| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 1,180,490 | T→A | 5.6% | V44E (GTG→GAG) | U712_05860 → | Hypothetical Protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 1,180,490 | 0 | T | A | 5.6% | 213.3 / 3.8 | 72 | V44E (GTG→GAG) | U712_05860 | Hypothetical Protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/37); new base A (2/2); total (33/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.30e-01 | |||||||||||
GGTTAGAGATGTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAGCGGACAAAGCTTGAGTATTGTTTTGTCGTAACAGA > CP006881/1180352‑1180628 | ggTTAGAGATGTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGt < 7:209829/139‑1 (MQ=255)ggTTAGAGATGTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGt < 6:104379/139‑1 (MQ=255)ggTTAGAGATGTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGt < 5:260309/139‑1 (MQ=255)ggTTAGAGATGTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGt < 5:111327/139‑1 (MQ=255)ggTTAGAGATGTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGt < 2:263576/139‑1 (MQ=255)ggTTAGAGATGTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGt < 1:94722/139‑1 (MQ=255)ggTTAGAGATGTTATTTCTTCATGATGGGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGt < 5:208613/139‑1 (MQ=255) ttAGAGATGTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGc < 8:63829/139‑1 (MQ=255) ttAGAGATGTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGc < 4:206545/139‑1 (MQ=255) agagATGTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCg > 1:100966/1‑139 (MQ=255) agagATGTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCg > 1:38958/1‑139 (MQ=255) agagATGTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCg > 1:220294/1‑139 (MQ=255) gagaTGTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGt < 4:78095/139‑1 (MQ=255) tGTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAg > 8:286352/1‑138 (MQ=255) gTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTa > 7:103806/1‑139 (MQ=255) gTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTa > 6:316875/1‑139 (MQ=255) ttATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGt > 3:110025/1‑133 (MQ=255) ttATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGt < 4:110025/133‑1 (MQ=255) ttATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTa < 1:346164/138‑1 (MQ=255) ttATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTAc > 3:291820/1‑139 (MQ=255) tATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTa < 1:22876/137‑1 (MQ=255) tATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTa > 2:22876/1‑137 (MQ=255) tttCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTg < 1:10073/138‑1 (MQ=255) tcttcATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGttt > 1:252387/1‑139 (MQ=255) tcttcATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGtt < 2:38958/138‑1 (MQ=255) gtgGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGc < 2:95048/113‑1 (MQ=255) gtgGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGc > 1:95048/1‑113 (MQ=255) gtgGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGaa < 3:327266/139‑1 (MQ=255) tgGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGaa < 7:286352/138‑1 (MQ=255) tgGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGaa > 1:234416/1‑138 (MQ=255) tCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATTGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGa < 4:248/139‑1 (MQ=255) aaTTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGAt < 4:305409/138‑1 (MQ=255) aTTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGt < 5:96646/103‑1 (MQ=255) aTTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGt > 6:96646/1‑103 (MQ=255) aTTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGAttt > 3:186940/1‑139 (MQ=255) ttGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAg < 3:219490/105‑1 (MQ=255) ttGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAg > 4:219490/1‑105 (MQ=255) ttGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGAGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGt < 5:111681/135‑1 (MQ=255) ttGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGAGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGt < 5:106325/135‑1 (MQ=255) ttGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGAGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGt > 6:106325/1‑135 (MQ=255) ttGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGAGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGt > 6:111681/1‑135 (MQ=255) gAAGGTGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAATACGATTTGTCagag < 8:103806/138‑1 (MQ=255) gAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCagag < 2:252387/138‑1 (MQ=255) gaagaaAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCTTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAACCGATTTGTCAGAGCTTCCg > 5:30483/1‑138 (MQ=255) aaaTGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGt < 4:364574/139‑1 (MQ=255) aaaTGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGt < 7:175476/139‑1 (MQ=255) aaaTGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGt < 4:1586/139‑1 (MQ=255) aaTGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGtt < 6:372181/139‑1 (MQ=255) tGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGt < 2:152909/81‑1 (MQ=255) tGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGt > 1:152909/1‑81 (MQ=255) aaTGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAg < 2:220294/139‑1 (MQ=255) ccACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACAt < 1:86403/139‑1 (MQ=255) cACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATc < 5:316875/139‑1 (MQ=255) tttCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTAGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTCCTTGAAGACTAACATCAg > 3:281167/1‑138 (MQ=255) tCACGAATGGCGCAAGGAAGCTACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGGACATCAGaaa > 5:53381/1‑139 (MQ=255) tCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGt < 6:97906/60‑1 (MQ=255) tCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGt > 5:97906/1‑60 (MQ=255) tCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGt > 3:317154/1‑65 (MQ=255) tCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGt < 4:317154/65‑1 (MQ=255) tCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGaaa > 1:253486/1‑139 (MQ=255) cgcAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTc > 5:35777/1‑139 (MQ=255) cgcAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGACGCTGTTAAGTGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTc > 8:297486/1‑139 (MQ=255) aaGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGaa < 2:234416/139‑1 (MQ=255) aTACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATATAAAACGATTTTTCAGAGCTTCCGAAAGGATTGCTATATCACCTACAAAAGAAATCGTACATTCGAAAAAAtaa > 2:155732/1‑137 (MQ=255) aTACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGAt > 8:60357/1‑74 (MQ=255) aTACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGAt < 7:60357/74‑1 (MQ=255) aTACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCa > 7:167095/1‑139 (MQ=255) ggTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAATCGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAg < 1:261370/139‑1 (MQ=255) ggTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAg < 4:164136/139‑1 (MQ=255) ttGAGCTTTTGGATCATGTGCCGCTGTTAATGGTGCCGTCAGTACTGTATCATTACATAGAAAACGTTTTGTAAGTGCTTCCGTAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTAGATTCGAAAAAATAAagag < 4:281167/137‑1 (MQ=255) tGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCagag < 6:287779/76‑1 (MQ=255) tGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCagag > 5:287779/1‑76 (MQ=255) tGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAGCg > 6:104096/1‑138 (MQ=255) tGAGCTTTTGGATCAGGTGCAGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTTCTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGAAGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATAATGAGCg > 4:143460/1‑138 (MQ=255) aGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAGCGGAc < 4:291820/139‑1 (MQ=255) aGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAGCGGAc < 5:235846/139‑1 (MQ=255) cTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAGCGGACaa < 8:52348/139‑1 (MQ=255) ttGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAGCGGACAAAGc > 5:46523/1‑139 (MQ=255) ttGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAGCGGACAAAGc > 1:72522/1‑139 (MQ=255) tGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAGCGGACAAAGc < 5:104096/138‑1 (MQ=255) aGGTGGAGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAGCGGACAAAGCTTGAGTa < 6:263714/139‑1 (MQ=255) aGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAg < 4:268160/122‑1 (MQ=255) aGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAg > 3:268160/1‑122 (MQ=255) aGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAGCGGACAAAGCTTGAGTa < 6:46523/139‑1 (MQ=255) gTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCAGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAGCGCACAAAGCTTGAGTATTGTTTTGTCGTaa > 4:240494/1‑136 (MQ=255) tGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATc < 2:313867/75‑1 (MQ=255) tGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATc > 1:313867/1‑75 (MQ=255) tGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAGCGGACAAAGCTTGAGTATTGTTTTGTCGTAACAGa > 6:302101/1‑139 (MQ=255) tGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAGCGGACAAAGCTTGAGTATTGTTTTGTCGTAACAGa > 1:306717/1‑139 (MQ=255) | GGTTAGAGATGTTATTTCTTCATGATGTGTGGGTCAATTGGTTTGAAGGGGAAGAAAATGGCTACAATGTATGCCACTTTCACGAATGGCGCAAGGAAGATACGGTTGAGCTTTTGGATCAGGTGCCGCTGTTAAGGGTGCCGTCAGTACTGTTTCATTACATAGAAAACGATTTGTCAGAGCTTCCGAAAGGTTTGCTTGAAGACGTACATCAGAAATCGTACATTCGAAAAAATCATGAGCGGACAAAGCTTGAGTATTGTTTTGTCGTAACAGA > CP006881/1180352‑1180628 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |