Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 502,653 | C→T | intergenic (‑191/+47) | ybaL ← / ← fsr | putative transport protein/fosmidomycin resistance protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 502,653 | 0 | C | T | 99.6% | 835.3 / NA | 220 | intergenic (‑191/+47) | ybaL/fsr | putative transport protein/fosmidomycin resistance protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (112/107); minor base G (1/0); total (113/107) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
ATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGCGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATC > NC_000913/502563‑502742 | attattGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAGAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGa > 1:5576021/1‑93 (MQ=255) attattGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGa > 1:1179183/1‑93 (MQ=255) attattGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGa > 1:4876309/1‑93 (MQ=255) ttattGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGAc < 1:4109940/93‑1 (MQ=255) ttattGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGAc < 2:2630177/93‑1 (MQ=255) tGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTa > 2:3300655/1‑93 (MQ=255) aaTTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTaaa > 2:1274178/1‑93 (MQ=255) aTTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTaaaa > 1:1744015/1‑93 (MQ=255) aTTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTaaaa < 2:3883031/93‑1 (MQ=255) aTTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTaaaa < 1:6404231/93‑1 (MQ=255) aTTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTaaaa > 1:2656403/1‑93 (MQ=255) aTTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTaaaa > 1:770040/1‑93 (MQ=255) tttGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACg < 2:582518/93‑1 (MQ=255) ttGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGa < 2:4822316/93‑1 (MQ=255) ttGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGa < 2:6184544/93‑1 (MQ=255) ttGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGa > 2:4307176/1‑93 (MQ=255) tGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGAt < 1:5862323/93‑1 (MQ=255) gCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATg < 1:2590567/93‑1 (MQ=255) aGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCa > 2:2221868/1‑93 (MQ=255) aGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCa < 1:3132816/93‑1 (MQ=255) aGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCa > 2:4759117/1‑93 (MQ=255) aGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCa < 1:4236172/93‑1 (MQ=255) gAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGTTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAg < 1:704316/93‑1 (MQ=255) gAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAg < 2:286523/93‑1 (MQ=255) aaaaTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGcc < 2:5739123/93‑1 (MQ=255) aaTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCaa > 1:520647/1‑93 (MQ=255) aaTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCaa > 2:786763/1‑93 (MQ=255) tGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAg > 2:4556568/1‑93 (MQ=255) aaTTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGttt > 1:3180987/1‑93 (MQ=255) tAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGcc > 1:4634322/1‑93 (MQ=255) aGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCt < 2:2035937/93‑1 (MQ=255) aGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCt > 1:197466/1‑93 (MQ=255) aGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCt < 2:5067008/93‑1 (MQ=255) gCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCtt < 2:1234910/93‑1 (MQ=255) cTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCttt < 1:1032609/93‑1 (MQ=255) tGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTg > 2:2264667/1‑93 (MQ=255) gCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTgg > 2:6390536/1‑93 (MQ=255) gCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTgg < 2:258821/93‑1 (MQ=255) cAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGc > 1:4078085/1‑93 (MQ=255) aaaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCt < 1:4474107/93‑1 (MQ=255) aaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTg > 2:6230312/1‑93 (MQ=255) aaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTg > 2:2170246/1‑93 (MQ=255) aaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCa > 2:4892055/1‑93 (MQ=255) aaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCa > 1:1285995/1‑93 (MQ=255) aaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCa > 2:2353381/1‑93 (MQ=255) aaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCaa > 2:6428077/1‑93 (MQ=255) aaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAAt < 2:5902943/93‑1 (MQ=255) aaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAAt > 2:3989601/1‑93 (MQ=255) aaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAAt > 2:2420051/1‑93 (MQ=255) aGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATg < 1:4885847/93‑1 (MQ=255) gCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGGGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGa > 1:1913419/1‑93 (MQ=255) cACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGaa > 2:5361853/1‑93 (MQ=255) aCGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGaaa > 2:3952941/1‑93 (MQ=255) aCGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGaaa > 2:3272120/1‑93 (MQ=255) ggATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATc < 1:4434318/93‑1 (MQ=255) gATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCa < 1:3960363/93‑1 (MQ=255) gATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCa < 1:2923878/93‑1 (MQ=255) cGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTc < 2:4142907/93‑1 (MQ=255) cGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTc < 2:3709414/93‑1 (MQ=255) ggAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCt > 1:4768880/1‑93 (MQ=255) gAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCtt < 2:5444617/93‑1 (MQ=255) gAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCtt > 2:1195811/1‑93 (MQ=255) gAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCtt > 1:3784045/1‑93 (MQ=255) aaaaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCttt > 2:6331890/1‑93 (MQ=255) aaaaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCttt > 2:5935697/1‑93 (MQ=255) aaaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑a < 2:3142380/93‑1 (MQ=255) aaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑At > 2:4415018/1‑93 (MQ=255) aaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑At < 1:4979388/93‑1 (MQ=255) aaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑At > 1:61084/1‑93 (MQ=255) aCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATg > 1:330287/1‑93 (MQ=255) aCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATg > 1:344352/1‑93 (MQ=255) cAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGc > 1:6275673/1‑93 (MQ=255) aGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGcc > 1:3891700/1‑93 (MQ=255) aGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGcc < 1:5929297/93‑1 (MQ=255) aGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGcc > 1:1554391/1‑93 (MQ=255) aGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGcc > 1:1767317/1‑93 (MQ=255) aGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGcc > 1:5698611/1‑93 (MQ=255) gAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCg > 1:5777580/1‑93 (MQ=255) gAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCg > 1:2712104/1‑93 (MQ=255) aaGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCgg < 2:1142534/93‑1 (MQ=255) aGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGt < 1:5285607/93‑1 (MQ=255) aGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGt > 1:5667857/1‑93 (MQ=255) gCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTa < 2:3351585/93‑1 (MQ=255) gTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATca < 2:4446589/93‑1 (MQ=255) tttAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATcag < 2:1794621/93‑1 (MQ=255) tttAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATcag < 2:1976597/93‑1 (MQ=255) ttAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATcagg < 2:3833363/93‑1 (MQ=255) tAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATcaggc < 1:896141/93‑1 (MQ=255) aCAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATcaggcag < 1:2982401/93‑1 (MQ=255) aCAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATcaggcag > 2:5724298/1‑93 (MQ=255) agagGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATCAGGCAGGa > 1:3642094/1‑93 (MQ=255) agGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATCAGGCAGGAat > 2:3672094/1‑93 (MQ=255) gAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATCAGGCAGGAatat < 1:224833/93‑1 (MQ=255) aaGGGTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATgg < 2:5241704/93‑1 (MQ=255) aaGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATgg > 2:3552440/1‑93 (MQ=255) ggCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAACTCA‑TCTTTAATGCCGGTTACCAGGCAGGAATATgggc > 1:5512038/1‑91 (MQ=255) ttATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAAc > 1:1608411/1‑93 (MQ=255) ttATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAAc < 1:2089675/93‑1 (MQ=255) aTGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACAt > 2:4119145/1‑93 (MQ=255) tGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCGGTCTTT‑ATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATc < 1:2848165/93‑1 (MQ=255) | ATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGCGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTT‑ATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATC > NC_000913/502563‑502742 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |