| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 379,244 | (G)10→7 | intergenic (‑118/+47) | yaiN ← / ← yaiO | putative alpha helix chain/hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 379240 = | 42 (0.120) | 238 (0.750) | 113/170 | 1.1 | 87.4% | intergenic (‑114/+53) | yaiN/yaiO | putative alpha helix chain/hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | = 379236 | 30 (0.090) | intergenic (‑110/+57) | yaiN/yaiO | putative alpha helix chain/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
TTTTAACGGTCTGCAACTTGCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAG‑C‑CC‑CC‑CC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/379338‑379240‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑c‑cc‑cc‑ccTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATAGAATAC < NC_000913/379236‑379145 TTTTAACGGTCTGCAACTTGCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAG‑C > 1:360578/1‑93TTTTAACGGTCTGCAACTTGCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAG‑C < 1:4787122/93‑1 TTTAACGGTCTGCAACTTGCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAG‑C‑C > 1:1706093/1‑93 TTTAACGGTCTGCAACTTGCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAG‑C‑C > 1:7806042/1‑93 ACGGTCTGCAACTTGCAGCCCGTCTCACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAG‑C‑CC‑CC‑C > 1:5807053/1‑93 CGGTCTGCAACTTGCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAG‑C‑CC‑CC‑CC > 2:5134176/1‑93 AACTTGCTCCCCGTCTGCCCTGAAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCTTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTC < 2:2423357/93‑1 AACTTGCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTC > 1:1519454/1‑93 AACTTGCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTC < 2:1096759/93‑1 AACTTGCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTC < 2:7648765/93‑1 ACTTGCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCT < 2:7040221/93‑1 CTTGCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTTCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCTCTGCCGATTAG‑CACC‑CA‑CCTTTCCTCgt > 1:7955655/1‑91 CTTGCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTCTCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTT < 1:4539654/93‑1 CTTGCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTT < 1:3232624/93‑1 TTGCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTT > 1:2887459/1‑93 tCAGCCCGTTTGTCCTGGAAATTCTGCTCCCTTCCGCCCCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGT < 1:6912087/92‑1 GCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGT < 2:5493461/93‑1 CAGCCCGTCTGCCCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTT < 1:2955362/93‑1 CAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTT < 1:7513971/93‑1 GCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTT > 1:500558/1‑93 GCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTT > 2:7202929/1‑93 GCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTT > 1:8117163/1‑93 GCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTT > 2:1443535/1‑93 CCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTC < 2:5272263/93‑1 CCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCC < 1:4438816/93‑1 GTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGA < 2:4647139/93‑1 GTCTGACCTGGAAATTCCGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGA > 1:647107/1‑93 CTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACC < 2:4070485/93‑1 GACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCAC < 1:4513568/93‑1 CCTGGAAATTCTGCTTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCACTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACAT < 1:4019383/93‑1 CCTGGAAATTCTGATTCGTTCTGCCGCCCGCTACCGGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACAT < 2:297746/93‑1 CTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATT < 1:2442002/93‑1 CTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATT > 2:4273979/1‑93 TGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTC > 2:5848593/1‑93 GGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCA > 1:1179789/1‑93 AAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACC > 2:4543545/1‑93 TCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGAT < 1:5579472/93‑1 CTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTACTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATA > 1:7156683/1‑93 TGATTCCTTCTGTCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAG‑C‑CC‑CCTCCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACAATCACCGGAAAA > 2:7814295/1‑93 GATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTTACCGGATAAA > 2:443080/1‑93 TCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTT < 2:3057090/93‑1 TCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTT > 1:3793812/1‑93 CTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCTGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTA < 1:5664700/93‑1 CTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTA > 2:2694209/1‑93 CTTCTGCCCCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTA < 2:6376667/93‑1 TCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATT > 2:6246194/1‑93 ctcCCGCCGGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATGAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTC < 1:6066282/90‑1 GCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTC > 2:1215995/1‑93 GCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTC > 1:2029418/1‑93 GCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTC < 1:3882241/93‑1 GCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTC > 1:6731667/1‑93 CGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCA < 2:8466099/93‑1 GCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAG > 1:6680302/1‑93 GCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAG > 2:5791518/1‑93 CGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGT < 2:647737/93‑1 CTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTA < 1:8736596/93‑1 TATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTAT < 2:1247478/93‑1 TATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTAT > 1:8016661/1‑93 TATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAG‑C‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATA > 1:5931202/1‑93 ATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGCATAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCCTTTTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATA > 2:3744138/1‑93 ATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATA > 2:7384303/1‑93 CCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATA < 1:3496353/93‑1 GGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTTCAGTGTTATATACT > 2:1698049/1‑93 GGGCTGCTTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTA < 2:3955661/93‑1 GGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTA > 1:7005559/1‑93 ggGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATA < 2:3283065/91‑1 GCGGCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATA < 2:8345292/93‑1 CGGCCTTCCCTGCCGATTAG‑C‑CCACC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAG < 2:1504979/93‑1 GGCCTTCCCTGCCGATTAG‑C‑CC‑CCACCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGG > 1:2186552/1‑93 GCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGG < 2:8769462/93‑1 GCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGG > 1:3285668/1‑93 GCCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGG < 1:8458447/93‑1 CCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGG < 2:1370719/93‑1 CCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGG < 1:1285498/93‑1 CCTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGG > 2:6041746/1‑93 CTTCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGG > 1:5455869/1‑93 TCCCTGCCGATTAGCC‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGT < 1:4673328/93‑1 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GATTAG‑C‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGGTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGA < 2:8588318/93‑1 C‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATA > 1:1799012/1‑93 C‑CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATA < 2:3157760/93‑1 CC‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATAa > 2:5610407/1‑92 C‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATAGA > 1:252295/1‑93 C‑CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATAAACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATAGA > 1:7506424/1‑93 CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATAGAA > 1:1089174/1‑93 CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATAGAA < 1:6134604/93‑1 CC‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATCCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATAGAA < 2:1146739/93‑1 C‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATAGAAT > 1:4185695/1‑93 C‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATAGAAT < 1:2063951/93‑1 C‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATAGAAT > 1:6249943/1‑93 C‑CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATAGAAT > 2:5007195/1‑93 CCTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATAGAATA > 2:3177266/1‑93 CTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATAGAATAC < 2:1850649/93‑1 TTTTAACGGTCTGCAACTTGCAGCCCGTCTGACCTGGAAATTCTGATTCCTTCTGCCGCCCGCTATCCGGGGCGGCCTTCCCTGCCGATTAG‑C‑CC‑CC‑CC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/379338‑379240‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑c‑cc‑cc‑ccTTTCCTCTTTGTTTTCCGACCACATTCACCGGATAAATTTTATTCTCCAGTGTTATATACTATAGGGGGGTATGCATTGACATATAGAATAC < NC_000913/379236‑379145 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |