New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2102579 | 220 (0.770) | 14 (0.050) | 9/146 | NT | 6.2% | intergenic (‑39/+277) | USA300HOU_RS10625/USA300HOU_RS10630 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2102583 | 220 (0.840) | intergenic (‑43/+273) | USA300HOU_RS10625/USA300HOU_RS10630 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
TTGCTTTTGGATCTTCTACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCAATACCTTGTGCTTCCG > USA300TCH1516_ALE/2102489‑2102669 | gCTTTTGGATCTTCTACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGac < 1:1258138‑M1/91‑3 (MQ=255) cTTTTGGATCTTCTACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTg > 1:27837/1‑91 (MQ=255) cTTTTGGATCTTCTACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTg > 1:220497/1‑91 (MQ=255) cTTTTGGATCTTCTACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGACATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTg < 2:4042849/91‑1 (MQ=255) ttttGGATCTTCTACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGt > 2:3123896/1‑91 (MQ=255) ttttGGATCTTCTACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTCGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGt < 1:5497223/91‑1 (MQ=255) ttGGATCTTCTACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTcc < 1:2487700‑M2/91‑3 (MQ=255) ggATCTTCTACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTcccc < 2:1696577‑M2/91‑5 (MQ=255) ggATCTTCTACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTcccc < 1:3383972‑M2/91‑5 (MQ=255) ggATCTTCTACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTcccc < 2:4506268‑M2/91‑5 (MQ=255) gATCTTCTACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTcccct > 2:3587581‑M2/1‑86 (MQ=255) aTCTTCTACTAATTTAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGATTGGacaatccctc < 2:3484853‑M1/91‑11 (MQ=255) tcttctAGTGATTGAATACTGTTACGGTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGacaacccctct < 2:4517936‑M1/91‑12 (MQ=255) tcttctACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGacaacccctct < 1:5174771‑M1/91‑12 (MQ=255) tcttctACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTcccctct > 1:3413669‑M2/1‑84 (MQ=255) ttctACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGacaacccctctat < 2:4598904‑M1/91‑14 (MQ=255) ttctACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTa < 2:4147955/91‑1 (MQ=255) ttctACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTa > 2:67406/1‑91 (MQ=255) tctACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTAt < 2:18716/91‑1 (MQ=255) tctACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTAt < 2:4843017/91‑1 (MQ=255) ctactaATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAGAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATg < 1:4857190/91‑1 (MQ=255) ctactaATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATg < 2:2992599/91‑1 (MQ=255) actaATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCt > 1:805103/1‑91 (MQ=255) actaATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCt > 2:3496505/1‑91 (MQ=255) aaTTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCt < 2:2441086/91‑1 (MQ=255) aTTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTa > 2:617748/1‑91 (MQ=255) ttGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTAc < 2:2377144/91‑1 (MQ=255) tGAATAATGTTACGTTTTAATATTGTCATTGTGTAATACTCGCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACa < 2:5239203/91‑1 (MQ=255) ataatGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACAttt < 2:961106/91‑1 (MQ=255) ataatGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAAGAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTGTACAttt < 1:5427454/91‑1 (MQ=255) taatGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTa > 2:1442517/1‑91 (MQ=255) taatGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTa > 1:1010609/1‑91 (MQ=255) taatGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTa > 1:4550719/1‑91 (MQ=255) aatGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTAt < 2:1086670/91‑1 (MQ=255) aatGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCATTATTTTCAAATAAAATATAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTAt > 2:501225/1‑91 (MQ=255) atGTTAAGTTTTAGTTTTGCCCTTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATATACAGGTTGTCCCCTCTTTTGCTTTCACATTAAtt > 2:2821569/1‑91 (MQ=255) tGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTg < 1:3138745/91‑1 (MQ=255) gTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGt > 1:1449942/1‑91 (MQ=255) gTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGt < 1:881100/91‑1 (MQ=255) gTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGt > 1:3261366/1‑91 (MQ=255) ttACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGtt < 2:266762/91‑1 (MQ=255) ttACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGCGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGtt < 1:5607349/91‑1 (MQ=255) tACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTta > 1:1659621/1‑91 (MQ=255) gTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAg < 2:4446034/91‑1 (MQ=255) ttttAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAgt < 1:4147105/91‑1 (MQ=255) ttttAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAgt < 1:4262790/91‑1 (MQ=255) ttAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAgtgt < 1:4813311/91‑1 (MQ=255) aaTTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCa > 1:3786830/1‑91 (MQ=255) aaTTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCa > 2:1025943/1‑91 (MQ=255) aaTTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCa < 2:2035768/91‑1 (MQ=255) ttttGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACt < 2:3897625/91‑1 (MQ=255) tttGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTc > 1:580100/1‑91 (MQ=255) ttGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCa < 2:5570990/91‑1 (MQ=255) ttGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCa < 1:103259/91‑1 (MQ=255) tGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCat < 1:174540/91‑1 (MQ=255) tGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCat < 1:1968785/91‑1 (MQ=255) tGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCat < 1:3301034/91‑1 (MQ=255) gCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCata < 1:1161980/91‑1 (MQ=255) ccATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCatat > 1:5639638/1‑91 (MQ=255) cATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATAtt > 1:4330704/1‑91 (MQ=255) aTTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTa < 2:4284672/91‑1 (MQ=255) tttATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTAcc < 1:3555969/91‑1 (MQ=255) tttATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTAcc > 2:3228768/1‑91 (MQ=255) tataATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGCGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATACTACCaa > 2:5151512/1‑91 (MQ=255) tataATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCaa < 2:5138294/91‑1 (MQ=255) aataCTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACat < 2:3988626/91‑1 (MQ=255) ataCTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTGACTCATATTACTAACata > 1:4734440/1‑91 (MQ=255) ataCTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACata > 1:768498/1‑91 (MQ=255) tctcCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCt < 2:438969/91‑1 (MQ=255) tctcCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCt < 2:2250577/91‑1 (MQ=255) tctcCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCt < 2:1934809/91‑1 (MQ=255) aTTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCg < 1:2395983/91‑1 (MQ=255) ttCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTgg < 2:2599478/91‑1 (MQ=255) tCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGc > 2:1635127/1‑91 (MQ=255) cAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCa < 1:5078872/91‑1 (MQ=255) cAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCa < 1:2702238/91‑1 (MQ=255) cAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCa < 2:3427828/91‑1 (MQ=255) aaataaaataGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCaa > 2:1501334/1‑91 (MQ=255) aaataaaataGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCaa < 2:3793769/91‑1 (MQ=255) aataaaataGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCAAt > 1:4961182/1‑91 (MQ=255) aataaaataGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCAAt > 2:1227811/1‑91 (MQ=255) taaaataGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCAATAc > 1:2880188/1‑91 (MQ=255) ataGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCAATACCTtg < 1:3580480/91‑1 (MQ=255) ataGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCAATACCTtg < 1:1698418/91‑1 (MQ=255) ataGAGGGGTTGTCCCCTCTGATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAATATATGCTTTACCCGTGGCAATACCTtg < 2:5380790/91‑1 (MQ=255) agagGGGacaacccctctattttatttgaaaataaggagagtattataaaatggcaaaattaaaacgtaacattattcaattagtagaaga < 1:1680099‑M1/91‑85 (MQ=255) agagGGGTTGTcccctctattttatttgaaaataaggagagtattataaaattgcaaaattaaaacgtaacattattcaattattagaaga < 2:4635934‑M2/91‑81 (MQ=255) gagGGGacaacccctctattttattggaaaataaggagattattataaaatggcaaaattaaaacgtaacgttattcaattagtagaagat < 2:3033163‑M1/91‑86 (MQ=255) gagGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCAATACCTTGTGc > 1:2065816/1‑91 (MQ=255) gagGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCAATACCTTGTGc > 2:2174002/1‑91 (MQ=255) gagGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCAATACCTTGTGc < 1:1776024/91‑1 (MQ=255) agGGGacaacccctctattttatttgaaaataaggagagtattataaaatggcaaaattaaaacgtaacattattcaattagtagaagatc > 1:944064‑M1/1‑5 (MQ=255) agGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCAATACCTTGTGCt < 1:2319051/91‑1 (MQ=255) gggacaacccctctattttatttgaaaataaggagagtattataaaatggcaaaattaaaacgtaacattattcaattagtagaagatcca > 2:1804582‑M1/1‑3 (MQ=255) gggTTGTcccctctattttatttgaaaataaggagagtattataaaatggcaaaattaaaacgtaacattattcaattagtagaagatcca < 2:2296927‑M2/91‑85 (MQ=255) gggTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCAATACCTTGTGCTTc < 1:4376252/91‑1 (MQ=255) gTTGTcccctctattttatttgaaaataaggagagtattataaaatggcaaaattaaaacgtaacattattcaattagtagaagatccaaa < 2:2499534‑M2/91‑87 (MQ=255) gTTGTcccctctattttatttgaaaataaggagagtattataaaatggcaaaattaaaacgtaacattattcaattagtagaagatccaaa < 2:1742418‑M2/91‑87 (MQ=255) gTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCAATACCTTGTGCTTCCg > 2:1334542/1‑91 (MQ=255) gTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCAATACCTTGTGCTTCCg < 1:3745020/91‑1 (MQ=255) | TTGCTTTTGGATCTTCTACTAATTGAATAATGTTACGTTTTAATTTTGCCATTTTATAATACTCTCCTTATTTTCAAATAAAATAGAGGGGTTGTCCCCTCTTATGCTTCTACATTTATTGTTATAGTGTCACTCATATTACCAACATATGCTTTAACCGTGGCAATACCTTGTGCTTCCG > USA300TCH1516_ALE/2102489‑2102669 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |