Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,971,621 | C→T | G134G (GGC→GGT) | rffH → | glucose‑1‑phosphate thymidylyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,971,621 | 0 | C | T | 89.4% | 851.2 / 67.5 | 282 | G134G (GGC→GGT) | rffH | glucose‑1‑phosphate thymidylyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (11/19); new base T (116/136); total (127/155) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.38e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.62e-02 |
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
GGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCAAAACAGCCG > NC_000913/3971531‑3971711 | ggTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTa > 1:5575488/1‑93 (MQ=255) ggTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTa < 2:6055760/93‑1 (MQ=255) tGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGCCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATc < 1:5885757/93‑1 (MQ=255) gCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCa < 2:1704785/93‑1 (MQ=255) gCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCa < 2:3738707/93‑1 (MQ=255) gCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCa < 1:419080/93‑1 (MQ=255) cTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAg > 2:6338325/1‑93 (MQ=255) cTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAg < 1:6522343/93‑1 (MQ=255) gggCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGt > 1:6231143/1‑93 (MQ=255) gggCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGt < 1:5890668/93‑1 (MQ=255) gggCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGt < 2:5818666/93‑1 (MQ=255) ggCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTg > 2:6242837/1‑93 (MQ=255) gCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGa < 2:2980056/93‑1 (MQ=255) gCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGa < 2:3106233/93‑1 (MQ=255) gCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGa < 1:3589247/93‑1 (MQ=255) cGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGAt > 1:309422/1‑93 (MQ=255) cGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGAt < 2:1103041/93‑1 (MQ=255) gATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATg > 1:2960082/1‑93 (MQ=255) gATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATg < 2:885105/93‑1 (MQ=255) gATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATg > 1:2220226/1‑93 (MQ=255) aTAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATgg < 1:6563591/93‑1 (MQ=255) aTAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATgg < 1:233934/93‑1 (MQ=255) tAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGa > 1:5167056/1‑93 (MQ=255) aaCATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGAc > 1:3414115/1‑93 (MQ=255) aaCATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGAc > 1:6091760/1‑93 (MQ=255) aCATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGAcc < 1:4857293/93‑1 (MQ=255) aCATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGAcc > 1:3212998/1‑93 (MQ=255) cATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGAccc < 1:6480248/93‑1 (MQ=255) cATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGAccc < 2:4111618/93‑1 (MQ=255) cATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGAccc > 2:1235792/1‑93 (MQ=255) aTCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCg > 1:45934/1‑93 (MQ=255) cttcttCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGa < 1:5228460/93‑1 (MQ=255) ttcttcGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGaa > 2:4191285/1‑93 (MQ=255) ttcttcGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGaa < 1:5025366/93‑1 (MQ=255) ttcttcGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGaa > 2:242770/1‑93 (MQ=255) ttcttcGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGaa < 1:3938491/93‑1 (MQ=255) ttcGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGCACGc > 1:4764463/1‑93 (MQ=255) cGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCtt < 2:329939/93‑1 (MQ=255) ggTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCttt < 2:2849235/93‑1 (MQ=255) ggTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCttt < 1:334170/93‑1 (MQ=255) ggTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCttt > 2:527585/1‑93 (MQ=255) ggTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCttt < 2:5660691/93‑1 (MQ=255) ggTCAGGGCTTCAGTCAGAAGCTGCGTGATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCttt < 1:149192/93‑1 (MQ=255) gTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTg > 2:6507131/1‑93 (MQ=255) tCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTgg < 1:547949/93‑1 (MQ=255) cAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGc < 2:1687064/93‑1 (MQ=255) cAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGc > 1:4354600/1‑93 (MQ=255) aGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCg < 2:1875277/93‑1 (MQ=255) gggCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCgt > 1:5703400/1‑93 (MQ=255) gggCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCgt > 1:4108935/1‑93 (MQ=255) gggCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCgt < 1:4063288/93‑1 (MQ=255) gggCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCgg > 2:3209033/1‑92 (MQ=255) ggCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCgtg > 2:1927790/1‑93 (MQ=255) ggCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCgtg < 2:3570040/93‑1 (MQ=255) ttCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCgtggtg < 1:1011019/93‑1 (MQ=255) tCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGtggtgg < 2:4857489/93‑1 (MQ=255) cAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGa > 1:2488809/1‑93 (MQ=255) aGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAg < 2:6278732/93‑1 (MQ=255) gTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGt < 1:1207839/93‑1 (MQ=255) gTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGt > 1:1724352/1‑93 (MQ=255) gTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGt < 2:1565366/93‑1 (MQ=255) cGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTg > 2:3013516/1‑93 (MQ=255) cGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGCGTTTg > 1:1369609/1‑93 (MQ=255) gCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTgacga > 2:4496283/1‑93 (MQ=255) tGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACa > 2:4372446/1‑93 (MQ=255) tGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACa > 1:2615831/1‑93 (MQ=255) tGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACa > 2:4694310/1‑93 (MQ=255) tGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACa < 1:1709051/93‑1 (MQ=255) gCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACaa < 1:5499299/93‑1 (MQ=255) gCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACaa > 2:279514/1‑93 (MQ=255) cGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAAt < 2:5070938/93‑1 (MQ=255) gTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAAtt < 1:816192/93‑1 (MQ=255) tCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAAttt < 1:4697533/93‑1 (MQ=255) cATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTc < 2:1598543/93‑1 (MQ=255) cATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTc < 2:180514/93‑1 (MQ=255) atattGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTcc < 2:4915791/90‑1 (MQ=255) aTGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTcc < 2:499269/93‑1 (MQ=255) gcggcgCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCt > 2:4043759/1‑93 (MQ=255) gcgcgcACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTAtc > 1:2859701/1‑93 (MQ=255) gcgcACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTAtctc < 2:4541083/93‑1 (MQ=255) cgcACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGGTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCg > 2:133886/1‑93 (MQ=255) cACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCt < 2:5560/93‑1 (MQ=255) cACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCt < 1:2442026/93‑1 (MQ=255) aaGGGGCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGgaag > 1:4256302/1‑93 (MQ=255) ggCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGaaaa < 2:258432/93‑1 (MQ=255) gCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAg > 2:3397282/1‑93 (MQ=255) gCGACGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAg < 2:677596/93‑1 (MQ=255) gACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGcc > 1:5784640/1‑93 (MQ=255) cGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCaa > 2:4037376/1‑93 (MQ=255) cGGTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCaa > 1:5938598/1‑93 (MQ=255) gTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCaaaa > 1:4732601/1‑93 (MQ=255) gTTTTTGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCaaaa < 2:5774857/93‑1 (MQ=255) tttttGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCAAAAc < 1:1871959/93‑1 (MQ=255) tttttGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCAAAAc < 1:1571747/93‑1 (MQ=255) tttGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCAAAACAg < 1:5812097/93‑1 (MQ=255) ttGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCAAAACAGc < 2:2104490/93‑1 (MQ=255) ttGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCAAAACAGc < 2:5498382/93‑1 (MQ=255) ttGGCTATCAGGTGATGGACCCGGCACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCAAAACAGc > 1:1801594/1‑93 (MQ=255) ttGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCAAAACAGc < 2:2032002/93‑1 (MQ=255) tGGTTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCAAAACAGcc > 1:6413768/1‑93 (MQ=255) | GGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCAAAACAGCCG > NC_000913/3971531‑3971711 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |