Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | BX571857 | 1,408,208 | G→C | 5.3% | G240A (GGT→GCT) | SAS1312 → | tryptophan synthase beta chain |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | BX571857 | 1,408,208 | 0 | G | C | 5.3% | 1157.1 / 48.9 | 281 | G240A (GGT→GCT) | SAS1312 | tryptophan synthase beta chain |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (152/114); new base C (7/8); total (159/122) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.37e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.93e-01 |
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
GTTAGAGATTTTCAGAGTGTGATTGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTCAAGGCGATGATACTGATAA > BX571857/1408111‑1408304 | tAGAGATTTTCAGAGTGTGATTGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGgtggtg < 1:865199/98‑1 (MQ=255) tAGAGATTTTCAGAGTGTGATTGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGgtggtg > 2:1553170/1‑98 (MQ=255) tAGAGATTTTCAGAGTGTGATTGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGgtggtg > 2:652662/1‑98 (MQ=255) tAGAGATTTTCAGAGTGTGATTGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGgtggtg < 1:2909636/98‑1 (MQ=255) tAGAGATTTTCAGAGTGTGATTGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGgtggtg > 2:2538033/1‑98 (MQ=255) agaTTTTCAGAGTGTGATTGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGcc > 2:1865654/1‑97 (MQ=255) aTTTTCAGAGTGTGATTGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCa < 1:970773/98‑1 (MQ=255) cAGAGTGGGATGGGTAAAGAAATAAGAGGGCGGTTGGTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGc < 2:2000016/98‑1 (MQ=255) gagTGTGATTGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCaa < 1:3254425/98‑1 (MQ=255) agTGTGATTGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAAt > 1:3212912/1‑98 (MQ=255) tgtgATTGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCg > 2:2453420/1‑98 (MQ=255) taTTGGTAAAGAAATGAAATTACAGATATTGAAGAAAGAAGGGAGAATACCGGATGCAATTGTAGAATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCATTCGGTa < 2:376137/97‑1 (MQ=255) aTTGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTAc > 2:1240002/1‑98 (MQ=255) aTTGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTAc < 1:1262682/98‑1 (MQ=255) ttGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACa > 1:2560575/1‑98 (MQ=255) ttGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACa > 1:1630504/1‑98 (MQ=255) tcgTAAAGATATAAAAGCACAGATAGTGAGTAAAGAAGGGAGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACAt < 2:1485144/96‑1 (MQ=255) tAAAGAAATAAAATCACGGATATTGGAGAGAGAAGGTCAAATACCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACAtttt < 2:49953/98‑1 (MQ=255) tAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACAtttt > 1:569079/1‑98 (MQ=255) aaGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTAt > 1:1202468/1‑98 (MQ=255) aaGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGCTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTAt < 1:790366/98‑1 (MQ=255) aGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATc > 1:1788101/1‑98 (MQ=255) gAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATcc < 1:2359914/98‑1 (MQ=255) gAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATcc > 1:3002368/1‑98 (MQ=255) gAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATcc > 2:3158699/1‑98 (MQ=255) aaaTAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCa < 1:2135358/98‑1 (MQ=255) aaaTAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCa < 1:1977475/98‑1 (MQ=255) aaTAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCAt > 1:388503/1‑98 (MQ=255) aaTAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCAt > 1:2164132/1‑98 (MQ=255) aaTAAAAGCACAGATATTGAAGAGAGAAGGTCGTCTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCAt < 2:2746080/98‑1 (MQ=255) aTAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCAtt > 1:1045714/1‑98 (MQ=255) tAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCAttt > 1:1339839/1‑98 (MQ=255) tAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGCTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCAttt < 2:1323601/98‑1 (MQ=255) tAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGCTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCAttt > 2:33607/1‑98 (MQ=255) aaaaTCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATtta > 1:1083390/1‑98 (MQ=255) aaaaTCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATtta > 2:2028665/1‑98 (MQ=255) aaaaTCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATtta < 1:2179340/98‑1 (MQ=255) aaTCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCGCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATttatt > 2:3134423/1‑98 (MQ=255) tCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTaa < 1:491707/98‑1 (MQ=255) caGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAga > 2:2331500/1‑98 (MQ=255) caGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAga > 2:3080935/1‑98 (MQ=255) caGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAga > 1:2810292/1‑98 (MQ=255) aGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAgat > 1:1724233/1‑98 (MQ=255) atatTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAACgatga > 2:616307/1‑98 (MQ=255) tatTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAgatgat > 1:1323713/1‑98 (MQ=255) atTGAAGAATGAAGGTCGATTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGatgatg < 2:2190470/98‑1 (MQ=255) atTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGatgatg > 2:215429/1‑98 (MQ=255) atTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGatgatg > 1:2731025/1‑98 (MQ=255) tGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGtt > 2:1890265/1‑98 (MQ=255) gaagaaAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTg < 2:456660/98‑1 (MQ=255) gaagaaAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTg < 2:2080708/98‑1 (MQ=255) agaaagaaGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCa > 2:181332/1‑98 (MQ=255) agaaagaaGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTAGCCATTTATTAAAGATGATGTTGCa < 2:3024358/98‑1 (MQ=255) gaaagaaGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCAt > 2:2387170/1‑98 (MQ=255) gaaagaaGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCAt > 2:2385401/1‑98 (MQ=255) gaaagaaGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTACCGGAGGTGGCTCAAATGCAAACGGTACATCTTATCCATTTACTAAAGATGACGTTCCAt > 2:922662/1‑98 (MQ=255) aagaagGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATta > 1:631141/1‑98 (MQ=255) aagaagGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGCTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATta < 2:1944798/98‑1 (MQ=255) agaagGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATtat < 1:2615598/98‑1 (MQ=255) agaagGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATtat > 2:716915/1‑98 (MQ=255) agaagGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATtat > 1:941015/1‑98 (MQ=255) gaagGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATtata < 1:1851398/98‑1 (MQ=255) gaagGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATtata > 2:1739751/1‑98 (MQ=255) ggTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACgg < 1:3068778/98‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGCTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACgg > 1:2266208/1‑98 (MQ=255) gTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGCTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGgt > 1:341437/1‑98 (MQ=255) tccaCTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGgtg < 2:2222975/95‑1 (MQ=255) tCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGgtg < 1:1548982/98‑1 (MQ=255) tCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGCTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGgtg < 1:209308/98‑1 (MQ=255) aCTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTg > 1:3171699/1‑98 (MQ=255) aCTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCACTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTg > 1:1484227/1‑98 (MQ=255) ttgccGGATGCGATTGTAGTGTGTATCGGTGGTGGCGCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGa < 2:874719/95‑1 (MQ=255) cTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGa > 1:660864/1‑98 (MQ=255) ttCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGaa < 1:2293176/98‑1 (MQ=255) ttCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGaa < 2:809597/98‑1 (MQ=255) ttCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGaa > 2:1037728/1‑98 (MQ=255) ttCCAGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAAAGAAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGaa < 2:1694246/98‑1 (MQ=255) tcccGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGaa < 2:85032/96‑1 (MQ=255) tCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTCTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGGGTTGAAg > 2:1185724/1‑98 (MQ=255) cGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGcc > 1:837230/1‑98 (MQ=255) aTGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCa > 1:577670/1‑98 (MQ=255) tGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAg < 2:2927273/98‑1 (MQ=255) gCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAgg < 1:294424/98‑1 (MQ=255) gCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAgg < 2:2241670/98‑1 (MQ=255) cAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGt < 2:279008/98‑1 (MQ=255) aaTTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTc > 2:1398461/1‑98 (MQ=255) aTTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTCa > 2:1387075/1‑98 (MQ=255) ttGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTCaa > 1:444593/1‑98 (MQ=255) ttGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTCaa < 1:2453383/98‑1 (MQ=255) gCATGTATCGGTGCTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTCAAGGCga > 2:517463/1‑98 (MQ=255) aTGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGATGCCGCAGGTCATGGTgatg < 2:3326202/98‑1 (MQ=255) tGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTCAAGGCgatga < 2:1649574/98‑1 (MQ=255) tATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTCAAGGCGATGATa > 1:2295797/1‑98 (MQ=255) tCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTCAAGGCGATGATACt > 2:1703549/1‑98 (MQ=255) cGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTCAAGGCGATGATACTg > 2:2949205/1‑98 (MQ=255) cGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTCAAGGCGATGATACTg > 1:2015218/1‑98 (MQ=255) tggtggCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTCAAGGCGATGATACTGATa > 1:1532222/1‑98 (MQ=255) ggtggCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTCAAGGCGATGATACTGATaa < 1:2391862/98‑1 (MQ=255) ggtggCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTCAAGGCGATGATACTGATaa < 1:1924439/98‑1 (MQ=255) ggtggCTCAAAGGCAATCGGTACGTTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTCAAGGCGATGATACTGATaa < 1:40466/98‑1 (MQ=255) | GTTAGAGATTTTCAGAGTGTGATTGGTAAAGAAATAAAATCACAGATATTGAAGAAAGAAGGTCGACTTCCGGATGCAATTGTAGCATGTATCGGTGGTGGCTCAAATGCAATCGGTACATTTTATCCATTTATTAAAGATGATGTTGCATTATACGGTGTTGAAGCCGCAGGTCAAGGCGATGATACTGATAA > BX571857/1408111‑1408304 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |