Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | BX571857 | 292,191 | G→A | 21.0% | F98F (TTC→TTT) | SAS0247 ← | putative sugar transport protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | BX571857 | 292,191 | 0 | G | A | 21.0% | 458.8 / 134.3 | 186 | F98F (TTC→TTT) | SAS0247 | putative sugar transport protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (72/74); new base A (21/18); total (93/93) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.19e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-01 |
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
AATAACGACTAAAGCTGTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATCCCCATCCTGCACCTGATAAT > BX571857/292095‑292287 | aaTAACGACTAAAGCTGTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTgg < 1:253786/97‑1 (MQ=255) tAACGACTAAAGCTGTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGaa > 1:1159290/1‑97 (MQ=255) aaCGACTAAAGCTGTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAAt < 1:690594/97‑1 (MQ=255) aaCGACTAAAGCTGTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAAt < 2:1522823/97‑1 (MQ=255) aCGACTAAAGCTGTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAATg < 2:7146/97‑1 (MQ=255) cGACTAAAGCTGTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGc < 2:116339/97‑1 (MQ=255) gACTAAAGCTGTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCt < 1:1615401/97‑1 (MQ=255) gACTAAAGCTGTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCt > 1:81914/1‑97 (MQ=255) gACTAAAGCTGTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAATGCt > 1:385093/1‑97 (MQ=255) aCTAAAGCTGTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCtg > 1:1212150/1‑97 (MQ=255) aaGCTGTAAATCCAATGATTTTATGCCCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCtgtggt < 2:1199269/97‑1 (MQ=255) gCTGTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGa > 1:2136559/1‑97 (MQ=255) gCTGTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAATGCTGTTGTGa > 2:508626/1‑97 (MQ=255) cTGTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAATGCTGTTGTGAc < 2:334372/97‑1 (MQ=255) gTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATGTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACtg < 2:1264344/97‑1 (MQ=255) gTAAATACAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAACAATTGGAATGCTGCTGTGACtc > 2:184908/1‑96 (MQ=255) tAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAATGCTGTTGTGACtgg > 2:1394627/1‑97 (MQ=255) aaaTCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACtggc < 2:1219950/97‑1 (MQ=255) tCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACtggcatg > 1:1797000/1‑97 (MQ=255) tCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACtggcatg < 1:1864188/97‑1 (MQ=255) tCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAACTGGAATGCTGGTGTGACtggcatg > 2:1951902/1‑97 (MQ=255) ccAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACtggcatgg > 1:1632887/1‑97 (MQ=255) cAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACtggcatggc < 2:1690855/97‑1 (MQ=255) cAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACtggcatggc < 2:2011405/97‑1 (MQ=255) cAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACtggcatggc > 2:1143426/1‑97 (MQ=255) aaaTGATATTATGACCAATGCCTCGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCACAAAGATGCGCCTCATAAATGGAATGCAGCTGTGACtggcatggc > 2:859227/2‑97 (MQ=255) tGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACg > 1:827333/1‑97 (MQ=255) gATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACga < 1:1385502/97‑1 (MQ=255) aTTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACgag > 2:2080477/1‑97 (MQ=255) ttATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATg > 2:2029770/1‑97 (MQ=255) ttATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATg > 2:363727/1‑97 (MQ=255) ttATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATg < 1:86757/97‑1 (MQ=255) tATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGa < 1:1922799/97‑1 (MQ=255) tATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCAGAAAGATGCGCCTAATAATGGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGa < 2:2047965/97‑1 (MQ=255) gACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGcc > 1:440033/1‑97 (MQ=255) aCCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCg < 2:1053090/97‑1 (MQ=255) aCCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCg < 1:103429/97‑1 (MQ=255) aaTGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACt < 1:1463238/97‑1 (MQ=255) tGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTaa < 1:1294028/97‑1 (MQ=255) tGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTaa < 1:656975/97‑1 (MQ=255) gCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCCAAGAATGGAAATGCTGTGGTGACTGGCATCGCACGAGAAGAGCCGACTAAt > 2:1877325/1‑97 (MQ=255) ccTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATCAGTGGACTGCCGTTGTGACTGGCATGGCCCGAGAGGAGCCGACTCAtt > 2:1733432/1‑97 (MQ=255) ccTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAATGCCTTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAAtt > 2:1527364/1‑97 (MQ=255) tGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCg < 2:1796538/97‑1 (MQ=255) tGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCg > 2:216536/1‑97 (MQ=255) tGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCg < 1:2063435/97‑1 (MQ=255) cAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACg < 1:78318/97‑1 (MQ=255) actttCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGCTGAGCCGACTCCTTCGAACGc > 1:1846071/3‑97 (MQ=255) aaTTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGc > 1:203531/1‑97 (MQ=255) tttCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCtt > 2:1858971/1‑97 (MQ=255) ttCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCttt > 2:1607047/1‑97 (MQ=255) ttCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAACGCGGTCGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCtct > 2:458939/1‑95 (MQ=255) tCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTa < 1:85205/97‑1 (MQ=255) tCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTa > 1:1512226/1‑97 (MQ=255) tCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTa < 1:2089367/97‑1 (MQ=255) tCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTa > 1:1512366/1‑97 (MQ=255) ccTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTaa > 1:169966/1‑97 (MQ=255) cTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTaaa < 1:1970670/97‑1 (MQ=255) cTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAAGAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTaaa < 1:639659/97‑1 (MQ=255) tAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAAt > 2:1761794/1‑97 (MQ=255) tAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAAt > 1:389051/1‑97 (MQ=255) aTGCAAAGACACCCCACAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGt < 2:1928918/97‑1 (MQ=255) tGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTa < 2:1947954/97‑1 (MQ=255) gCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTaa > 2:914646/1‑97 (MQ=255) cAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAAt < 1:835850/97‑1 (MQ=255) cAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAAt < 1:536566/97‑1 (MQ=255) aaaGACTCCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATg < 1:1938499/97‑1 (MQ=255) aaGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGa < 2:1181589/97‑1 (MQ=255) aaGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGa < 1:1548200/97‑1 (MQ=255) aaGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGa > 2:1435432/1‑97 (MQ=255) aGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATACTTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGAt < 2:440110/97‑1 (MQ=255) gACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGAtt > 2:614113/1‑97 (MQ=255) gACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGAtt > 2:884733/1‑97 (MQ=255) gACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGAAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGAtt > 2:1118452/1‑97 (MQ=255) acacCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGAttt < 1:1574648/97‑1 (MQ=255) cccccATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGATCGCTTTAAATGTAATGATTTGt < 2:1668790/96‑1 (MQ=255) acCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGt < 2:1060401/97‑1 (MQ=255) cccATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTcc > 1:2059293/1‑97 (MQ=255) ccATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCg > 2:772861/1‑97 (MQ=255) ccATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCg < 1:499124/97‑1 (MQ=255) aTAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGaa < 1:116641/97‑1 (MQ=255) agaGATGCGCCTAATAATTGAAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATc < 2:461271/95‑1 (MQ=255) aaGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATcc > 1:1307861/1‑97 (MQ=255) gATGCGCCTAATAATTGAAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATcccc < 1:1128783/97‑1 (MQ=255) aTGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGGTGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTACTGATTTGTCCGAATCCCCa > 1:735746/1‑97 (MQ=255) aTGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTCAATGTAATGATTTGTCCGAATCCCCa > 2:1478307/1‑97 (MQ=255) aTGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATCCCCa > 1:1044015/1‑97 (MQ=255) tGCGCCTAATAATTGAAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATCCCCAt > 2:301209/1‑97 (MQ=255) ggtgcCTATTGATGGGAATGCTGATGTGACTGGCATGGCACGAGAGGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGGTTTGTCCGAATCCCCAt < 2:1553866/94‑1 (MQ=255) gcgcCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATCCCCATc < 1:1441099/97‑1 (MQ=255) ccTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATCCCCATCCTg < 1:468736/97‑1 (MQ=255) ataatTGGAATGCTGTTGTGACTGGAATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGTCTTAAACGTAATGATTTGTCCGAATCCCCCTCCTGCaac > 2:1301031/1‑95 (MQ=255) taatTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATCCCCATCCTGCACCt > 2:667875/1‑97 (MQ=255) aatTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATCCCCATCCTGCACCTg > 2:4557/1‑97 (MQ=255) aatTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATCCCCATCCTGCACCTg > 1:1985042/1‑97 (MQ=255) atTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATCCCCATCCTGCACCTGa > 2:928378/1‑97 (MQ=255) ttGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCGCGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATCCCCATCCTGCACCTGat < 1:203911/97‑1 (MQ=255) ttGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATCCCCATCCTGCACCTGat < 1:1810800/97‑1 (MQ=255) ggAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATCCCCATCCTGCACCTGataa < 1:935292/97‑1 (MQ=255) gAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATCCCCATCCTGCACCTGataat < 1:986987/97‑1 (MQ=255) | AATAACGACTAAAGCTGTAAATCCAATGATTTTATGACCAATGCCTGGCCAATTTCCTAATGCAAAGACACCCCATAAAGATGCGCCTAATAATTGGAATGCTGTTGTGACTGGCATGGCACGAGATGAGCCGACTAATTCGAACGCTTTAAATGTAATGATTTGTCCGAATCCCCATCCTGCACCTGATAAT > BX571857/292095‑292287 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |