New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1058109 | 220 (0.770) | 19 (0.070) | 12/144 | NT | 8.2% | intergenic (+150/+57) | slyA_2/atl_1 | Transcriptional regulator SlyA/Bifunctional autolysin |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1058143 | 225 (0.870) | intergenic (+184/+23) | slyA_2/atl_1 | Transcriptional regulator SlyA/Bifunctional autolysin |
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
TTGATGGTAAACAATCACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTTGATGA > USA300TCH1516_ALE/1058053‑1058233 | aTGGTAAACAATCACCGCTATTTTTGCTTGTTTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTttt < 2:3112061‑M2/91‑4 (MQ=255) aTGGTAAACAATCACCGCTATTTTTGCTTGTCTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGCGATGACTttt < 1:5165626‑M2/91‑4 (MQ=255) tGGTAAACAATCACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGAGGATGACTtttt < 2:3598141‑M2/91‑5 (MQ=255) gTAAACAATCACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTtttgat < 1:3468239‑M2/91‑7 (MQ=255) gTAAACAATCACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTtttgat < 2:2396469‑M2/91‑7 (MQ=255) aTCACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGt < 2:5410600/91‑1 (MQ=255) cACCGCTATTTTTTCTTTTTTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGCTCCTATGTTc > 2:2557471/1‑91 (MQ=255) cACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTc > 1:658760/1‑91 (MQ=255) cACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGAACAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGCGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTc > 1:335974/1‑91 (MQ=255) aCCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCCTCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCa > 2:5465013/1‑91 (MQ=255) ccGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCAt > 2:3214526/1‑91 (MQ=255) cGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATg > 1:2365157/1‑91 (MQ=255) cGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATg < 2:4076546/91‑1 (MQ=255) gCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGt < 1:3847827/91‑1 (MQ=255) gCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGt < 2:2236607/91‑1 (MQ=255) ttGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttat < 2:3834627/91‑1 (MQ=255) ttGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttat < 1:3958050/91‑1 (MQ=255) ttGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttat < 2:5020862/91‑1 (MQ=255) ttGCTCGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTACGTTCATGTTGCttat > 2:5540512/1‑91 (MQ=255) tGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttatt > 1:5563992/1‑91 (MQ=255) tGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttatt < 1:899018/91‑1 (MQ=255) tGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttatt < 1:568947/91‑1 (MQ=255) gCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttattt > 1:4130309/1‑91 (MQ=255) gCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttattt < 1:2947804/91‑1 (MQ=255) gCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttattt < 1:725062/91‑1 (MQ=255) cTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttattta > 2:1229768/1‑91 (MQ=255) cTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttattta < 1:5300914/91‑1 (MQ=255) gtatgtatAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGGTAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATtg > 2:5221203/1‑91 (MQ=255) gtatgtatAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATtg > 2:1008037/1‑91 (MQ=255) tatgtatAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATtgt > 1:3244236/1‑91 (MQ=255) tatgtatAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATtgt > 1:2622868/1‑91 (MQ=255) tatgtatAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATtgt < 1:784475/91‑1 (MQ=255) tatgtatAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATtgt < 1:407992/91‑1 (MQ=255) tgtatAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTgg < 1:1807929/91‑1 (MQ=255) gtatAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTggg > 1:3561482/1‑91 (MQ=255) taAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATg > 1:4818955/1‑91 (MQ=255) aaaaaGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTc > 1:3386979/1‑91 (MQ=255) aaaaGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCg < 2:3253303/91‑1 (MQ=255) aaaGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGa < 1:3494231/91‑1 (MQ=255) aaaGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGa > 2:3712486/1‑91 (MQ=255) aGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAg < 2:1202038/91‑1 (MQ=255) aGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAg > 1:4570691/1‑91 (MQ=255) aGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAg < 1:2256893/91‑1 (MQ=255) gggATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGt > 1:3079018/1‑91 (MQ=255) ggATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTa > 2:701102/1‑91 (MQ=255) ggATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTa > 2:3940184/1‑91 (MQ=255) gATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTAt > 1:3666361/1‑91 (MQ=255) aTCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTAtt > 1:3161615/1‑91 (MQ=255) aTCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTAtt > 1:1509121/1‑91 (MQ=255) tCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTAttt > 1:5419185/1‑91 (MQ=255) tCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTAttt > 2:769681/1‑91 (MQ=255) cAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTg > 1:1231050/1‑91 (MQ=255) aaaGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGc > 2:4680591/1‑91 (MQ=255) aaaGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGc < 1:1880538/91‑1 (MQ=255) aaaGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGc < 2:2014007/91‑1 (MQ=255) aaGGTCATCCCCCATGATGGATAGTGGGGGATGACTTGTGTTCCTATGTTCATGTTGCTTAGTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGcc < 2:1988011/91‑1 (MQ=255) aGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGc < 2:1448580/89‑1 (MQ=255) aGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGc > 1:1448580/1‑89 (MQ=255) gTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGAc > 1:5010410/1‑91 (MQ=255) tCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTtttgatcccttttttatacatacacaatcaaaaatagcggtgattgtttaccatcaatt < 1:5234239‑M2/91‑60 (MQ=255) tCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACt < 2:2822454/91‑1 (MQ=255) cATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACtt < 1:2134808/91‑1 (MQ=255) cATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTCGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACtt > 1:5599893/1‑91 (MQ=255) ttccccATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTGATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCg < 2:3328318/89‑1 (MQ=255) tCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCCTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCg > 2:2735270/1‑91 (MQ=255) ccccATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGcc < 1:1649138/91‑1 (MQ=255) ccccATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGcc > 2:2081504/1‑91 (MQ=255) ccATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCaa > 2:5069520/1‑91 (MQ=255) cATGATTGATAGTGGGTGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAAt > 1:5188907/1‑91 (MQ=255) aTGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAAtt > 2:1175650/1‑91 (MQ=255) tgattgatAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAAttt > 2:2886091/1‑91 (MQ=255) gattgatAGTGGGGGATGACTTTCGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAAtttt < 2:2641284/91‑1 (MQ=255) attgatAGTGGGGGATGACTtttgatcccttttttatacaaacacaagcaaatatagcggtgattgtttaccatcagttttaacaatcacc < 1:4690727‑M2/91‑72 (MQ=255) attgatAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTa > 1:1294826/1‑91 (MQ=255) ttgatAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTAt < 2:2902091/91‑1 (MQ=255) ttgatAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTAt < 2:826767/91‑1 (MQ=255) tgatAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATc < 2:3962388/91‑1 (MQ=255) tgatAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATc > 2:4516484/1‑91 (MQ=255) tgatAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATc > 2:566338/1‑91 (MQ=255) gatAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCa < 1:4511864/91‑1 (MQ=255) gtAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAt < 2:4884486/90‑1 (MQ=255) atAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAt > 1:1011524/1‑91 (MQ=255) atAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATGTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAt < 1:5465013/91‑1 (MQ=255) aGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAtag > 1:4959402/1‑91 (MQ=255) gTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAtagt > 1:2101541/1‑91 (MQ=255) gTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAtagt < 1:2972338/91‑1 (MQ=255) tGGGGGATGTCTTTTGATCTTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGGAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAtagta < 2:1037218/91‑1 (MQ=255) tGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAtagta < 1:1861162/91‑1 (MQ=255) tGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAtagta > 2:1823220/1‑91 (MQ=255) tGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAtagta < 2:1519017/91‑1 (MQ=255) ggggATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGc < 2:5282942/91‑1 (MQ=255) gggATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGcc < 2:3524397/91‑1 (MQ=255) gggATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGcc < 2:1128570/91‑1 (MQ=255) ggATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCt > 1:3728143/1‑91 (MQ=255) tGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTtg > 1:1976944/1‑91 (MQ=255) tGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTtg < 2:190613/91‑1 (MQ=255) aCTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTtgat < 1:5332491/91‑1 (MQ=255) aCTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTtgat > 1:2644583/1‑91 (MQ=255) cTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTtgatg > 1:1754765/1‑91 (MQ=255) cTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTtgatg < 1:4205688/91‑1 (MQ=255) | TTGATGGTAAACAATCACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTTGATGA > USA300TCH1516_ALE/1058053‑1058233 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |