Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,021,157 | C→T | G9G (GGC→GGT) G5G (GGC→GGT) |
tatD → b4556 → |
Mg‑dependent DNase hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,021,157 | 0 | C | T | 84.2% | 755.4 / 111.1 | 291 | G9G (GGC→GGT) G5G (GGC→GGT) | tatD b4556 | Mg‑dependent DNase hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/16); new base T (151/94); total (181/110) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.41e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.83e-03 |
Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
GACGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCATCACCGG > NC_000913/4021066‑4021249 | acgCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGgtgt > 1:1500319/1‑93 (MQ=255) acgCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGgtgt < 1:5290569/93‑1 (MQ=255) acgCAGAAGAAGAAAGCGAAAAACCTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCG‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGgtgt < 1:1353072/93‑1 (MQ=255) cgCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGtt < 1:4162155/93‑1 (MQ=255) cgCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGtt < 2:6385982/93‑1 (MQ=255) gCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTa > 1:3041996/1‑93 (MQ=255) cTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTaa < 2:5264350/93‑1 (MQ=255) cTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTaa > 2:6066567/1‑93 (MQ=255) gCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGa > 2:538680/1‑93 (MQ=255) aGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGAcc > 2:5670431/1‑93 (MQ=255) aGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGAcc < 1:1757858/93‑1 (MQ=255) aGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGAcc > 2:6559406/1‑93 (MQ=255) aaaGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAg > 1:4480197/1‑93 (MQ=255) aaaGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAg < 1:3584764/93‑1 (MQ=255) aaGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGt > 1:1696885/1‑93 (MQ=255) aaGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGt > 1:2167468/1‑93 (MQ=255) aaGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGt > 1:5178516/1‑93 (MQ=255) gCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTc > 2:3100053/1‑93 (MQ=255) gCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTc < 1:6611738/93‑1 (MQ=255) cGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTTATTTGACGAGTTCg > 1:4549008/1‑93 (MQ=255) cGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCg > 1:4633765/1‑93 (MQ=255) gAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGc > 1:3886974/1‑93 (MQ=255) aaaaaaCTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCa < 2:5151499/93‑1 (MQ=255) aaaaaaCTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCa > 2:3964923/1‑93 (MQ=255) aagatGAAGAAAAATTGCAACGTCCCGTGG‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGTATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAAtt < 1:2516843/89‑1 (MQ=255) aaaCTGAAGAATAAATTCACCCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAAtt < 1:3694217/93‑1 (MQ=255) aaaCTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAAtt < 2:246594/93‑1 (MQ=255) aaCTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAAttt < 2:4516130/93‑1 (MQ=255) aCTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTg > 2:2386947/1‑93 (MQ=255) cTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGc > 2:4022019/1‑93 (MQ=255) cTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGc < 2:618931/93‑1 (MQ=255) tGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCg > 2:2621902/1‑93 (MQ=255) agaaTAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGaaa < 2:1690526/93‑1 (MQ=255) agaaTAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGaaa > 1:6424652/1‑93 (MQ=255) agaaTAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGCTCGCAATTTGCGaaa > 2:2216077/1‑93 (MQ=255) gaagaaATTCAACCGCCCGTCG‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAg < 2:2732985/93‑1 (MQ=255) gaaTAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAg > 2:1124843/1‑93 (MQ=255) gaaTAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAg > 1:6034817/1‑93 (MQ=255) aaTAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGa > 2:5932860/1‑93 (MQ=255) aaTAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGa > 2:5472508/1‑93 (MQ=255) aaaaTCCACCCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGAcc < 1:1205499/92‑1 (MQ=255) aTTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGtg > 1:3768146/1‑93 (MQ=255) ttCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGtga > 1:5526542/1‑93 (MQ=255) ttCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGtga > 2:4440274/1‑93 (MQ=255) tCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGtgat > 1:4817421/1‑93 (MQ=255) cAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGtgatg < 1:5461410/93‑1 (MQ=255) cAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGtgatg > 2:3930942/1‑93 (MQ=255) cAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGtgatg > 1:3978940/1‑93 (MQ=255) cGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgt > 2:4324687/1‑93 (MQ=255) cGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgt > 1:1588625/1‑93 (MQ=255) gCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgtt < 1:6113499/93‑1 (MQ=255) gCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgtt < 2:5866278/93‑1 (MQ=255) ccccGTGA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgtt < 1:3616029/92‑1 (MQ=255) cccGTCAGGGGGGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgtt < 1:1195272/93‑1 (MQ=255) cccGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgttg > 1:2383987/1‑93 (MQ=255) ccGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgttgt > 2:4649546/1‑93 (MQ=255) ccGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgttgt > 1:1959950/1‑93 (MQ=255) gTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAg < 2:5585796/93‑1 (MQ=255) tCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGc < 2:4994193/93‑1 (MQ=255) tCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGc > 2:1928920/1‑93 (MQ=255) tCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGc > 1:4028268/1‑93 (MQ=255) cA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCg < 1:4668341/93‑1 (MQ=255) a‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGt > 1:2666464/1‑93 (MQ=255) a‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGt > 2:1829999/1‑93 (MQ=255) a‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGt > 1:212909/1‑93 (MQ=255) a‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGt > 2:3764979/1‑93 (MQ=255) gggCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTg > 1:813465/1‑93 (MQ=255) ggCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTgc > 2:34027/1‑93 (MQ=255) gTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCtt > 1:1925556/1‑93 (MQ=255) gTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCtt > 1:953281/1‑93 (MQ=255) ttGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCttt < 2:5351060/93‑1 (MQ=255) gTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTg > 2:5423252/1‑93 (MQ=255) tCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGa > 1:6247757/1‑93 (MQ=255) cATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGAc > 1:3520849/1‑93 (MQ=255) cATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGAc > 1:860896/1‑93 (MQ=255) tatGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGAcgc < 1:5390563/93‑1 (MQ=255) tatGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGAcgc < 1:2846920/93‑1 (MQ=255) atGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGAcgcg < 2:3817690/93‑1 (MQ=255) ggAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCggg > 1:5628888/1‑93 (MQ=255) ggAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCggg < 2:358045/93‑1 (MQ=255) aGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAg < 1:43033/93‑1 (MQ=255) gTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGt < 2:2641950/93‑1 (MQ=255) gTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGt < 2:4794321/93‑1 (MQ=255) gTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGt < 2:2798987/93‑1 (MQ=255) gTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGt < 1:4118834/93‑1 (MQ=255) tACAGTATGTTGTATATCGGTGGTAATATGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTTATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGtt < 1:5707010/93‑1 (MQ=255) aGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAAt > 2:4192375/1‑93 (MQ=255) ggATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATg < 2:1500319/93‑1 (MQ=255) aTGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGGTAATggg > 1:5916446/1‑93 (MQ=255) gTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCt > 1:315557/1‑93 (MQ=255) ttGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATTGGCTAc < 2:5749204/93‑1 (MQ=255) ttGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTAc < 1:5797276/93‑1 (MQ=255) ttGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTAc < 2:1573515/93‑1 (MQ=255) ttGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGCAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTAc < 1:1475889/93‑1 (MQ=255) atatCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACtca < 1:1309208/93‑1 (MQ=255) atatCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACtca > 1:1012322/1‑93 (MQ=255) atatCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACtca < 1:5101765/93‑1 (MQ=255) tatCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACtcat > 2:890296/1‑93 (MQ=255) atCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACtcatc > 2:3218307/1‑93 (MQ=255) atCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACtcatc < 2:721475/93‑1 (MQ=255) | GACGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCATCACCGG > NC_000913/4021066‑4021249 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |