Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,210,786 | A→G | intergenic (+384/+117) | mcrA → / ← ycgW | McrA/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,210,786 | 0 | A | G | 99.6% | 806.7 / NA | 236 | intergenic (+384/+117) | mcrA/ycgW | McrA/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (108/126); total (109/127) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
GCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGC > NC_000913/1210696‑1210875 | gcAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGatcgtc > 1:3821622/1‑93 (MQ=255) caatcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGAtcgtcg > 2:8424247/1‑93 (MQ=255) aatcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGa > 1:7736337/1‑93 (MQ=255) aatcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGa > 1:2192136/1‑93 (MQ=255) tcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGaaa < 1:1373626/93‑1 (MQ=255) caatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGaaaa < 2:6400584/93‑1 (MQ=255) caatGCCAAGACCATAACTTATGACTTCGACCGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGaaaa < 2:6645526/93‑1 (MQ=255) atGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACa < 1:2699101/93‑1 (MQ=255) atGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCGGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACa < 1:8486275/93‑1 (MQ=255) tGCCAAGACCGTAACTTATGCCTTCTAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACAt < 2:3647742/93‑1 (MQ=255) ccAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATga > 1:1156461/1‑92 (MQ=255) ccAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGt < 2:2226696/93‑1 (MQ=255) cAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTa < 1:8441298/93‑1 (MQ=255) aaGACCGTAACTTATTACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTaa < 1:7348412/93‑1 (MQ=255) gACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTTAtc < 2:8626175/93‑1 (MQ=255) gACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAAtc > 1:1024194/1‑93 (MQ=255) aaCCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAAtc < 2:6441164/92‑1 (MQ=255) acGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAAtctc < 1:5714099/92‑1 (MQ=255) tAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTcc > 1:1815314/1‑93 (MQ=255) aaCTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCa > 2:2045108/1‑93 (MQ=255) aCTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCAt > 1:8730385/1‑93 (MQ=255) aCTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCAt > 1:4383270/1‑93 (MQ=255) aCTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCAt > 2:3556710/1‑93 (MQ=255) cTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCAtg < 2:2934909/93‑1 (MQ=255) ttATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCAtgt > 2:7734145/1‑93 (MQ=255) tATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATCTAATCTCTCCAtgtg < 2:8709559/93‑1 (MQ=255) tGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGtt > 2:8392784/1‑93 (MQ=255) tGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGtt < 1:4026885/93‑1 (MQ=255) cTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTaaa > 2:1363558/1‑93 (MQ=255) ttCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAat > 2:4071243/1‑93 (MQ=255) ttCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAat < 1:5777766/93‑1 (MQ=255) gAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATAtt > 2:1888227/1‑93 (MQ=255) gAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATAtt > 1:1197402/1‑93 (MQ=255) gAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATAtt > 1:744941/1‑93 (MQ=255) gAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATAtt > 1:7295118/1‑93 (MQ=255) aaCGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTg < 1:3988943/93‑1 (MQ=255) aaCGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTg < 2:6042128/93‑1 (MQ=255) aCGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGa > 2:7866628/1‑93 (MQ=255) aCGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGa > 1:93618/1‑93 (MQ=255) cGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGaa > 1:6905702/1‑93 (MQ=255) cGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGaa < 1:811524/93‑1 (MQ=255) cGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGaa > 1:3655718/1‑93 (MQ=255) gTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTTaaa > 2:309814/1‑93 (MQ=255) gTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGaaa < 2:7566213/93‑1 (MQ=255) gTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGaaa < 2:2105482/93‑1 (MQ=255) tCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAAc > 2:8600400/1‑93 (MQ=255) tCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAAc < 2:1542911/93‑1 (MQ=255) gATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACggg < 2:6248213/93‑1 (MQ=255) aTGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGc < 2:116766/93‑1 (MQ=255) ggAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGt > 2:3714743/1‑93 (MQ=255) aaGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGtat > 2:4944790/1‑93 (MQ=255) aaGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGtat > 1:3012882/1‑93 (MQ=255) aGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGtata < 2:5242641/93‑1 (MQ=255) aGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGtata > 1:2039953/1‑93 (MQ=255) gcgcTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAac < 1:3505827/93‑1 (MQ=255) gcgcTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAac < 2:3865451/93‑1 (MQ=255) gcTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAacac > 1:6152289/1‑93 (MQ=255) gcTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAacac < 1:2361411/93‑1 (MQ=255) cTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACg < 2:5081188/93‑1 (MQ=255) cTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACg > 1:780132/1‑93 (MQ=255) tAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGc < 1:6059035/93‑1 (MQ=255) tAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGc > 2:4232342/1‑93 (MQ=255) aGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGccc < 2:5434016/93‑1 (MQ=255) aGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCCAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGccc < 2:6315772/93‑1 (MQ=255) ctgctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgt < 1:967889/93‑1 (MQ=255) tgctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgtt < 2:3513858/93‑1 (MQ=255) tgctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgtt > 1:2445379/1‑93 (MQ=255) tgctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgtt > 2:8174607/1‑93 (MQ=255) gctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgttg > 1:6016314/1‑93 (MQ=255) gctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgttg < 1:6412293/93‑1 (MQ=255) ctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgttgt < 1:6664016/93‑1 (MQ=255) ctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgttgt < 2:6590084/93‑1 (MQ=255) ctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgttgt < 2:1701611/93‑1 (MQ=255) tgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgttgtt > 2:7105716/1‑93 (MQ=255) gAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGttt < 1:463606/93‑1 (MQ=255) gAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGttt > 2:4727091/1‑93 (MQ=255) aaTGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTttta < 1:3750964/93‑1 (MQ=255) gTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTtttattt < 2:8798543/93‑1 (MQ=255) tCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTttatttat < 1:4265890/93‑1 (MQ=255) cAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAtg < 2:334851/93‑1 (MQ=255) cAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAtg < 2:2642347/93‑1 (MQ=255) agagTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAtgt < 2:5917089/93‑1 (MQ=255) agagTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAtgt < 1:5156536/93‑1 (MQ=255) gagTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAtgtg > 1:1274692/1‑93 (MQ=255) agTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTgg < 2:2388128/93‑1 (MQ=255) gTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGa < 1:3775200/93‑1 (MQ=255) gTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGa > 1:7587956/1‑93 (MQ=255) tttGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGat > 2:3880528/1‑93 (MQ=255) ttGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGata < 2:6465839/93‑1 (MQ=255) ttGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGata < 1:5299872/93‑1 (MQ=255) tgTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGAtatt < 1:4500910/92‑1 (MQ=255) tGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGAtattat < 1:5390579/93‑1 (MQ=255) gAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATattatt > 2:7260348/1‑93 (MQ=255) gAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATattatt < 1:8254403/93‑1 (MQ=255) gAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATattatt > 1:8723256/1‑93 (MQ=255) gAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATattatt > 1:3186496/1‑93 (MQ=255) aGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTaa > 1:7184929/1‑93 (MQ=255) cGATCGTCGANAACATGTAATNTNTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATa < 1:8563478/93‑1 (MQ=255) gATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAg < 2:4702416/93‑1 (MQ=255) atcgtcGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTGTTTATGTGGATGTTATTAATAga > 1:4851748/1‑92 (MQ=255) | GCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGC > NC_000913/1210696‑1210875 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |