| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 3,005,997 | G→T | 9.8% | intergenic (+95/‑271) | U712_15440 → / → U712_15445 | Uncharacterized protein yuaB/Ktr system potassium uptake protein A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 3,005,997 | 0 | G | T | 9.8% | 214.8 / 3.0 | 84 | intergenic (+95/‑271) | U712_15440/U712_15445 | Uncharacterized protein yuaB/Ktr system potassium uptake protein A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/43); new base T (8/2); total (38/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.83e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGCGCAGCACTCCTCCGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTAACAGCCTTGGGGTGAATCTTACT > CP006881/3005862‑3006127 | aGCGCAGCACTCCTCCGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACa < 5:213320/139‑1 (MQ=255)aGCGCAGCACTCCTCCGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACa < 3:373827/139‑1 (MQ=255) cgcAGCACTCCTCCGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAAATGACaaa < 6:185340/139‑1 (MQ=255) agcaCTCATCCTACTCAGACTTGCTGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGTTTAACTCCTGTCTTTTTTGCTTTTTACCCTAAC‑CTTTTTATCTAATCCCCTTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAACATTTAAATTTACAAaca > 8:114833/1‑138 (MQ=255) gcaCTCCTCCGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACt < 2:11693/139‑1 (MQ=255) caCTCCTCCGCCTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CGTTTTCTCGAATACCCGTTATCGT‑TTTTCG‑GGTTTTAAATTTAAATTTACAAaaaca > 2:278747/1‑137 (MQ=255) caCTCCTCCGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGAc > 1:2523/1‑131 (MQ=255) caCTCCTCCGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGAc < 2:2523/131‑1 (MQ=255) caCTCCTCCGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAacac > 3:265148/1‑137 (MQ=255) caCTCCTCCGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CGTTTTAGATTATACCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTTACAAACACt > 5:2036/1‑138 (MQ=255) ctccGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGaaa > 5:258788/1‑138 (MQ=255) ctccGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTATCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTTAATTGACAAACACTAGaaa > 2:26596/1‑138 (MQ=255) ctccGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTATCTAATCCCCGGTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACAAGaaa > 8:177260/1‑138 (MQ=255) ctccGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CGTTTTGGCTTATACCCGGTTTCTT‑TTTTCT‑GGGTTTAAATTTTAATTTACAAACACTAGaaa > 5:286310/1‑138 (MQ=255) ctccGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CGGTTTCTATAATCCCCGTTATCTG‑TTTTCT‑GGTTTATAAATTAAATTTACAAACACTAGaaa > 4:106041/1‑138 (MQ=255) ctccGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CGATTTGTCTAATCACCCGTATGTTGTTTTGT‑GTTTTAAATTTTAATTTTA‑AAACACaaaaaaa > 4:10364/1‑138 (MQ=255) ctccGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CATTTTGTGAAATACACGTTATCTT‑TTTTAT‑TGTTTAAAATTTAAATTGAAAAACAAAAGaaa > 6:285006/1‑138 (MQ=255) aCTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAg > 5:76248/1‑139 (MQ=255) ctaaGCATTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGGTTTCCCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑TGTTTAAAATTTAAATTTACAAACACTAGAAACAGGCGt < 7:114833/136‑1 (MQ=255) cTCCGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGt < 3:211526/139‑1 (MQ=255) cTCAGTCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGt < 7:264298/139‑1 (MQ=255) cTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAACAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTGTACCCTCCC‑CTTTTTATCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑TGTTTAAAATTTTAATTGACAAACACTAGAAACCGGatt < 6:288855/139‑3 (MQ=255) cAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CGGTTTCTCTAATCCCCGTGATCTT‑TTTTCT‑GGGTTTAAATTTTAATTGACAAACACTAGAATCAGGAGTa > 7:159979/1‑138 (MQ=255) gCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATATG‑TTTTAT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACAAGAAACAGGACTAAAt > 7:305620/1‑139 (MQ=255) cGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGATAACGCCTGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGa < 8:314197/139‑1 (MQ=255) cGGATGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGa < 6:223169/139‑1 (MQ=255) gCAACTAATGTAAAATACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACACTCCC‑CGTTATCTCTAATCCCCGTAATATT‑TTTTCA‑TGTTTAAAAATTAAAATGACAAACACTAAAAACAAGAATAAAATATTGAGTGtt > 8:352303/1‑139 (MQ=255) gCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTTTCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGGCAAACACTAGAAACAGGAG‑GAATTCTTGAGTGtt > 3:364485/1‑138 (MQ=255) cAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGtt < 1:98768/138‑1 (MQ=255) cAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGtt < 7:283085/138‑1 (MQ=255) tGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCa > 4:283310/1‑139 (MQ=255) tAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATa < 3:356642/139‑1 (MQ=255) aaaGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTTTGTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATa > 3:283396/1‑137 (MQ=255) aaaGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACa < 4:265148/139‑1 (MQ=255) aaaGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACa < 2:355682/139‑1 (MQ=255) aaaGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGGTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACCCTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATa > 4:175266/1‑137 (MQ=255) aaaGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTGTTTGAGAAAACCCGTGTTCAG‑TTTTGTGGGTTTAAATTTTAAATTTA‑ACACAATAAAAACAAGAGTAAAATCGTTTGTGTAGAAtttgaaac > 2:351976/1‑133 (MQ=255) aGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGt < 5:285006/139‑1 (MQ=255) aGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCAC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACACGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGt < 2:208591/139‑1 (MQ=255) gACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGtc < 7:140889/139‑1 (MQ=255) cGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACa < 5:172428/133‑1 (MQ=255) cGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTAT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACa > 6:172428/1‑133 (MQ=255) cGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACACTCCC‑CGTTTTCTCTAATCCCCGTTATCGT‑TTTTCT‑GGTTTAATATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGTGTAAATTCTTGAGTGTTGAATTTGATACAGTgtct > 7:199878/1‑139 (MQ=255) gTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTGTGTTATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGTGTAAATTCTTGAGTGTTGAATTTCATACAGTATCttt > 4:372805/1‑139 (MQ=255) gTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATGTT‑TTTTGT‑GGTTTTAATTTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTGTATTTAATACAGtctggtt > 5:227277/1‑135 (MQ=255) gTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAAAAGGAGTTAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACCTGCTCttt > 7:5293/1‑139 (MQ=255) aaCGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTa < 3:146996/138‑1 (MQ=255) aaCGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTa < 3:283310/138‑1 (MQ=255) aaCGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTa < 6:13223/138‑1 (MQ=255) ccGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCt < 6:286310/139‑1 (MQ=255) gTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCCGCTTTTTCTCTATACCCCGTAATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTTACAAAACCTAAAAACAGGTGTAATTATTTGAGTTTTAATTTTCAAACAGTATGTTTTAACGCtt > 2:44887/1‑138 (MQ=255) gTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CGTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTAATACAGTCTCTTTTACCGCTTa > 3:331006/1‑138 (MQ=255) gTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CGTTTTCTCTAATCCCCGTTATATT‑TTTTAT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTATTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTa > 1:344560/1‑138 (MQ=255) ttttCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCGCTTTTACCGCTTAATCaaa < 8:110034/138‑1 (MQ=255) cgttgaaCCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTAAATCAAACACg < 2:230581/132‑1 (MQ=255) cGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCTTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACg < 6:2036/138‑1 (MQ=255) tCCC‑CTTTTTCTATAAACCCCGATATCTT‑TTTTGA‑GGATTAAAATTTAAATTGACAAACACTACAAACAAGAGTAAATTCATGAGTGTTCAATTTGATAAAGTCTCTTTTAGCGCAGATTCAACACCGACCGCGGGAAc > 8:232835/1‑139 (MQ=255) ctctAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTgg > 1:47293/1‑139 (MQ=255) ctAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCt > 8:221967/1‑139 (MQ=255) ctAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCt < 4:43011/139‑1 (MQ=255) aTCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACCCTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGtt < 7:158453/139‑1 (MQ=255) aTCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGtt > 1:189886/1‑139 (MQ=255) aTCCCCGTTATATT‑TTTTCT‑GATTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATGATTGCGTGTTCAATATCAATATGTCTCTTTTCCCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCt < 4:298889/136‑1 (MQ=255) cGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATAAAACACGAAAGGTGGAACCAACGATTGGCTGTTttat > 1:318272/1‑138 (MQ=255) gTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTttatt > 8:45023/1‑138 (MQ=255) ttATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAATATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTGCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTaa < 8:305620/139‑1 (MQ=255) ttATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTaa < 6:76248/139‑1 (MQ=255) ttATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTaa < 1:44887/139‑1 (MQ=255) ttATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAAATGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTaa < 7:209002/139‑1 (MQ=255) tATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAACCACTAGAAACCGGAGTAAATTCTTGAGGGTTCAATTTCTTACAGGCTCTTTTACCGCATAATCAACCACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTaa < 3:106041/138‑1 (MQ=255) tttttt‑GGTTTAAAAATTAAATTGAATAAAACAAGAAATTGGTGTAAATTCTTGTGTTTTAATTTTAATACAGTCTATTTTCCCTCTAAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTAACAGCCt < 2:174128/138‑1 (MQ=255) ttttCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTAACAGCCtt > 8:96487/1‑139 (MQ=255) cT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTAACAGCCTTggg < 1:26596/138‑1 (MQ=255) ggTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTAACAGCCTTGGGGt > 8:51658/1‑138 (MQ=255) gTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTAACAGCCTTGGGGt < 3:372805/137‑1 (MQ=255) tAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTAACAGCCTTGGGGTGAATc > 3:228216/1‑139 (MQ=255) atttttAATTGAATAACACTATAAACATTATTAAATTTTTGAGTTTTCTATTTTATAATGTCTCTTTTACGGTTTAATAAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTTACTGCCTTGGGGTGAATCTTa < 2:318272/137‑1 (MQ=255) aacttAAAATGACAACCACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTAAATTTCATACTGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTAACAGCCTTGGGGTGAATCTTa < 8:199878/136‑1 (MQ=255) aaTTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGTAGTAAATTCTTGAGTGTTCATTATCATAGAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGTACGCGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTAACAGCCTTGGGGTGAATCTTa < 7:232835/139‑1 (MQ=255) aaTTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTAACAGCCTTGGGGTGAATCTTa < 8:310209/139‑1 (MQ=255) aaTTTAAATTCACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTATTACCGCTAAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTAACAGCCTTGGGGTGAATCTTa < 4:283396/139‑1 (MQ=255) tttAAATTTACAAACACAAGAAACAGGAGTAAATTCTTGCGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTCCCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTAACAGCCTTGGGGTGAATCTTACt < 4:16659/139‑1 (MQ=255) tttAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGGCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTAACAGCCTTGGGGTGAATCTTACt < 5:210033/139‑1 (MQ=255) tttAAATTGACAAACAATAGAAACCGTCTTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTAAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTAACAGCCTTGGGGTGAATCTTACt < 4:139262/139‑1 (MQ=255) | AGCGCAGCACTCCTCCGACTCAGCCTTGCGGTTGCAACTAATGTAAAAGACCGGTTAACGCCGGTCTTTTTTGCGTTTTACCCTCCC‑CTTTTTCTCTAATCCCCGTTATCTT‑TTTTCT‑GGTTTAAAATTTAAATTGACAAACACTAGAAACAGGAGTAAATTCTTGAGTGTTCAATTTCATACAGTCTCTTTTACCGCTTAATCAAACACGAACGGGGGAACCAACGATTGGCTGTTTTATTAACAGCCTTGGGGTGAATCTTACT > CP006881/3005862‑3006127 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |