Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,957,124 | +G | intergenic (+58/+26) | ilvC → / ← ppiC | ketol‑acid reductoisomerase/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,957,123 | 1 | . | G | 98.9% | 561.0 / ‑0.8 | 183 | intergenic (+57/+27) | ilvC/ppiC | ketol‑acid reductoisomerase/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/0); new base G (50/131); total (52/131) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.96e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 |
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
GACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑A‑‑CTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AA‑GCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTC > NC_000913/3957033‑3957210 | gACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑aa < 1:1013524/93‑1 (MQ=21) gACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑aa < 1:1783949/93‑1 (MQ=21) aCAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AA‑g < 2:622719/93‑1 (MQ=21) cAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AA‑gg > 2:3191891/1‑92 (MQ=21) cAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AA‑gg < 1:2237195/93‑2 (MQ=21) cAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCACG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AA‑gg < 2:4658949/93‑2 (MQ=21) atatGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AA‑ggcct < 2:1523584/93‑5 (MQ=21) gAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTtctc < 2:1923959/93‑1 (MQ=18) aagcGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTcc < 1:3253288/90‑1 (MQ=18) aaaCGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCCCCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTcc < 2:2000249/93‑1 (MQ=18) aaaCGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTtctca < 1:2069487/93‑2 (MQ=18) aCGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTg < 1:2586138/93‑1 (MQ=18) gTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGga < 1:4455735/93‑1 (MQ=18) gTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGga < 1:3093559/93‑1 (MQ=18) ttGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCC‑‑ACCCCCTCCCCCCGGGGGGGGGGGGAAAA‑ACCCAAA‑GCCTTCTCCTCGAGaa > 1:1952279/1‑93 (MQ=12) gTTGCGGTTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑CCTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCt < 1:3432653/93‑1 (MQ=17) gTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCt < 1:4627217/93‑1 (MQ=18) gTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCC‑‑ACCCTCTCCCCCCGGGGGAGGGGGGAAACAACCC‑AA‑GCCTTCTCCTCGAGAAGGCCt > 2:6379163/1‑93 (MQ=16) tGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTg < 2:2910210/93‑1 (MQ=18) cGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCt < 2:2130620/93‑1 (MQ=18) cGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCt < 1:1302114/93‑1 (MQ=18) cGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCC‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCt > 2:1003920/1‑93 (MQ=18) ggTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTAt < 2:3128559/93‑1 (MQ=18) tAAGTGCGCGCTGATGCCCTCCCCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAg < 2:5460211/93‑1 (MQ=18) aaGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGt < 1:2658925/93‑1 (MQ=18) aGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGtt < 1:2281406/93‑1 (MQ=18) aGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGtt < 1:5691133/93‑1 (MQ=18) gTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTg < 1:3979240/93‑1 (MQ=18) gcgcTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGt < 2:3741859/93‑1 (MQ=21) cgcTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTa < 2:764208/93‑1 (MQ=21) gcTGATGCCGTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTAc < 1:1044885/93‑1 (MQ=21) gcTGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTAc < 2:83492/93‑1 (MQ=21) tGATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAg < 1:908507/93‑1 (MQ=25) cgATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAg < 2:3119394/92‑1 (MQ=25) gATGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGc < 1:555552/93‑1 (MQ=25) aTGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCa < 1:1230155/93‑1 (MQ=25) aTGCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCa < 2:6324766/93‑1 (MQ=25) tGCCCTCACCCCGCCC‑‑CTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCAc < 1:3453432/93‑1 (MQ=25) gCCCTCACCCCG‑‑ACCCTCTACCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCAcc > 2:5520604/1‑93 (MQ=25) cccTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCt < 1:3684870/93‑1 (MQ=25) ccTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCtt < 2:5280271/93‑1 (MQ=25) ccTCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCtt < 2:5104223/93‑1 (MQ=25) tCACCCCG‑‑ACGCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTGGCGGTACAGCACCTTaa < 2:3182267/93‑1 (MQ=37) tCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTCAAA‑GCCTTCTCCTGGAGAAGGGCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTaa > 1:6123546/1‑93 (MQ=25) tCACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑AATC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAAGCCTTGCTATTAGTTTCGGTACAGCACCTTaa > 2:5642319/1‑93 (MQ=25) cACCCCG‑‑ACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAat < 2:2853495/93‑1 (MQ=37) gaccctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGAtgtg < 1:1824227/89‑1 (MQ=38) ccctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGat > 2:702516/3‑93 (MQ=255) cctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGata < 1:6223647/92‑1 (MQ=255) cctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGata > 1:2582342/2‑93 (MQ=255) ctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGatat < 1:6244084/93‑1 (MQ=255) ctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGatat > 1:2905703/1‑93 (MQ=255) ctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGatat > 1:5625701/1‑93 (MQ=255) tctcCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATc < 1:2769854/93‑1 (MQ=255) tcCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCg > 2:2142715/1‑93 (MQ=255) ccACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGaa < 2:324246/93‑1 (MQ=255) cacaGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAAc > 2:5312705/1‑93 (MQ=255) cacaGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAAc < 1:5541453/93‑1 (MQ=255) acaGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACt < 2:379790/93‑1 (MQ=255) acaGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACt > 1:431313/1‑93 (MQ=255) caGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTg < 1:693811/93‑1 (MQ=255) agggagagggagAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTgg > 2:4572181/1‑93 (MQ=255) agggagagggagAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTgg < 2:4154943/93‑1 (MQ=255) agggagagggagAAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTgg < 1:4982155/93‑1 (MQ=255) gggagagggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTggg < 1:1339427/93‑1 (MQ=255) gggagagggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTggg < 2:2372566/93‑1 (MQ=255) gggagagggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTggg > 1:5802113/1‑93 (MQ=255) gggagagggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTggg < 1:3164676/93‑1 (MQ=255) ggagagggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgt < 2:4895567/93‑1 (MQ=255) ggagagggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgt < 1:334185/93‑1 (MQ=255) gagagggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgtg < 1:1438588/93‑1 (MQ=255) gagggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGtgtg > 1:3111704/1‑93 (MQ=255) gagggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGtgtg > 2:438591/1‑93 (MQ=255) gagggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGtgtg > 1:5119969/1‑93 (MQ=255) agggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGc < 2:1765105/93‑1 (MQ=255) gggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATCTCCGAACTGGGTGTGCa > 2:2699521/1‑93 (MQ=255) gggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCa < 2:6278330/93‑1 (MQ=255) ggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAg < 2:3673147/93‑1 (MQ=255) ggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAg < 2:5712953/93‑1 (MQ=255) ggagaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAg > 2:3928783/1‑93 (MQ=255) agaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCg > 2:4471239/1‑93 (MQ=255) gaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCgg > 2:117353/1‑93 (MQ=255) gaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCgg < 1:4195062/93‑1 (MQ=255) gaAAAC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCgg < 1:1494056/93‑1 (MQ=255) aaaaC‑ACTC‑AAGGCCTTTTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCggg > 2:2621518/1‑93 (MQ=255) aaaaC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCggg < 1:4876554/93‑1 (MQ=255) aaaaC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCggg > 1:6086207/1‑93 (MQ=255) aaaC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGc < 2:4734772/93‑1 (MQ=255) aaaC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGc > 2:2216629/1‑93 (MQ=255) aaaC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGc < 2:6080620/93‑1 (MQ=255) aaaC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGc > 2:3865531/1‑93 (MQ=255) aaC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGcc < 2:1269961/93‑1 (MQ=255) aaC‑ACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGcc < 1:5420713/93‑1 (MQ=255) ac‑acTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACTTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGCGCCg > 2:4859304/1‑93 (MQ=255) ac‑acTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCg > 1:3887205/1‑93 (MQ=255) acTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGt < 2:591680/93‑1 (MQ=255) acTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGt > 1:5057743/1‑93 (MQ=255) acTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGt < 2:3607545/93‑1 (MQ=255) acTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGAAGCGGGCCGGt > 1:3801826/1‑93 (MQ=255) cTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTc < 2:675546/93‑1 (MQ=255) | GACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCG‑‑A‑‑CTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAAC‑ACTC‑AA‑GCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTC > NC_000913/3957033‑3957210 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |