Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,027,751 | (C)6→7 | coding (191/921 nt) | yedA → | putative transmembrane subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,027,745 | 1 | . | C | 98.2% | 571.1 / 1.9 | 167 | coding (185/921 nt) | yedA | putative transmembrane subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/3); new base C (86/78); total (86/81) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.12e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
GGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑CC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACA > NC_000913/2027653‑2027832 | ggAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGGTACTGCGCGGACACCAA‑C‑t > 1:5571576/1‑93 (MQ=255) aaaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑cc < 2:1249573/93‑1 (MQ=255) aaaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑cc < 2:2980616/93‑1 (MQ=255) aaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑cc‑c < 2:894872/93‑1 (MQ=255) aaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑cc‑c > 1:5464306/1‑93 (MQ=255) aaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑cc‑c < 2:2915132/93‑1 (MQ=255) aGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑cc‑cc > 1:116666/1‑93 (MQ=255) gCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑cc‑ccc > 2:3586260/1‑93 (MQ=255) cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑cc‑cccc < 2:589497/93‑1 (MQ=255) ggCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑cc‑cccccg > 2:1377169/1‑91 (MQ=255) ggCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑cc‑cccccg > 2:4107355/1‑91 (MQ=255) ggCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑cc‑cccccg > 1:2307086/1‑91 (MQ=255) ggCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑cc‑cccccg > 1:2193675/1‑91 (MQ=255) gCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑cc‑cccccgc > 2:2838923/1‑90 (MQ=255) gCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑cc‑cccccgc > 2:2292002/1‑90 (MQ=255) tCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCCTTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTAc > 1:6190022/1‑93 (MQ=255) tCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTAc > 1:5895546/1‑93 (MQ=255) tCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTAc < 2:3271014/93‑1 (MQ=255) ccGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACg > 2:56852/1‑93 (MQ=255) ccGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACg > 1:4005038/1‑93 (MQ=255) gTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTc < 2:4207821/93‑1 (MQ=255) gTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTc > 2:6352715/1‑93 (MQ=255) gTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTc > 2:623653/1‑93 (MQ=255) ttAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTcc > 2:2761400/1‑93 (MQ=255) ttAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTcc < 1:2479298/93‑1 (MQ=255) ttAATGATGGCGGGAGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTcc < 1:2112589/93‑1 (MQ=255) atgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCgct < 1:2511481/93‑1 (MQ=255) atgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCgctgct < 2:364125/93‑1 (MQ=255) tgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTc < 2:877230/93‑1 (MQ=255) ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCa > 1:673717/1‑93 (MQ=255) ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCa > 1:6119948/1‑93 (MQ=255) gcgggcgTTGTATTCCTGGCAGCCGGTATTTTAGTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑CGC‑CC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCaa < 2:816130/93‑1 (MQ=255) gcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCaa < 2:3048830/93‑1 (MQ=255) ggggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAC‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAAt < 1:6174152/92‑1 (MQ=255) ggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAC‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGc < 1:4605704/93‑1 (MQ=255) ggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGc > 2:2709841/1‑93 (MQ=255) ggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGc > 2:1321532/1‑93 (MQ=255) gcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGcc > 2:2882360/1‑93 (MQ=255) gTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgc > 2:6249817/1‑93 (MQ=255) cGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCt > 1:542598/1‑93 (MQ=255) tCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAtt < 1:1707404/93‑1 (MQ=255) tCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAtt < 1:1634012/93‑1 (MQ=255) ggCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGcc < 2:2008621/93‑1 (MQ=255) gCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCt < 1:2420084/93‑1 (MQ=255) gCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCt < 2:6321208/93‑1 (MQ=255) gCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCt < 1:3177908/93‑1 (MQ=255) cgCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACC‑C‑CC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGt < 1:4499634/92‑1 (MQ=255) aGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGt > 2:1788705/1‑93 (MQ=255) ccGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTa > 1:1996036/1‑93 (MQ=255) ggTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTAtt < 2:3997844/93‑1 (MQ=255) ggTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTAtt < 2:4900769/93‑1 (MQ=255) ggTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTAtt > 2:4984526/1‑93 (MQ=255) gTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTg > 1:5220856/1‑93 (MQ=255) aTTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgct < 1:1649970/93‑1 (MQ=255) aTTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgct < 1:2315523/93‑1 (MQ=255) ttttATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctg < 2:6299355/93‑1 (MQ=255) ttttATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctg < 1:2903860/93‑1 (MQ=255) ttttATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctg > 2:722477/1‑93 (MQ=255) aTTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggctg > 2:2108752/1‑93 (MQ=255) ttGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGt < 2:2543774/93‑1 (MQ=255) ttGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGt < 1:4927139/93‑1 (MQ=255) ttGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGt < 2:2550226/93‑1 (MQ=255) cTGGCATTTTTGCGACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCgg < 1:3752177/93‑1 (MQ=255) tGGTATTTTTGATACTGCGCGGACACAAT‑C‑T‑CCACCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTAGGt < 1:5909902/93‑1 (MQ=255) tGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGt > 2:3384596/1‑93 (MQ=255) aTTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATg < 2:5155651/93‑1 (MQ=255) aTTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATg < 1:4061761/93‑1 (MQ=255) tttttGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATgg > 2:4844314/1‑93 (MQ=255) ttttGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc < 2:4811660/93‑1 (MQ=255) tttGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCa < 2:69719/93‑1 (MQ=255) gCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 2:4367294/1‑93 (MQ=255) gCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg < 2:1571347/93‑1 (MQ=255) gCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg < 2:3881684/93‑1 (MQ=255) cTACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGt > 2:1521683/1‑93 (MQ=255) tACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTg < 1:3242764/93‑1 (MQ=255) tACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTg > 1:4095065/1‑93 (MQ=255) tACTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTg > 1:6078312/1‑93 (MQ=255) agtGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCTCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCGTATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGa < 1:2653783/91‑1 (MQ=255) cTGCGCGGACACAAT‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGAc < 2:6034300/93‑1 (MQ=255) cTGCGCGGACACAAC‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGAc < 2:5706316/93‑1 (MQ=255) cTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGAc > 1:1774970/1‑93 (MQ=255) cTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGAc < 1:3372401/93‑1 (MQ=255) cTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTACTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGAc < 1:5713281/93‑1 (MQ=255) cTGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAAGCCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATggggcg > 2:3189949/1‑89 (MQ=255) tGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACg > 2:1168451/1‑93 (MQ=255) tGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACg > 2:5748010/1‑93 (MQ=255) tGCGCGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACg > 2:1915693/1‑93 (MQ=255) gcgcGGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACgg < 2:3580070/93‑1 (MQ=255) cgcgGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGt < 1:5395512/93‑1 (MQ=255) gcgGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGtt > 1:6241452/1‑93 (MQ=255) gcgGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGtt > 2:4117638/1‑93 (MQ=255) gcgGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGtt < 1:3931154/93‑1 (MQ=255) ccgGACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGtt < 1:1430057/92‑1 (MQ=255) ggACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGc > 2:5653157/1‑93 (MQ=255) gACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTTCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGCGACGGTTGcc > 2:3786656/1‑93 (MQ=255) gACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGcc > 2:1102377/1‑93 (MQ=255) gACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGcc > 1:6432005/1‑93 (MQ=255) gACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGcc < 1:1677762/93‑1 (MQ=255) gACACAAA‑C‑TCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGGTGcc > 2:2232637/1‑93 (MQ=255) cacaAA‑C‑CCCC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGa < 2:4755142/93‑1 (MQ=255) | GGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAA‑C‑T‑CC‑CCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACA > NC_000913/2027653‑2027832 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |