| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,896,819 | +C | coding (622/657 nt) | ygcU ← | putative oxidoreductase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,896,818 | 1 | . | C | 99.2% | 895.4 / ‑1.7 | 257 | coding (623/657 nt) | ygcU | putative oxidoreductase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base C (149/106); total (150/107) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
TCCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑C‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTT > NC_000913/2896726‑2896905 | tCCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTg < 1:4804644/93‑1 (MQ=255)tCCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTg < 1:2739292/93‑1 (MQ=255) ccAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑c > 2:3773837/1‑93 (MQ=255) ccAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑c < 2:2734839/93‑1 (MQ=255) ccAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑c < 1:2502780/93‑1 (MQ=255) cAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑cc < 2:2162589/93‑2 (MQ=255) aGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccg > 1:4203449/1‑91 (MQ=255) aGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccg > 1:2305188/1‑91 (MQ=255) ggATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccga < 2:1927678/93‑4 (MQ=255) ggATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccga > 1:1161880/1‑90 (MQ=255) ataGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑gatgat < 1:2039949/93‑1 (MQ=255) taGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑gatgatg > 2:2558755/1‑93 (MQ=255) aGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑gatgatgt > 1:5548948/1‑92 (MQ=255) aGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑gatgatga > 2:1575015/1‑93 (MQ=255) gCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑gatgatgat < 1:1925678/93‑1 (MQ=255) ccGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑Gatgatgatg < 2:1244150/93‑1 (MQ=255) ccGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑Gatgatgatg > 1:6042807/1‑93 (MQ=255) cGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGTGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGAtgt < 1:3274262/93‑1 (MQ=255) gTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGAtgtg > 2:929995/1‑93 (MQ=255) gTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGAtgtg < 2:2248836/93‑1 (MQ=255) gTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGAtgtg < 2:5752315/93‑1 (MQ=255) tAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGa > 1:6248249/1‑93 (MQ=255) gaagaGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACg > 1:1860479/1‑93 (MQ=255) gaagaGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACg > 2:237546/1‑93 (MQ=255) agagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGaa > 1:3819457/1‑93 (MQ=255) agagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGaa < 1:81334/93‑1 (MQ=255) agagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGaa > 1:4673736/1‑93 (MQ=255) gagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAAt > 2:4752440/1‑93 (MQ=255) ggTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCTCAATGCACCTTCGTTG‑CTGATGATGATGTGACGAATgc > 2:6471358/1‑92 (MQ=255) ggTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGt > 1:3469991/1‑93 (MQ=255) gttgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTc > 2:174031/1‑93 (MQ=255) gttgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTc < 2:6161399/93‑1 (MQ=255) ttgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTcc < 2:1854032/93‑1 (MQ=255) tgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCg < 1:3004828/93‑1 (MQ=255) gttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCgg > 1:5318524/1‑93 (MQ=255) ttCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGcc < 2:1499536/93‑1 (MQ=255) cGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGc > 1:5439932/1‑93 (MQ=255) cGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGc < 1:1810483/93‑1 (MQ=255) gggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcg > 1:907416/1‑93 (MQ=255) ggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgc > 2:840754/1‑93 (MQ=255) aaTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGTTGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcgg < 2:2328270/93‑1 (MQ=255) aaTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcgg < 2:520896/93‑1 (MQ=255) aaTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcgg > 1:4017758/1‑93 (MQ=255) aaTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcgg > 2:3692668/1‑93 (MQ=255) aaTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcgg > 2:5694621/1‑93 (MQ=255) aTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGTCGCgcggc < 1:6308918/93‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggc < 1:4130823/93‑1 (MQ=255) tttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggcg > 2:4483463/1‑93 (MQ=255) ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggcgg > 1:1710128/1‑92 (MQ=255) ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGt < 1:2413123/93‑1 (MQ=255) tAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTg > 2:6287783/1‑93 (MQ=255) aaGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGc < 2:3057569/93‑1 (MQ=255) aaGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGc > 2:3623980/1‑93 (MQ=255) aaGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGc > 1:3558517/1‑93 (MQ=255) aaGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGc > 1:3345014/1‑93 (MQ=255) aGATTTTCACTGGTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCa > 2:3463945/1‑93 (MQ=255) gATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCAc > 1:4861199/1‑93 (MQ=255) gATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCAc > 1:520689/1‑93 (MQ=255) aTTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACg > 1:1987355/1‑93 (MQ=255) ttttCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGt > 2:4616056/1‑93 (MQ=255) tttCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGtt > 1:437170/1‑93 (MQ=255) ttCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGttt < 2:5098991/93‑1 (MQ=255) cACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGttttt > 2:5035019/1‑93 (MQ=255) aCTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTa > 2:2812203/1‑93 (MQ=255) cTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTaa < 2:1815034/93‑1 (MQ=255) gTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATg < 2:6223056/93‑1 (MQ=255) gTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATg > 1:5838383/1‑93 (MQ=255) gTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATg < 1:3944086/93‑1 (MQ=255) ttACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGc > 1:1525780/1‑93 (MQ=255) ttACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGc < 2:3185643/93‑1 (MQ=255) tACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCg < 2:3922125/93‑1 (MQ=255) tACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCg > 2:4020373/1‑93 (MQ=255) tACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCg > 2:1090375/1‑93 (MQ=255) aCTTCATTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgt < 1:1282490/93‑1 (MQ=255) aCTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgt > 1:3405314/1‑93 (MQ=255) aCTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgg > 1:5827180/1‑92 (MQ=255) cTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtg < 1:5961860/93‑1 (MQ=255) tCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGtgtg > 2:6093986/1‑93 (MQ=255) aGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGAc > 2:3413614/1‑93 (MQ=255) gATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGt < 2:3514189/93‑1 (MQ=255) atatAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTg > 2:5497866/1‑93 (MQ=255) ataGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGcc > 1:663598/1‑93 (MQ=255) ataGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGcc < 2:249098/93‑1 (MQ=255) ataGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGcc > 2:4892204/1‑93 (MQ=255) taGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCa > 2:3587571/1‑93 (MQ=255) aGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCAt > 1:2709488/1‑93 (MQ=255) aGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCAt > 1:2181084/1‑93 (MQ=255) cacaATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCa > 2:5269890/1‑93 (MQ=255) acaATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAg < 1:5081820/93‑1 (MQ=255) aaTGCGCCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGcc < 1:4434820/93‑1 (MQ=255) aaTGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCTATCAGcc > 2:4356505/1‑93 (MQ=255) aTGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCa < 1:3856753/93‑1 (MQ=255) aTGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCa < 2:2002713/93‑1 (MQ=255) cACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATa > 2:4125016/1‑93 (MQ=255) cccTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAc < 1:6407610/92‑1 (MQ=255) cTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTg > 1:1020688/1‑93 (MQ=255) ttCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGc > 2:5616990/1‑93 (MQ=255) ttCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGc > 1:2215338/1‑93 (MQ=255) ttCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGc > 1:5660278/1‑93 (MQ=255) cGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCtt > 2:2410700/1‑93 (MQ=255) | TCCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑C‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTT > NC_000913/2896726‑2896905 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |