BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_000913	3,743,457	T→C	V342A (GTA→GCA)	yiaN →	putative membrane protein

Read alignment evidence...
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*	NC_000913	3,743,457	0	T	C	100.0%	801.4 / NA	229	V342A (GTA→GCA)	yiaN	putative membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (95/134); total (95/134)

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CGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGTATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACAC  >  NC_000913/3743367‑3743546

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 gcgTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCAtt                                                                                        >  2:2753099/1‑93 (MQ=255)

  cgTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTGCCCCGGCATTa                                                                                       <  2:1784024/93‑1 (MQ=255)

  cgTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTa                                                                                       >  1:1082139/1‑93 (MQ=255)

  cgTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTa                                                                                       >  2:2984187/1‑93 (MQ=255)

   gTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTAGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTaa                                                                                      >  2:2559726/1‑93 (MQ=255)

    tCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAAt                                                                                     >  1:4862246/1‑93 (MQ=255)

     ctgctgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATg                                                                                    <  1:210595/93‑1 (MQ=255)

       gctgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGcc                                                                                  <  1:1550803/93‑1 (MQ=255)

        ctgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCt                                                                                 >  1:1649467/1‑93 (MQ=255)

         tgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCtt                                                                                >  1:5319956/1‑93 (MQ=255)

         tgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCtt                                                                                <  2:6345618/93‑1 (MQ=255)

         tgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCtt                                                                                <  2:3057539/93‑1 (MQ=255)

          gTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCttt                                                                               <  1:5861955/93‑1 (MQ=255)

          gTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCttt                                                                               >  1:6140948/1‑93 (MQ=255)

           tttATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTa                                                                              <  2:1599192/93‑1 (MQ=255)

           tttATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTa                                                                              >  1:377120/1‑93 (MQ=255)

           tttATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTa                                                                              <  1:4745343/93‑1 (MQ=255)

           tttATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTa                                                                              <  2:5531590/93‑1 (MQ=255)

            ttATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGAAGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAg                                                                             >  1:904346/1‑93 (MQ=255)

              aTCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGtt                                                                           >  1:1226252/1‑93 (MQ=255)

              aTCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGtt                                                                           >  2:5979991/1‑93 (MQ=255)

              aTCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGtt                                                                           >  1:2327087/1‑93 (MQ=255)

              aTCGTCATAATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCAACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGtt                                                                           <  1:4118290/93‑1 (MQ=255)

               tCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTa                                                                          <  1:3874482/93‑1 (MQ=255)

               tCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTa                                                                          <  1:4174854/93‑1 (MQ=255)

                 gTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTaaa                                                                        >  2:4555688/1‑93 (MQ=255)

                 gTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTaaa                                                                        >  2:4835764/1‑93 (MQ=255)

                    aTTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAagag                                                                     <  1:565701/93‑1 (MQ=255)

                     ttATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAgg                                                                    <  2:1478921/93‑1 (MQ=255)

                      tATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGc                                                                   <  2:3954109/93‑1 (MQ=255)

                       aTGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCa                                                                  >  2:1657701/1‑93 (MQ=255)

                       aTGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCa                                                                  <  2:6294697/93‑1 (MQ=255)

                        tggtggCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAg                                                                 <  2:2649391/93‑1 (MQ=255)

                            ggCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGact                                                             >  2:4246057/1‑91 (MQ=255)

                            ggCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAAt                                                             <  2:3215873/93‑1 (MQ=255)

                             gCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATc                                                            >  1:733660/1‑93 (MQ=255)

                              cTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCg                                                           <  2:1911166/93‑1 (MQ=255)

                               tATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGa                                                          >  2:1526422/1‑93 (MQ=255)

                                aTCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGAt                                                         >  1:1109522/1‑93 (MQ=255)

                                aTCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGAt                                                         >  1:2792017/1‑93 (MQ=255)

                                 tCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATc                                                        <  1:655554/93‑1 (MQ=255)

                                  ccTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATcc                                                       <  2:5353900/93‑1 (MQ=255)

                                    tGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGa                                                     <  1:1838555/93‑1 (MQ=255)

                                    tGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGa                                                     >  1:3703153/1‑93 (MQ=255)

                                    tGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGa                                                     >  2:3596635/1‑93 (MQ=255)

                                    tGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGa                                                     >  1:1395463/1‑93 (MQ=255)

                                     gATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGat                                                    <  2:1838047/93‑1 (MQ=255)

                                     gATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGat                                                    <  2:2435452/93‑1 (MQ=255)

                                     gATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGat                                                    <  2:6063110/93‑1 (MQ=255)

                                       ttGTCGGCATGGTCATGGATTTAAAGCAGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATAGATCCgggtt                                                  >  1:4632733/1‑89 (MQ=255)

                                       ttGTCGGCATGGTCATGCATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGattt                                                  <  2:2346790/93‑1 (MQ=255)

                                        tGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGattta                                                 <  2:5205089/93‑1 (MQ=255)

                                         gTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGatttat                                                <  2:5100317/93‑1 (MQ=255)

                                          tCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGatttatt                                               >  2:4190812/1‑93 (MQ=255)

                                          tCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGatttatt                                               <  1:5926382/93‑1 (MQ=255)

                                            ggCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTc                                             >  2:4492251/1‑93 (MQ=255)

                                            ggCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTc                                             <  1:820286/93‑1 (MQ=255)

                                             gCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCg                                            >  2:4054372/1‑93 (MQ=255)

                                             gCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCg                                            <  2:5307173/93‑1 (MQ=255)

                                             gCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCg                                            <  2:4896533/93‑1 (MQ=255)

                                              cATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCgg                                           <  1:5554272/93‑1 (MQ=255)

                                                  gTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTc                                       <  2:3798896/93‑1 (MQ=255)

                                                    cATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCAt                                     <  2:930540/93‑1 (MQ=255)

                                                    cATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCAt                                     >  1:4480630/1‑93 (MQ=255)

                                                     aTGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATg                                    >  2:3144764/1‑93 (MQ=255)

                                                      tGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGt                                   >  1:1765453/1‑93 (MQ=255)

                                                      tGGATATAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGt                                   <  2:2940759/93‑1 (MQ=255)

                                                       ggATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGtt                                  <  1:4306150/93‑1 (MQ=255)

                                                        gATTTAACGCCGGCGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGttt                                 >  1:5152099/1‑93 (MQ=255)

                                                        gATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGttt                                 >  2:1160582/1‑93 (MQ=255)

                                                         aTTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTa                                <  2:5612956/93‑1 (MQ=255)

                                                         aTTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTa                                <  2:2167467/93‑1 (MQ=255)

                                                             aaCGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCAt                            <  2:1239635/93‑1 (MQ=255)

                                                              aCGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCAtt                           >  1:1877184/1‑93 (MQ=255)

                                                                 ccGACGTTATTAATACTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAAc                        <  1:5897255/93‑1 (MQ=255)

                                                                   gACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTg                      >  2:4693940/1‑93 (MQ=255)

                                                                    aCGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGc                     >  1:2535131/1‑93 (MQ=255)

                                                                    aCGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGc                     <  1:3286834/93‑1 (MQ=255)

                                                                        tATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCaa                 <  2:971146/93‑1 (MQ=255)

                                                                        tATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCaa                 <  2:5253856/93‑1 (MQ=255)

                                                                         aTTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAAt                <  1:2073660/93‑1 (MQ=255)

                                                                         aTTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAAt                <  1:4085291/93‑1 (MQ=255)

                                                                          ttAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATc               >  2:961054/1‑93 (MQ=255)

                                                                          ttAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATc               <  2:6380920/93‑1 (MQ=255)

                                                                          ttAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATc               <  1:3495575/93‑1 (MQ=255)

                                                                           tAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCg              <  2:2948892/93‑1 (MQ=255)

                                                                           tAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACCGCTCAATCg              <  2:4918655/93‑1 (MQ=255)

                                                                             aTTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATTGGc            >  1:1156687/1‑93 (MQ=255)

                                                                             aTTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGc            <  1:2688611/93‑1 (MQ=255)

                                                                             aTTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGc            <  2:3638088/93‑1 (MQ=255)

                                                                              ttCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCt           <  2:5673325/93‑1 (MQ=255)

                                                                                 ttACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTaa        >  2:5040079/1‑93 (MQ=255)

                                                                                 ttACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTaa        <  1:3225355/93‑1 (MQ=255)

                                                                                  tACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAAt       <  2:4515368/93‑1 (MQ=255)

                                                                                   aCCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAAtt      >  2:64082/1‑93 (MQ=255)

                                                                                    ccccGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTa     >  1:5105471/1‑93 (MQ=255)

                                                                                     cccGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTac    >  2:1126537/1‑93 (MQ=255)

                                                                                     cccGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTac    >  1:6354861/1‑93 (MQ=255)

                                                                                       cGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTacac  <  2:3479411/93‑1 (MQ=255)

CGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGTATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACAC  >  NC_000913/3743367‑3743546

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 22 ≤` `ATCG/ATCG` `< 29 ≤` `ATCG/ATCG` `< 34 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`