Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,545,666 | A→G | D81G (GAC→GGC) D81G (GAC→GGC) |
b4525 → fdnG → |
hypothetical protein formate dehydrogenase‑N, nitrate‑inducible, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,545,666 | 0 | A | G | 100.0% | 937.1 / NA | 278 | D81G (GAC→GGC) D81G (GAC→GGC) | b4525 fdnG | hypothetical protein formate dehydrogenase‑N, nitrate‑inducible, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (137/141); total (137/141) |
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
CATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGACCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTGCGCTACC > NC_000913/1545576‑1545755 | caTACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGcc > 1:8345750/1‑93 (MQ=255) caTACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGcc < 2:2601365/93‑1 (MQ=255) caTACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGcc > 1:2089690/1‑93 (MQ=255) aTACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGccc > 2:4067608/1‑93 (MQ=255) aTACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGccc > 1:6680580/1‑93 (MQ=255) tACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCg > 1:1866660/1‑93 (MQ=255) 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aaaaaCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTg < 1:929870/93‑1 (MQ=255) aaaaaCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTg > 1:3792883/1‑93 (MQ=255) aaaaaCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTg < 1:7375066/93‑1 (MQ=255) aaaaaCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTg > 1:7590114/1‑93 (MQ=255) aaaaaCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTg > 2:6430370/1‑93 (MQ=255) aaaaCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTgg < 2:7413544/93‑1 (MQ=255) aaCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGAt < 2:1791167/93‑1 (MQ=255) gCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTAc > 1:8150199/1‑93 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |