Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | BX571857 | 1,868,342 | G→A | 100% | G129D (GGT→GAT) | SAS1720 → | putative membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | BX571857 | 1,868,342 | 0 | G | A | 100.0% | 1114.4 / NA | 247 | G129D (GGT→GAT) | SAS1720 | putative membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (121/126); total (121/126) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
CAGTTGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGGTAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGCTAA > BX571857/1868249‑1868435 | aGTTGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATaaa > 1:2480723/1‑97 (MQ=255) ttGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaaga < 2:3659572/97‑1 (MQ=255) tGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaagaa > 1:1905513/1‑97 (MQ=255) tGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaagaa > 2:3602332/1‑97 (MQ=255) gAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaagaag < 1:732463/97‑1 (MQ=255) gAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaagaag < 1:1433624/97‑1 (MQ=255) gAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaagaag < 1:2014057/97‑1 (MQ=255) gAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaagaag < 1:3951243/97‑1 (MQ=255) aCTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGt > 1:1256171/1‑97 (MQ=255) aCTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGt < 2:4389030/97‑1 (MQ=255) cTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAACTGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGCTGTGACGAGTAAAAACAACGATAAAGAAGCGtg > 2:4555573/1‑96 (MQ=255) cTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGtt < 1:3722711/97‑1 (MQ=255) cTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGtt > 2:3649780/1‑97 (MQ=255) tATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTa < 2:662862/97‑1 (MQ=255) aTGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTaa > 1:691913/1‑97 (MQ=255) tGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATGTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAAc < 1:403266/97‑1 (MQ=255) gAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACa < 1:729318/97‑1 (MQ=255) aaaTCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACaa > 1:3323472/1‑97 (MQ=255) aaaTCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACaa < 1:2015118/97‑1 (MQ=255) aaaTCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACaa < 2:1042508/97‑1 (MQ=255) aTCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAAtt < 1:3505803/97‑1 (MQ=255) tCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTg < 1:2042709/97‑1 (MQ=255) cAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGa > 2:1786164/1‑97 (MQ=255) cAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGa < 2:1997891/97‑1 (MQ=255) cAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGa > 2:2703854/1‑97 (MQ=255) cAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGa > 2:4329520/1‑97 (MQ=255) gTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATa < 2:2914289/97‑1 (MQ=255) ttGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAg > 1:596747/1‑97 (MQ=255) tGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGt > 1:1617950/1‑97 (MQ=255) gTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTc < 1:4399901/97‑1 (MQ=255) gTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTc < 2:865742/97‑1 (MQ=255) tCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAATGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCa < 1:1624082/97‑1 (MQ=255) ccATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCaa < 2:1586054/97‑1 (MQ=255) ccATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCaa < 2:938197/97‑1 (MQ=255) ccATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCaa > 1:389828/1‑97 (MQ=255) ccATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCaa < 1:1363561/97‑1 (MQ=255) ccATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCaa > 1:2659815/1‑97 (MQ=255) cATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAAt < 1:3048862/97‑1 (MQ=255) cTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGtt < 2:482231/97‑1 (MQ=255) tATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGatt > 2:3095649/1‑97 (MQ=255) aTCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTa > 1:2142608/1‑97 (MQ=255) aTCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTa > 1:1396483/1‑97 (MQ=255) aTCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTa < 2:3944108/97‑1 (MQ=255) tCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTaa < 1:1735316/97‑1 (MQ=255) tCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTaa < 1:4526699/97‑1 (MQ=255) cgcgCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTaaa < 2:132248/97‑1 (MQ=255) cgcgCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTaaa > 1:4167315/1‑97 (MQ=255) cgcgCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTaaa > 1:2735045/1‑97 (MQ=255) gcgcCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAAc > 1:1036316/1‑97 (MQ=255) gcgcCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAAc > 1:553177/1‑97 (MQ=255) gcgcCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAAc > 2:4377248/1‑97 (MQ=255) aacaaATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGaaa < 2:3204938/97‑1 (MQ=255) aacaaATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGaaa < 2:459376/97‑1 (MQ=255) acaaATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAAt > 2:832445/1‑97 (MQ=255) caaATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATc < 2:4112450/97‑1 (MQ=255) aTGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTgg > 2:3280999/1‑97 (MQ=255) gCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTg > 2:1463373/1‑97 (MQ=255) cTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGa > 1:3800442/1‑97 (MQ=255) aaaGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATa < 2:1081971/97‑1 (MQ=255) aaGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATaa > 1:2260811/1‑97 (MQ=255) ggTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATaaaa < 2:302914/97‑1 (MQ=255) tACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACa > 2:716221/1‑97 (MQ=255) tACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACa < 1:3378435/97‑1 (MQ=255) tACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACa > 2:2203522/1‑97 (MQ=255) aCATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACAt > 1:3651044/1‑97 (MQ=255) aCATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACAt < 2:1162005/97‑1 (MQ=255) cATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACAtt > 1:3564871/1‑97 (MQ=255) aTTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCGATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACAttt < 1:2188266/97‑1 (MQ=255) tttGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTg < 2:775579/97‑1 (MQ=255) ttGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGa < 2:1719079/97‑1 (MQ=255) tGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGaa > 1:4091622/1‑97 (MQ=255) tGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGaa > 2:1963986/1‑97 (MQ=255) gTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAg > 2:670128/1‑97 (MQ=255) tGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGat > 1:2229229/1‑97 (MQ=255) cTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGataa > 1:3855819/1‑97 (MQ=255) cTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGataa < 1:1710557/97‑1 (MQ=255) gATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGataata < 1:1312368/97‑1 (MQ=255) aTGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATAc < 2:3453987/97‑1 (MQ=255) aTGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATAc < 1:495815/97‑1 (MQ=255) aTGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATAc > 2:2757991/1‑97 (MQ=255) gtgACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAg < 1:1110691/97‑1 (MQ=255) tgACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAgg > 1:2333470/1‑97 (MQ=255) gACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGc > 1:1890874/1‑97 (MQ=255) gATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCa > 1:1565263/1‑97 (MQ=255) gATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCa < 2:3730514/97‑1 (MQ=255) gATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCa < 1:2426761/97‑1 (MQ=255) gATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCa > 1:3071802/1‑97 (MQ=255) ttAAAAACAAAGATATGGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAGAACATTTGAAGCTGATAATACAGGCTCAAt < 2:1258223/97‑1 (MQ=255) tAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATg < 1:1519940/97‑1 (MQ=255) tAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATg > 1:23613/1‑97 (MQ=255) tAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATg > 2:2071100/1‑97 (MQ=255) tAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATg > 2:2485368/1‑97 (MQ=255) aaaaCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTc > 2:4289742/1‑97 (MQ=255) aaaaCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTc > 2:3304105/1‑97 (MQ=255) aaaaCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTc < 2:318497/97‑1 (MQ=255) aaaCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCt > 1:4266558/1‑97 (MQ=255) aaCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTg > 2:2350485/1‑97 (MQ=255) aCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGc > 2:4172444/1‑97 (MQ=255) aCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATCTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGc > 2:3743782/1‑97 (MQ=255) cAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGCt > 1:906924/1‑97 (MQ=255) | CAGTTGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGGTAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGCTAA > BX571857/1868249‑1868435 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |