (MQ=255) tGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTAtgt < 1:5687282/93‑1 (MQ=255) cTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGaaa > 2:2834267/1‑93 (MQ=255) tCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAATAAGGCTACAGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGGTATGTGaaaa > 2:6640894/1‑93 (MQ=255) tCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGaaaa > 1:2483786/1‑93 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |