Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,650,396 | T→C | intergenic (‑89/‑118) | b2520 ← / → b2521 | hypothetical protein/putative thiosulfate sulfur transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,650,396 | 0 | T | C | 87.2% | 624.3 / 72.4 | 227 | intergenic (‑89/‑118) | b2520/b2521 | hypothetical protein/putative thiosulfate sulfur transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (8/21); new base C (107/91); total (115/112) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.38e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.47e-01 |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
ATTTTTCATCCCTGCCACAATGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCATACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATCCGACAATTTAGCC > NC_000913/2650306‑2650487 | atttttcatCCCTGCCACAATGGTCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCacac > 2:5243047/1‑93 (MQ=255) atttttcatCCCTGCCACAATGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCacac > 2:2027021/1‑93 (MQ=255) tCCCTGCCACAATGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGaa > 2:4138946/1‑93 (MQ=255) cccTGCCACAATGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGGGTGAAAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAAt < 1:3907738/93‑1 (MQ=255) cTGCCACAATGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAAttt > 2:146899/1‑93 (MQ=255) tGCCACAATGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAAtttt > 2:900307/1‑93 (MQ=255) gCCACAATGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTa > 1:5182829/1‑93 (MQ=255) cacaATGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACACCCACACAATCAGAATTTTAGt > 2:3433303/1‑93 (MQ=255) acaATGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTg < 1:1485470/93‑1 (MQ=255) acaATGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTg > 2:506032/1‑93 (MQ=255) caATGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCATACAATCCGAATTTTAGTga < 1:872787/93‑1 (MQ=255) aaTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCATGCCCACACAATCCGAATTTTAGTgag > 1:1171712/1‑93 (MQ=255) aaTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCATACAATCCGAATTTTAGTgag > 1:1011293/1‑93 (MQ=255) aaTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTgag > 1:6043292/1‑93 (MQ=255) aaTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTgag < 2:3496729/93‑1 (MQ=255) aaTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTgag > 1:3543202/1‑93 (MQ=255) aaTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTgag > 2:5913243/1‑93 (MQ=255) aaTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTgag > 2:5990679/1‑93 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTgaga > 1:301927/1‑93 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTgaga > 1:3360394/1‑93 (MQ=255) tGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGaa > 1:5268214/1‑93 (MQ=255) ggCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAAt < 1:185886/93‑1 (MQ=255) ggCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAAt > 1:1958885/1‑93 (MQ=255) ggCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTAAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAAt < 2:4007052/93‑1 (MQ=255) cccGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATtg > 1:3673268/1‑93 (MQ=255) ccGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATtgt < 2:1665973/93‑1 (MQ=255) gTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCATACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTgg < 1:5256865/93‑1 (MQ=255) gTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTgg < 2:2617718/93‑1 (MQ=255) gTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTgg < 1:4726843/93‑1 (MQ=255) aGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTc < 1:4388950/93‑1 (MQ=255) gCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCATACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCa < 1:2785228/93‑1 (MQ=255) gCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCa < 2:6225338/93‑1 (MQ=255) gCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCa > 2:1269516/1‑93 (MQ=255) aaCGTTGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCATACACTCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGa > 1:1369815/1‑93 (MQ=255) aaCGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGa < 1:2382957/93‑1 (MQ=255) aCGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGAc < 2:6545202/93‑1 (MQ=255) tCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGc > 2:2203187/1‑93 (MQ=255) tCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGc < 1:958136/93‑1 (MQ=255) gAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCa > 2:5509031/1‑93 (MQ=255) gAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCa > 1:1886672/1‑93 (MQ=255) aataatTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCaa > 2:4840783/1‑93 (MQ=255) ataatTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCaaa > 2:5929002/1‑93 (MQ=255) ataatTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCaaa > 1:1109405/1‑93 (MQ=255) taatTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAAt > 2:2275496/1‑93 (MQ=255) taatTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAAt < 1:211384/93‑1 (MQ=255) aatTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCATACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATc < 1:3799064/93‑1 (MQ=255) aatTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATc < 2:4675426/93‑1 (MQ=255) aatTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATc < 2:4436216/93‑1 (MQ=255) ttattaTGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAA‑TGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGc > 2:3750312/1‑93 (MQ=255) attatGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGcc < 1:3245418/93‑1 (MQ=255) ttatGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCct > 1:2529529/1‑93 (MQ=255) ttatGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCct > 1:4352173/1‑93 (MQ=255) ttatGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCct > 2:502113/1‑93 (MQ=255) tatGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCctc > 2:5526713/1‑93 (MQ=255) gCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCATACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCttt < 2:2791744/93‑1 (MQ=255) gCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCttt > 1:4033002/1‑93 (MQ=255) cGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCtttt < 2:5110234/93‑1 (MQ=255) cGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCtttt < 1:915269/93‑1 (MQ=255) tGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGc < 2:357353/93‑1 (MQ=255) gagaATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCATACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCt < 1:4770671/93‑1 (MQ=255) gagaATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCt > 2:6059622/1‑93 (MQ=255) gagaATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCt > 2:3299516/1‑93 (MQ=255) gagaATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCt < 1:160395/93‑1 (MQ=255) gagaATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCt < 1:6220946/93‑1 (MQ=255) agaATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCtt < 1:2044727/93‑1 (MQ=255) aTTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTc > 2:5223456/1‑93 (MQ=255) tttACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCg > 2:3156099/1‑93 (MQ=255) tACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCt > 1:5774022/1‑93 (MQ=255) aCGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCtt < 2:1887604/93‑1 (MQ=255) cGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCttt < 1:3078476/93‑1 (MQ=255) gTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCtttt > 2:4560749/1‑93 (MQ=255) gTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCtttt > 2:1538962/1‑93 (MQ=255) gTTATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCtttt > 1:3128666/1‑93 (MQ=255) ttATGTAATTCAGTATCACGCCCACACCATCCGAATTTTAGTGAGCATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTc > 2:2908845/1‑93 (MQ=255) ttATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTc < 1:3632270/93‑1 (MQ=255) tATGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCa > 2:2240655/1‑93 (MQ=255) aTGTAATTCAGTATCACGCCCATACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCAc < 2:4237661/93‑1 (MQ=255) aTGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCAc < 2:2099903/93‑1 (MQ=255) tGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACt < 1:4680641/93‑1 (MQ=255) tGTAATTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACt > 2:5513876/1‑93 (MQ=255) aaTTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTaaa > 2:1609901/1‑93 (MQ=255) aTTCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAAc > 2:1409895/1‑93 (MQ=255) ttCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACa > 2:5723231/1‑93 (MQ=255) ttCAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACa < 1:4104213/93‑1 (MQ=255) tCAGTATCACGCCCATACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACAt > 2:4635789/1‑93 (MQ=255) cAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATc < 1:1783521/93‑1 (MQ=255) cAGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATc > 1:6320080/1‑93 (MQ=255) aGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCGGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc < 2:3119294/93‑1 (MQ=255) aGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc < 1:4289362/93‑1 (MQ=255) aGTATCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATcc < 1:5411179/93‑1 (MQ=255) aTCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATCCGAc > 1:2665034/1‑93 (MQ=255) aTCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATCCGAc > 2:239002/1‑93 (MQ=255) aTCACGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATCCGAc < 2:2647757/93‑1 (MQ=255) aTCACGCACACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATCCGAc > 1:3693417/1‑93 (MQ=255) cGCCCACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATCCGACAAtt > 1:5685670/1‑93 (MQ=255) cccACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATCCGACAATTTa > 2:3932032/1‑93 (MQ=255) ccACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATCCTACAATTTaa > 2:5869521/1‑92 (MQ=255) ccACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATCCGACAATTTAg > 2:3956640/1‑93 (MQ=255) ccACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATCCGACAATTTAg > 1:4997261/1‑93 (MQ=255) ccACACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATCCGACAATTTAg < 1:4758573/93‑1 (MQ=255) | ATTTTTCATCCCTGCCACAATGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAGTATCACGCCCATACAATCCGAATTTTAGTGAGAATTGTGGCTCAGACAGCCAAATCAGCCTCTTTTGCTTGTCGCTTTTCACTAAACATCCGACAATTTAGCC > NC_000913/2650306‑2650487 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |