| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BX571857 | 1,472,392 | G→T | 5.8% | pseudogene (3325/5622 nt) | ebh ← | very large surface anchored protein (pseudogene) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BX571857 | 1,472,392 | 0 | G | T | 5.8% | 672.9 / 21.3 | 174 | pseudogene (3325/5622 nt) | ebh | very large surface anchored protein (pseudogene) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (94/69); new base T (3/8); total (97/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.27e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
TTGTTTCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTCGAT > BX571857/1472297‑1472487 | ttGTTTCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAgc > 2:336570/1‑97 (MQ=255) tCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCAtt > 2:1177451/1‑97 (MQ=255) tCGCATCTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCAtt < 2:1044620/97‑1 (MQ=255) gCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGt > 2:2190271/1‑97 (MQ=255) ttttCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTGATTTCGTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTaa < 2:139765/97‑1 (MQ=255) ttttCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTaa > 2:1767834/1‑97 (MQ=255) tttCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAAt > 1:553293/1‑97 (MQ=255) tttCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAAt < 1:166246/97‑1 (MQ=255) ttCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATg > 1:455756/1‑97 (MQ=255) ttCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATg > 2:1651909/1‑97 (MQ=255) cTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTc > 1:429149/1‑97 (MQ=255) cTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTc < 1:1240907/97‑1 (MQ=255) tttAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCg > 1:1320073/1‑97 (MQ=255) ttAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTCAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGt < 1:1384794/97‑1 (MQ=255) tAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGtt > 1:986703/1‑97 (MQ=255) tAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGtt < 2:289529/97‑1 (MQ=255) gCTTTCACTAAATCTTTGATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTAt < 2:512348/97‑1 (MQ=255) gCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTAt > 1:1982921/1‑97 (MQ=255) tttCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGa > 2:1820967/1‑97 (MQ=255) tttCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGa > 1:1202373/1‑97 (MQ=255) tttCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGa > 1:1202388/1‑97 (MQ=255) ttCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGAc < 1:1982147/97‑1 (MQ=255) tCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGAcc > 1:2284660/1‑97 (MQ=255) aCTAAATCTTTGATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCtt < 2:1961141/97‑1 (MQ=255) aCTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCtt > 2:2434853/1‑97 (MQ=255) tAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCttgt > 2:867737/1‑97 (MQ=255) aaaTCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCttgtt > 2:1333804/1‑97 (MQ=255) aaaTCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCttgtt > 2:90003/1‑97 (MQ=255) aaaTCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCttgtt > 1:1028725/1‑97 (MQ=255) aaTCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGTGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCttgttg < 2:311104/97‑1 (MQ=255) aaTCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCttgttg < 2:287478/97‑1 (MQ=255) aTCTTTGATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGa < 2:2312566/97‑1 (MQ=255) aTCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGa < 1:958640/97‑1 (MQ=255) cTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAg > 1:457610/1‑97 (MQ=255) tttAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCCGCCCCTTGTTAATGTCGTTATGACCttgttgccgt > 2:1649718/1‑93 (MQ=14) tttAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGt < 1:2307551/97‑1 (MQ=255) tAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTAt < 2:1997906/97‑1 (MQ=255) aaTTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTAtt > 1:739260/1‑97 (MQ=255) tttCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTg < 2:258933/97‑1 (MQ=39) tGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTaa < 2:2115512/97‑1 (MQ=21) tGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTaa > 2:884351/1‑97 (MQ=255) gTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAAt < 2:393635/97‑1 (MQ=255) aaTGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATAc > 2:2382853/1‑97 (MQ=255) aaTGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATAc < 2:584646/97‑1 (MQ=255) aTGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACg > 1:1498095/1‑97 (MQ=255) gCTTGTGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGAt < 1:460866/97‑1 (MQ=255) cTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATc > 1:730743/1‑97 (MQ=255) cTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATc > 1:646542/1‑97 (MQ=255) gtgcAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATg > 2:1234209/3‑64 (MQ=18) gtgcAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATg < 1:1234209/62‑1 (MQ=18) cgcAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTa > 2:2186930/1‑97 (MQ=255) aaGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGt < 2:1005227/97‑1 (MQ=255) aaGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGt < 2:1005226/97‑1 (MQ=255) aGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTg > 1:2178045/1‑97 (MQ=255) aGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTg > 2:589323/1‑97 (MQ=255) aGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTg > 1:2179585/1‑97 (MQ=255) gTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGc > 2:304273/1‑97 (MQ=255) gTTCTGCTTTGGCTTGTTCATCTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGc < 2:1295930/97‑1 (MQ=255) ttGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCt < 2:2219585/97‑1 (MQ=255) ttGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCt > 1:456532/1‑97 (MQ=40) ttGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTAGTTGAAGTATTTGATGAATACGATCTTTAAGTGCt > 2:754197/1‑97 (MQ=255) tgtgCTTTGGCTTGTTCTATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCtt < 2:740286/97‑1 (MQ=255) tgtgCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCtt < 2:1513091/97‑1 (MQ=255) tgtgCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCtt < 1:878988/97‑1 (MQ=255) gtgCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTg < 2:781156/97‑1 (MQ=255) gtgCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTg < 2:837967/97‑1 (MQ=255) gCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGtt > 2:544195/1‑97 (MQ=18) gCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGtt < 1:160322/97‑1 (MQ=255) gCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGtt > 2:1788919/1‑97 (MQ=255) gCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGtt < 2:1462279/97‑1 (MQ=255) cTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGttt < 2:1578878/97‑1 (MQ=21) cTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGttt > 2:514164/1‑97 (MQ=255) tttGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGtttt > 2:460606/1‑97 (MQ=21) ttGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGttttt < 2:1144120/97‑1 (MQ=255) ttGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGttttt > 1:2273706/1‑97 (MQ=255) tGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTc < 2:1941577/97‑1 (MQ=21) gCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCt < 1:525101/97‑1 (MQ=255) gCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCt < 1:416565/97‑1 (MQ=255) cTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCtt > 1:384282/1‑97 (MQ=255) ttGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTa > 1:1820194/1‑97 (MQ=255) ttGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTa > 1:772/1‑97 (MQ=255) tGTTCAATTTCTTCTTTAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTAt < 1:460557/97‑1 (MQ=18) tGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTAt < 1:1005435/97‑1 (MQ=255) ttCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCt > 2:723257/1‑97 (MQ=255) cAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGtttt < 1:873645/86‑1 (MQ=255) cAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGt > 2:981971/1‑97 (MQ=255) tttCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAg < 1:1771411/97‑1 (MQ=255) ttcttcTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAgc > 2:228578/1‑96 (MQ=255) ttcttcTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGa > 2:1192826/1‑97 (MQ=255) cttcttTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTaa < 1:1434863/57‑1 (MQ=255) cttcttTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTc < 1:1086505/82‑1 (MQ=255) tcttTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTg > 1:221441/1‑97 (MQ=255) tcttTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTg < 1:129918/97‑1 (MQ=255) cttTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTgg < 1:2127271/97‑1 (MQ=255) tttAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGa < 1:258770/97‑1 (MQ=255) tAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTgg < 1:1058823/94‑1 (MQ=255) cAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTCGa > 2:2252748/1‑97 (MQ=255) aGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTCGAt > 1:2026586/1‑97 (MQ=255) aGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTCGAt > 1:2322750/1‑97 (MQ=255) aGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTCGAt > 2:2044911/1‑97 (MQ=255) | TTGTTTCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTCGAT > BX571857/1472297‑1472487 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |