| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 399691 = | 297 (1.030) | 16 (0.060) | 9/138 | NT | 6.5% | coding (1712/1713 nt) | efeU | Ferrous iron permease EfeU |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 399718 = | 206 (0.830) | intergenic (+26/+66) | efeU/tatC2 | Ferrous iron permease EfeU/Sec‑independent protein translocase protein TatCy | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CACATTAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/399791‑399691‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcctgttttttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCG > USA300TCH1516_ALE/399718‑399807 CACATTAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑G > 2:594927/1‑91CACATTAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑G < 1:4525227/91‑1CACATTAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑G > 2:578169/1‑91CACATTAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑G > 2:1977867/1‑91 ACATTAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GC > 2:4325977/1‑91 ACATTAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GC > 2:4650973/1‑91 CATTAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCC < 1:4192353/91‑1 ATTAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCT < 1:4477582/91‑1 TTAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGTCCTCG‑GCCTG > 2:4476358/1‑91 TAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCCATATAGCAACAAACAAACAGGCACTCG‑GCCTGT > 2:5100864/1‑91 TAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGT > 2:4202526/1‑91 TAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGT < 2:1705653/91‑1 TAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGT < 2:1705496/91‑1 TAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGT > 2:2672505/1‑91 TAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGT < 1:113180/91‑1 TAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGT < 1:4430663/91‑1 AACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTT > 1:1989518/1‑91 AACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTT > 1:1989292/1‑91 AACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTT < 1:1133568/91‑1 AACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTT < 2:1982810/91‑1 AACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTT < 1:4931819/91‑1 ACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTTT > 2:5527662/1‑91 ACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTTT > 2:4738999/1‑91 ACCCTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCTATATAGTATCAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTTT < 2:3734530/91‑1 CCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTTTT > 1:98797/1‑91 CCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTTTT < 1:478804/91‑1 CCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTTTT > 1:3599107/1‑91 CCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTTTT < 1:1684334/91‑1 CTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTTTTT > 1:3810380/1‑91 CTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTTTTT > 2:3907511/1‑91 TTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTTTTTT > 2:1799064/1‑91 GCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGG < 1:825229/91‑1 GTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCCGAGT‑GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAA < 1:1691092/91‑1 TATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATT < 1:3041033/91‑1 CCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCCGAGT‑GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGA < 1:1940498/91‑1 CAGGCACTCG‑GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAA > 2:2611314/1‑91 AGGCACTCG‑GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAAT > 2:1292165/1‑91 GGCACTCG‑GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATG > 2:1650782/1‑91 GGCACTCG‑GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATG > 1:620544/1‑91 GGCACTCG‑GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTAGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGATAATG > 1:1815122/1‑91 GGCACTCG‑GCCTGTTTTATTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATG > 1:5482846/1‑91 GCACTCG‑GCCTGTTTTTTTGTTTCTATTTTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGT > 2:644635/1‑91 GCACTCG‑GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGT > 1:977486/1‑91 GCACTCG‑GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGT > 1:3354991/1‑91 GCACTCG‑GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGT > 1:2326048/1‑91 CACTCG‑GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTG > 1:1714293/1‑91 ACTCG‑GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGT > 2:3063495/1‑91 ACTCG‑GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGT > 1:1896571/1‑91 CTCG‑GCCTGTTTTTTTTTTTTTTTATTTGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTTATTCGTATAAGGTTAATGTGTT > 2:2272661/1‑91 CTCG‑GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTT > 1:1570353/1‑91 GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCG < 2:303163/91‑1 GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCG < 2:303356/91‑1 GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCG < 2:3374808/91‑1 GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCG < 1:2710201/91‑1 GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCG < 1:3976059/91‑1 GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCG < 2:1473028/91‑1 GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCG < 2:144435/91‑1 GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCG < 2:5103563/91‑1 GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCG < 1:4907739/91‑1 CCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGG < 2:5005265/91‑1 CCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGG < 1:4338876/91‑1 CCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGG > 2:2063237/1‑91 CCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGG < 1:960416/91‑1 CCTGTGTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGG < 1:1748897/91‑1 CTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGT < 2:508939/91‑1 CTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGT < 2:3676473/91‑1 CTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGT > 1:1000580/1‑91 CTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGT < 2:218708/91‑1 CTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGT < 1:4143703/91‑1 CTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGT < 1:352001/91‑1 CTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGT < 1:4792878/91‑1 CTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGT > 2:2740557/1‑91 gGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTT < 2:3100877/90‑1 TGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTT < 2:3099640/91‑1 TGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTT < 1:4382262/91‑1 TGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTT < 2:3421447/91‑1 TGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTT < 2:1324775/91‑1 TGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTT < 1:1879397/91‑1 TGTTTTTTTGTTGCTATAGTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTT < 2:3512771/91‑1 GTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTT < 1:2768194/91‑1 GTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTT < 1:2507620/91‑1 TTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTG < 1:971963/91‑1 TTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTG < 1:3618592/91‑1 TTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTG < 1:2218579/91‑1 TTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGC < 1:5361623/91‑1 TTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGC < 1:1114092/91‑1 TTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGC > 2:3177982/1‑91 TTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGC < 2:2217804/91‑1 TTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCC < 2:3913640/91‑1 TTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCC < 2:4922667/91‑1 TTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCC < 1:2918612/91‑1 TTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCC < 2:5310651/91‑1 TTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCC < 2:2951593/91‑1 TTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCC < 2:5634863/91‑1 TTTTTGTTGCTATATGGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCC < 2:5536659/91‑1 TTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCT < 1:2212147/91‑1 TTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCT < 1:33303/91‑1 TTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCG < 2:2925550/91‑1 TTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCG > 1:4941621/1‑91 TTGATGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCG < 1:5244638/91‑1 CACATTAACCTTATACGAATCAATGCTGTGATTATCGTTATACTGCAATACCGAATATTTCCAATATAGCAACAAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/399791‑399691‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcctgttttttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCG > USA300TCH1516_ALE/399718‑399807 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |