| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,142,620 | T→C | Q179R (CAG→CGG) | hybA ← | hydrogenase‑2 small subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,142,620 | 0 | T | C | 99.6% | 844.7 / NA | 241 | Q179R (CAG→CGG) | hybA | hydrogenase‑2 small subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (125/115); minor base A (0/1); total (125/116) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
TCTTCACGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCAGTAA > NC_000913/3142530‑3142709 | tctTCACGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCgg > 1:6146265/1‑93 (MQ=255) ctTCACGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGt < 2:1158773/93‑1 (MQ=255) ctTCACGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGt < 1:2694820/93‑1 (MQ=255) ttCACGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGtt < 1:382666/93‑1 (MQ=255) ttCACGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGtt > 1:1420571/1‑93 (MQ=255) ttCACGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGtt < 2:6333786/93‑1 (MQ=255) aCGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACAGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGca > 2:2367805/1‑93 (MQ=255) cgTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGcacat > 1:3470943/1‑92 (MQ=255) gTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGc > 1:6435062/1‑93 (MQ=255) tgccGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACGGCt < 1:5003920/91‑1 (MQ=255) tACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCt < 1:3765603/93‑1 (MQ=255) tACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCt < 1:559055/93‑1 (MQ=255) tACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCt < 1:818912/93‑1 (MQ=255) tACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCt > 1:5036383/1‑93 (MQ=255) aCCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTc < 1:4615197/93‑1 (MQ=255) ccGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCg > 1:6220769/1‑93 (MQ=255) cGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGATCGTCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGc > 1:5426810/1‑93 (MQ=255) aaaTCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACt < 1:2967715/93‑1 (MQ=255) aaaTCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACt < 2:5186713/93‑1 (MQ=255) aaTCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACtt > 1:4435675/1‑93 (MQ=255) tCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTAt < 1:3059678/93‑1 (MQ=255) ccACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACTCCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTAt < 1:2090581/92‑1 (MQ=255) cACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATg > 2:805951/1‑93 (MQ=255) aCCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGc > 1:2923103/1‑93 (MQ=255) aCCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGc > 2:3777163/1‑93 (MQ=255) ccGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCa < 2:4122357/93‑1 (MQ=255) cgcgCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAg < 2:4991406/93‑1 (MQ=255) cgcgCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAg > 2:1937721/1‑93 (MQ=255) gcccgccGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAgcgc < 1:5943217/93‑1 (MQ=255) cgccgGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCAcc > 1:5525080/1‑93 (MQ=255) gccgGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCa > 1:6267891/1‑93 (MQ=255) ccgGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCaa > 2:3139686/1‑93 (MQ=255) cgGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCaaa < 1:1468908/93‑1 (MQ=255) gggCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAAc > 2:329832/1‑93 (MQ=255) ggCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACg < 1:3921638/93‑1 (MQ=255) gCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGATTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACgg < 1:4319550/93‑1 (MQ=255) cacaCTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACggg < 1:2500532/93‑1 (MQ=255) cacaCTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACggg < 2:2443340/93‑1 (MQ=255) acacTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGgt > 2:1327288/1‑93 (MQ=255) acacTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGgt < 2:6394871/93‑1 (MQ=255) acTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGgttg > 1:2418685/1‑93 (MQ=255) cTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGgttgt < 2:6428290/93‑1 (MQ=255) cTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGgttgt < 1:4907709/93‑1 (MQ=255) cTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGgttgt > 1:1533588/1‑93 (MQ=255) cTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGgttgt < 1:3294152/93‑1 (MQ=255) ttCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGgttgtt < 1:4167302/93‑1 (MQ=255) tCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGttgttg < 2:6263202/93‑1 (MQ=255) tACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTa > 2:883419/1‑93 (MQ=255) aCGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAg > 2:6032073/1‑93 (MQ=255) cGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGt < 2:6126165/93‑1 (MQ=255) cGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGGTGTTGTAGt > 1:2470520/1‑93 (MQ=255) gCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTc < 2:1626909/93‑1 (MQ=255) aGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGCTGTTGTAGTCGt > 2:2706968/1‑93 (MQ=255) aGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGCTGTTGTAGTCGt > 1:4065156/1‑93 (MQ=255) gCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTa > 2:397946/1‑93 (MQ=255) gCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTa > 1:5206131/1‑93 (MQ=255) aGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACtt > 2:4069951/1‑93 (MQ=255) aGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACtt > 1:2219203/1‑93 (MQ=255) ggTAGCCCGCCTTTATCGAGACGTTCCACCCCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTc < 1:859134/93‑1 (MQ=255) ggTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTc < 1:1003707/93‑1 (MQ=255) gTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCg > 2:5497004/1‑93 (MQ=255) aGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGc > 1:3759328/1‑93 (MQ=255) aGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGc < 2:2369250/93‑1 (MQ=255) gACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCa < 1:70951/93‑1 (MQ=255) ccGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCTGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGATGTTGTAGTCGTACTTCGGCACg > 2:3063300/1‑93 (MQ=255) cGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGt > 1:4735339/1‑93 (MQ=255) cGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGt < 2:2812466/93‑1 (MQ=255) cTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGt > 2:1293379/1‑93 (MQ=255) cTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGt < 2:3089384/93‑1 (MQ=255) cTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGt < 2:2139431/93‑1 (MQ=255) tttATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCGCAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTa < 1:1776896/93‑1 (MQ=255) tttATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTa > 1:1152199/1‑93 (MQ=255) ttATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTAc < 2:3659127/93‑1 (MQ=255) ttATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTAc < 1:3945213/93‑1 (MQ=255) ttATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTAc > 2:6016479/1‑93 (MQ=255) tATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACg > 2:3232215/1‑93 (MQ=255) tCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGa > 2:5922389/1‑93 (MQ=255) cGAGACGTTCCACTGCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGTTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGAc < 2:2066091/93‑1 (MQ=255) cGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGAc < 1:6335367/93‑1 (MQ=255) gaCGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAgg < 2:3529359/93‑1 (MQ=255) gaCGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAgg > 1:932211/1‑93 (MQ=255) aCGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGc < 1:57877/93‑1 (MQ=255) aCGTGCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGc < 1:124435/93‑1 (MQ=255) ttCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGAc < 1:5401570/93‑1 (MQ=255) ttCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGAc > 2:536151/1‑93 (MQ=255) ttCCACACCTGTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGAc < 2:1490998/93‑1 (MQ=255) ccACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCa > 1:2397539/1‑93 (MQ=255) ccACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCa > 2:1425453/1‑93 (MQ=255) cacaCCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCAt < 1:6370406/93‑1 (MQ=255) ccacCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATg < 1:3376382/92‑1 (MQ=255) acacCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGCCCATg > 1:571931/1‑93 (MQ=255) acacCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATg < 1:106555/93‑1 (MQ=255) acacCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATg > 1:2744859/1‑93 (MQ=255) cacCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGc < 2:4864229/93‑1 (MQ=255) cacCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGc < 1:5250599/93‑1 (MQ=255) cacCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGc < 1:1837636/93‑1 (MQ=255) acCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCa > 2:558869/1‑93 (MQ=255) acCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCa < 2:4615834/93‑1 (MQ=255) acCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCa > 2:2450198/1‑93 (MQ=255) tttCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCAGTa < 1:2548247/93‑1 (MQ=255) | TCTTCACGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCAGTAA > NC_000913/3142530‑3142709 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |