Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | BX571857 | 1,945,482 | C→G | 62.7% | K154N (AAG→AAC) | SAS1784 ← | conserved hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | BX571857 | 1,945,482 | 0 | C | G | 62.7% | 224.4 / 254.4 | 166 | K154N (AAG→AAC) | SAS1784 | conserved hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/27); new base G (54/50); total (89/77) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.31e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
TTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATCATATATATGTTGTC > BX571857/1945385‑1945579 | tttCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAc < 1:313124/98‑1 (MQ=255) ttCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACt < 2:1339607/98‑1 (MQ=255) tCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACtt < 1:890079/98‑1 (MQ=255) cAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTc > 2:2516617/1‑98 (MQ=255) cAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTc > 2:207218/1‑98 (MQ=255) aaGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCg > 2:1907744/1‑98 (MQ=255) aGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGc < 2:615913/98‑1 (MQ=255) gTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCa > 2:2082320/1‑98 (MQ=255) gTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCa < 2:2381472/98‑1 (MQ=255) gTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCa > 2:1580981/1‑98 (MQ=255) tGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAg > 1:2893667/1‑98 (MQ=255) tGATTCGATAGCATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGATCTGACTTGCTCAGACCCATTAAATTCACATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAg > 2:1605574/1‑98 (MQ=255) gATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGt < 1:2709295/98‑1 (MQ=255) ttCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTc > 1:3162627/1‑98 (MQ=255) ttCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTc > 2:1201470/1‑98 (MQ=255) ttCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTc > 1:2185629/1‑98 (MQ=255) tCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCt > 2:132847/1‑98 (MQ=255) tAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCtagta > 2:630686/1‑98 (MQ=255) aGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCtagtag > 1:614263/1‑98 (MQ=255) aGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCtagtag > 1:1870393/1‑98 (MQ=255) gTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGc > 1:319959/1‑98 (MQ=255) tatataTCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCa < 1:1744660/98‑1 (MQ=255) atatatCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCaa < 1:2372799/98‑1 (MQ=255) atatatCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCaa < 1:2538318/98‑1 (MQ=255) atatatCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCaa < 1:2310728/98‑1 (MQ=255) atatatCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCaa < 1:2517300/98‑1 (MQ=255) tatatCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAAt > 1:1530150/1‑98 (MQ=255) tatCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTg > 1:377800/1‑98 (MQ=255) atCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGc > 2:369654/1‑98 (MQ=255) atCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGc > 2:2138059/1‑98 (MQ=255) tctcGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCa > 1:916939/1‑98 (MQ=255) ctcGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCAc > 1:1006835/1‑98 (MQ=255) ctcGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCAc > 1:3268919/1‑98 (MQ=255) ctcGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCAc > 2:857354/1‑98 (MQ=255) ctcGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCAc < 2:3142996/98‑1 (MQ=255) cGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCt < 1:684959/98‑1 (MQ=255) tCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGt < 2:196718/98‑1 (MQ=255) cAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTa > 2:2555201/1‑98 (MQ=255) cAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTa > 2:807308/1‑98 (MQ=255) cAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTa < 2:2672392/98‑1 (MQ=255) aaCTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTAcc > 1:1824353/1‑98 (MQ=255) cTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTa > 2:2289301/1‑98 (MQ=255) cATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTaaa > 2:2910772/1‑98 (MQ=255) cATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTaaa > 1:1371276/1‑98 (MQ=255) cTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAAt > 2:875872/1‑98 (MQ=255) tGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATaaa < 1:1042434/98‑1 (MQ=255) tGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATaaa < 2:1671542/98‑1 (MQ=255) tCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACt > 1:3057351/1‑98 (MQ=255) tCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACt < 1:2834531/98‑1 (MQ=255) cctgacTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTg < 1:1469401/98‑1 (MQ=255) ctggcTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGt < 1:687540/98‑1 (MQ=255) gacTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTcc < 1:1399607/98‑1 (MQ=255) cTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTg < 1:3090552/98‑1 (MQ=255) cTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAg > 1:1742471/1‑98 (MQ=255) tCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAgg < 1:2963224/98‑1 (MQ=255) cAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGc > 2:2946401/1‑98 (MQ=255) gACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGt > 1:1021374/1‑98 (MQ=255) gACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGt < 1:106451/98‑1 (MQ=255) aCCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGtt > 1:2148301/1‑98 (MQ=255) ccAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTGACTTCGCAGGTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGttt < 2:301465/98‑1 (MQ=255) ccAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGttt > 2:660376/1‑98 (MQ=255) ccAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGttt > 1:2014691/1‑98 (MQ=255) cAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTa < 1:976601/98‑1 (MQ=255) cAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTa > 2:451091/1‑98 (MQ=255) aaTTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTAc < 1:822239/98‑1 (MQ=255) aTTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTAcc > 1:2762708/1‑98 (MQ=255) aTTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTAcc > 1:2817909/1‑98 (MQ=255) ttAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCa < 2:1814573/98‑1 (MQ=255) ttAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCa < 1:3256747/98‑1 (MQ=255) ttAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCATTTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCa > 2:2319381/1‑98 (MQ=255) tAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAg < 2:3119049/98‑1 (MQ=255) aaaTTCACATGAAAAGCCTTTGCTAAGATCGCAGTTCTAATAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGt < 2:898897/98‑1 (MQ=255) aaTTCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGtt < 2:1516859/98‑1 (MQ=255) ttCATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTAt > 2:2765997/1‑98 (MQ=255) ttCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTAt > 2:2602051/1‑98 (MQ=255) ttCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTAt < 1:2914114/98‑1 (MQ=255) cATATTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTAttt < 2:514146/98‑1 (MQ=255) atatTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTAtttt < 1:1647274/98‑1 (MQ=255) atatTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTAtttt < 1:1560240/98‑1 (MQ=255) atTAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCg > 2:2788849/1‑98 (MQ=255) atTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCg > 2:1830680/1‑98 (MQ=255) ttAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGa < 2:1789982/98‑1 (MQ=255) ttAAAAGCCTGTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCAGCTGTACCTAAATATAAATCTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGa < 2:1906521/98‑1 (MQ=255) tAAAAGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGaa < 1:1339937/98‑1 (MQ=255) tAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGaa < 1:749112/98‑1 (MQ=255) aaaGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATc < 1:2140968/98‑1 (MQ=255) aaaGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATc > 1:3293337/1‑98 (MQ=255) aaGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATCa > 1:2067785/1‑98 (MQ=255) aaGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATCa < 2:847830/98‑1 (MQ=255) aGCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATCat < 1:2239487/98‑1 (MQ=255) gCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATCata < 2:2635125/98‑1 (MQ=255) gCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATCata > 1:328674/1‑98 (MQ=255) gCCTTTGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATCata < 1:449687/98‑1 (MQ=255) gCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTAGCAGTTATTCTCGAATCata > 2:1149022/1‑98 (MQ=255) ttGCTAAGTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATCatatata > 2:974233/1‑98 (MQ=255) tGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATCatatatat < 1:1084458/98‑1 (MQ=255) gCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATCATATATAtg < 2:5834/98‑1 (MQ=255) aCTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATCATATATAtgttgt < 2:3196287/98‑1 (MQ=255) aCTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATCATATATAtgttgt < 2:1229256/98‑1 (MQ=255) cTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATCATATATATGTTGTc > 1:2433106/1‑98 (MQ=255) | TTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGACCTGACTTGCTCAGACCAATTAAATTCATATTAAAAGCCTTTGCTAACTTCGCAGTTCTAGTAGCAATTGCACCTGTACCTAAAAATAAAACTGTTTGTCCTGATAGGCGTTTACCAGTTATTTTCGAATCATATATATGTTGTC > BX571857/1945385‑1945579 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |