Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 536,980 | A→G | I87M (ATA→ATG) N42D (AAC→GAC) |
ybbV → ybbW → |
hypothetical protein putative transport protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 536,980 | 0 | A | G | 99.3% | 471.9 / ‑4.5 | 135 | I87M (ATA→ATG) N42D (AAC→GAC) | ybbV ybbW | hypothetical protein putative transport protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (102/32); total (102/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.44e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.28e-01 |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
GGCTATAGCGAAGATCTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATAACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCTACCTTTAGTATTATGCTGGCAATTATCCTCAGCGCCTTT > NC_000913/536890‑537069 | ggCTATAGCGAAGATCTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGAc > 2:2004081/1‑93 (MQ=255) gCTATAGCGAAGATCTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACg > 1:1148300/1‑93 (MQ=255) gCTATAGCGAAGATCTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACg > 1:531287/1‑93 (MQ=255) cTATAGCGAAGATCTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGt > 1:4881110/1‑93 (MQ=255) cTATAGCGAAGATCTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGt < 1:303390/93‑1 (MQ=255) gAAGATCTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAAt > 1:5723398/1‑93 (MQ=255) aaGATCTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAAtt > 2:4021261/1‑93 (MQ=255) aGATCTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTa > 1:1026650/1‑93 (MQ=255) gATCTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTAt < 2:2150649/93‑1 (MQ=255) gATCTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTAt > 2:3346859/1‑93 (MQ=255) gATCTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTAt > 2:3481529/1‑93 (MQ=255) aTCTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTAtg > 2:2536129/1‑93 (MQ=255) aTCTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTAtg > 2:3924919/1‑93 (MQ=255) tCTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTAtgt > 1:3437573/1‑93 (MQ=255) cTATTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTAtgtg < 2:3259777/93‑1 (MQ=255) aTTGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGAt > 1:6228727/1‑93 (MQ=255) ttGCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATg < 1:1257273/93‑1 (MQ=255) gCCGAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGt > 1:2996971/1‑93 (MQ=255) gAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTcgg > 1:5619408/1‑93 (MQ=255) gAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTcgg > 2:1462845/1‑93 (MQ=255) gAAAACGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTcgg > 1:5886960/1‑93 (MQ=255) aaaaCGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTcggc > 2:6307480/1‑93 (MQ=255) aaCGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTcggcgg > 1:1552133/1‑93 (MQ=255) aaCGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTcggcgg > 1:722420/1‑93 (MQ=255) aaCGCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTcggcgg > 2:3090958/1‑93 (MQ=255) gCAAAGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCtt > 1:5444422/1‑93 (MQ=255) aaaGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCtttt < 2:2806087/93‑1 (MQ=255) aaGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCttttt > 2:2622290/1‑93 (MQ=255) aaGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCttttt > 1:1263695/1‑93 (MQ=255) aaGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCttttt > 2:4093234/1‑93 (MQ=255) aaGCCAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCttttt > 2:1659022/1‑93 (MQ=255) ccAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTAt > 1:781134/1‑93 (MQ=255) ccAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTAt > 1:3999374/1‑93 (MQ=255) cAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTAtt > 2:2961231/1‑93 (MQ=255) cAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTAtt < 1:1626455/93‑1 (MQ=255) cAGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTAtt < 2:1416388/93‑1 (MQ=255) aGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTAtta > 1:4205074/1‑92 (MQ=255) aGCGGACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATtc > 2:2148283/1‑93 (MQ=255) gCGGATCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCGAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATtct < 2:3141933/93‑1 (MQ=255) ggACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCg > 1:3279174/1‑93 (MQ=255) ggACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGGTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCg > 1:2286347/1‑93 (MQ=255) gACCTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCgg > 2:4833515/1‑93 (MQ=255) ccTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCt > 2:5077719/1‑93 (MQ=255) ccTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCt > 2:5077718/1‑93 (MQ=255) ccTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCt < 2:1222606/93‑1 (MQ=255) cTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCtt > 1:1145724/1‑93 (MQ=255) cTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCtt > 2:4883138/1‑93 (MQ=255) cTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCtt > 2:409035/1‑93 (MQ=255) cTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCtt > 1:2829741/1‑93 (MQ=255) cTGGAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCtt > 1:4826632/1‑93 (MQ=255) ggAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCtttt > 2:4592486/1‑91 (MQ=255) ggAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGt > 2:3868544/1‑93 (MQ=255) ggAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGt > 1:5824274/1‑93 (MQ=255) gAAAACATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGtt > 2:1222420/1‑92 (MQ=255) aaaaCATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCt > 1:1305320/1‑93 (MQ=255) aaaCATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCTa > 1:675096/1‑93 (MQ=255) aaaCATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCTa > 2:1799488/1‑93 (MQ=255) aaaCATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCTa > 2:5785296/1‑93 (MQ=255) aaCATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCttc > 1:5059442/1‑91 (MQ=255) aaCATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCTAc > 1:4867527/1‑93 (MQ=255) aaCATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCTAc < 2:5955568/93‑1 (MQ=255) aCATTTAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCTTcc > 1:152518/1‑93 (MQ=255) 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tttAACTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCTACCttt > 1:879122/1‑93 (MQ=255) aCTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCTACCTTTAGta < 2:5731845/93‑1 (MQ=255) cTATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCTACCTTTAGtat > 1:1540929/1‑93 (MQ=255) tATTTTACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCTACCTTTAGtatt > 2:3935574/1‑93 (MQ=255) tACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCTACCTTTAGTATTATGCt > 2:3441317/1‑93 (MQ=255) tACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCTACCTTTAGTATTATGCt < 1:5591294/93‑1 (MQ=255) tACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCTACCTTTAGTATTATGCt > 2:6168313/1‑93 (MQ=255) tACCTTATGGATGGGTTCGGTTCATGACGTTCCCAATTATGTGATGGTCGGCGGCTTTTTTATTCTCGGCTTGTCTACCTTTAGTATTATGCt > 1:1844411/1‑93 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |