Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,049,079 | T→C | intergenic (‑94/‑25) | ymcD ← / → b4514 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,049,079 | 0 | T | C | 99.3% | 359.7 / ‑4.7 | 145 | intergenic (‑94/‑25) | ymcD/b4514 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (67/77); total (67/78) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.33e-01 |
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
ATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGC > NC_000913/1048989‑1049142 | aTGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGccc > 2:1066812/1‑93 (MQ=255) aTGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGccc < 2:1687098/93‑1 (MQ=255) aTGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGccc < 2:2490140/93‑1 (MQ=255) tGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGcccc > 2:1208917/1‑93 (MQ=255) tGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGcccc > 2:5231258/1‑93 (MQ=255) tGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGcccc > 2:2474539/1‑93 (MQ=255) ggACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcct < 1:6009911/93‑1 (MQ=255) ggACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcct < 2:2835245/93‑1 (MQ=255) gACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcctc < 2:3024616/93‑1 (MQ=255) gcAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcctcc < 1:2012322/92‑1 (MQ=255) aCAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcctcc < 2:459049/93‑1 (MQ=255) aCAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcctcc < 2:3343322/93‑1 (MQ=255) aCAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcctcc < 2:3127260/93‑1 (MQ=255) cAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCcctcct < 2:3929690/93‑1 (MQ=255) aaTACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTg > 1:2229709/1‑93 (MQ=255) aaTACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTg > 2:1665726/1‑93 (MQ=255) aTACGGGTGATGCTGCCAGCTTCCTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGt < 1:6190877/93‑1 (MQ=255) aTACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGt > 2:5160180/1‑93 (MQ=255) tACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGtt < 1:1488817/93‑1 (MQ=255) cGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCa < 1:3834882/93‑1 (MQ=25) cGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCa < 1:107749/93‑1 (MQ=21) gggAGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTATTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAg > 1:2515084/1‑93 (MQ=255) ggTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGc < 1:6213005/93‑1 (MQ=18) ggTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGc > 1:4714654/1‑93 (MQ=18) gTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCt > 1:5932353/1‑93 (MQ=18) gTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCt > 1:2988998/1‑93 (MQ=18) gATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTAc > 1:365886/1‑93 (MQ=18) gATGCTGCCAAATTACTGATTTCGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATTAGCTGCGCCTTCTGTTCAGCTAc > 1:365887/1‑93 (MQ=11) aTGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACt > 1:5844838/1‑93 (MQ=18) aTGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACt > 1:2554093/1‑93 (MQ=18) tgctgcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTg < 1:37988/93‑1 (MQ=18) tgctgcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTg < 2:5898250/93‑1 (MQ=18) gctgcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGa > 1:1809428/1‑93 (MQ=18) gctgcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGa > 1:6255175/1‑93 (MQ=18) tgcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACg < 2:5089542/93‑1 (MQ=18) tgcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGCTCTCCAGTGGCTTATGTTTCTATCAGCTGCACCTCCTGTTCAGCTCCTGACg > 1:6454924/1‑93 (MQ=11) gcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACgg > 1:765624/1‑93 (MQ=18) gcCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACgg < 2:4097250/93‑1 (MQ=18) ccAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACggg < 2:4101237/93‑1 (MQ=18) cANCTTNCTGATTTAGTGTATNNTGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACgggg < 2:2798332/93‑1 (MQ=255) cAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACgggg < 1:5391466/93‑1 (MQ=18) aaCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACcgggg > 1:5931023/1‑92 (MQ=255) aaCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggt > 1:6284273/1‑93 (MQ=18) aaCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggt < 2:5490742/93‑1 (MQ=18) aaCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggt < 2:3344458/93‑1 (MQ=18) aaCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggt < 2:6286981/93‑1 (MQ=18) aaCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggt > 2:363926/1‑93 (MQ=18) aCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggtg > 1:3209757/1‑93 (MQ=18) aCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggtg > 1:1298404/1‑93 (MQ=18) cTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggtgg < 1:2220226/93‑1 (MQ=18) ttACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggtggt < 1:2300858/93‑1 (MQ=18) tcaCTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGggtggt < 2:5239760/91‑1 (MQ=16) tACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGgtggtg < 1:1208339/93‑1 (MQ=18) tACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCACCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGgtggtg > 1:907722/1‑93 (MQ=16) tGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGGGCGt > 1:4486129/1‑93 (MQ=255) gATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTa > 2:917966/1‑93 (MQ=21) tttAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAAc < 1:2783032/93‑1 (MQ=18) ttAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACg < 2:5601839/93‑1 (MQ=18) tAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACgg > 1:613081/1‑93 (MQ=18) tAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACgg > 2:1328690/1‑93 (MQ=21) tAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACgg < 2:4632657/93‑1 (MQ=18) tAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGATGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACgg > 1:1536556/1‑93 (MQ=16) aGTGTATGATGGTTTTTTTGAGTTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGc < 2:5328335/93‑1 (MQ=255) gtgtATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCa > 2:4784994/1‑93 (MQ=18) gtATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCaaa < 1:5820482/93‑1 (MQ=18) gtATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCaaa > 1:2651817/1‑93 (MQ=18) tATGATGGTGTTTTTGAGTTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCaaaa < 2:2986424/93‑1 (MQ=16) tATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCaaaa < 1:3407254/93‑1 (MQ=18) tgatgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGc < 1:4136198/93‑1 (MQ=18) atgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAc > 1:2859941/1‑93 (MQ=18) atgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAc > 1:5175189/1‑93 (MQ=18) atgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGGAACGGCAAAAGCAc > 2:4410822/1‑93 (MQ=255) atgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCGTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAc < 2:1926332/93‑1 (MQ=16) tgGTTTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAcc < 1:4321716/93‑2 (MQ=17) tgGTTTTTGTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAcc < 1:4578745/93‑2 (MQ=11) tgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCCGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACt > 2:1979564/1‑93 (MQ=16) tgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACt > 1:4955162/1‑93 (MQ=18) tgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACt > 1:1499644/1‑93 (MQ=18) tgGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACt < 2:798518/93‑1 (MQ=18) ggTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATTAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGctgtg > 1:5532822/1‑89 (MQ=11) gtgtTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGc > 1:2723521/1‑93 (MQ=18) gtgtTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGc < 1:109714/93‑1 (MQ=18) gtgtTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGc < 2:3666209/93‑1 (MQ=18) gtgtTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGc > 2:4462572/1‑93 (MQ=18) tgtTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGcc < 1:779911/93‑1 (MQ=18) tgtTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGcc < 2:6139153/93‑1 (MQ=18) tgtTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGcc < 1:4622045/93‑1 (MQ=18) tttttGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCgg < 2:6287964/93‑1 (MQ=18) ttttGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGa < 2:2283522/93‑1 (MQ=18) tGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACAt > 1:5640177/1‑93 (MQ=21) gAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACTGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATc > 1:3006029/1‑93 (MQ=16) gAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTCACGGCAAAAGCACTGCCGGAAATc > 2:686904/1‑93 (MQ=255) gAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATc > 1:4530596/1‑93 (MQ=18) gAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATc < 1:5511987/93‑1 (MQ=18) gAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATc < 1:4288264/93‑1 (MQ=18) gAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATc < 1:3437491/93‑1 (MQ=18) aGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCa > 1:1485851/1‑93 (MQ=18) ggTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAg < 1:2054317/93‑1 (MQ=18) ggTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAg < 2:100245/93‑1 (MQ=18) tctcCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAgcgc < 1:5338901/93‑1 (MQ=14) | ATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGC > NC_000913/1048989‑1049142 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |