New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2508438 = | 233 (1.280) | 11 (0.070) | 8/232 | NT | 5.4% | intergenic (+26/+81) | USA300TCH1516_02393/narT | Acid shock protein/putative nitrate transporter NarT |
? | USA300TCH1516_ALE | 2508486 = | 174 (1.040) | intergenic (+74/+33) | USA300TCH1516_02393/narT | Acid shock protein/putative nitrate transporter NarT |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
TGTTGATAAGCAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGC > USA300TCH1516_ALE/2508298‑2508578 | atcaagtcatttagcatttattttcttagcggtatttggatgtattgcattatttaccatgagtaatatatacaaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacaa > 4:231383‑M1/140‑141 (MQ=255) gATAAGCAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGc < 1:1321556/141‑1 (MQ=255) gATAAGCAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGc < 1:1351033/141‑1 (MQ=255) aagtcatttagcatttattttcttagcggtatttggatgtattgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGc < 2:828362‑M1/5‑1 (MQ=255) gtcatttagcatttattttcttagcggtatttggatgtattgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCt > 2:1492667‑M1/135‑141 (MQ=255) tcatttagcatttattttcttagcggtatttggatgtattgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCtt < 2:1017448‑M1/8‑1 (MQ=255) aaGCAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCtt < 3:127816/141‑1 (MQ=255) aaGCAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCtt < 3:417192/141‑1 (MQ=255) gCAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTaa > 3:416411/1‑141 (MQ=255) atttagcatttattttcttagcggtatttggatgtattgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCTTaa < 4:31616‑M1/10‑1 (MQ=255) atttagcatttattttcttagcggtatttggatgtattgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCTTaa < 3:31972‑M1/10‑1 (MQ=255) atttagcatttattttcttagcggtatttggatgtattgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCTTaa < 1:272443‑M1/10‑1 (MQ=255) aCATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGt > 1:381103/1‑141 (MQ=255) cATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTc > 1:517360/1‑141 (MQ=255) cATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTc > 1:955036/1‑141 (MQ=255) tatTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCAt < 1:402481/141‑1 (MQ=255) aCTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTa > 2:1505993/1‑141 (MQ=255) aCTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTa > 2:1602790/1‑141 (MQ=255) aCTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTa > 2:303278/1‑141 (MQ=255) cTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCGTCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTAc > 2:796561/1‑141 (MQ=255) cTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAGTTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTAc < 1:507038/141‑1 (MQ=255) cTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTAc > 3:380444/1‑141 (MQ=255) cTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTAc < 1:180887/141‑1 (MQ=255) tGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACg < 1:1283514/141‑1 (MQ=255) tGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACg < 2:20174/141‑1 (MQ=255) tGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACg < 2:113146/141‑1 (MQ=255) cTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGaa < 1:296912/141‑1 (MQ=255) gTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAatat < 1:933277/141‑1 (MQ=255) ttGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTgc > 2:690191/1‑141 (MQ=255) tGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTgcg > 1:364100/1‑141 (MQ=255) tGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTgcg < 2:1550675/141‑1 (MQ=255) aaaaTGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCa < 3:484155/141‑1 (MQ=255) aaaaTGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCa < 2:1228735/141‑1 (MQ=255) aaaTGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCAt < 2:1551207/141‑1 (MQ=255) aaaTGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCAt > 1:1559824/1‑141 (MQ=255) tttggatgtattgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGa > 3:460143‑M1/106‑141 (MQ=255) tGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGat > 1:828247/1‑141 (MQ=255) tGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGat > 4:257802/1‑141 (MQ=255) ggatgtattgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGatat > 3:576866‑M1/103‑141 (MQ=255) ggTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGatat < 3:90439/141‑1 (MQ=255) ggTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGatat < 2:1071774/141‑1 (MQ=255) ggTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGatat < 2:1314682/141‑1 (MQ=255) gatgtattgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATAtt > 1:1582200‑M1/102‑141 (MQ=255) ttattaACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCCTAATATTa > 4:637861/1‑141 (MQ=255) ttattaACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAAGGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTGCTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTa < 1:755337/141‑1 (MQ=255) ttaACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAgg < 1:704353/141‑1 (MQ=255) attgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGc > 1:1414759‑M1/97‑141 (MQ=255) cattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTg > 1:1657285‑M1/93‑141 (MQ=255) aCCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTAtt < 1:342250/141‑1 (MQ=255) ccTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTAtgc > 3:25264/1‑139 (MQ=255) ccTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTAtgc > 2:250923/1‑139 (MQ=255) ttGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTaa > 2:371385/1‑141 (MQ=255) ccTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTa > 1:59240/1‑141 (MQ=255) cTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTaa < 1:1097828/141‑1 (MQ=255) aaaTCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAaatg < 2:425961/141‑1 (MQ=255) cAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAaatgaatg < 1:682812/141‑1 (MQ=255) aaCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGc > 1:81102/1‑141 (MQ=255) aCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATTTTAATGCTTTGTATTTAACTAAATGATTGGCa > 2:509819/1‑141 (MQ=255) aCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCa > 1:58573/1‑141 (MQ=255) aCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCa > 3:105846/1‑141 (MQ=255) aCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATCTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGCTATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGACTGGCa > 2:1623791/1‑141 (MQ=255) gCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTAt > 3:1762/1‑141 (MQ=255) gCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTAt > 1:862533/1‑141 (MQ=255) cAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTAtt < 1:636465/141‑1 (MQ=255) aTGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTAc > 1:1011130/1‑141 (MQ=255) tGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACa < 2:527067/141‑1 (MQ=255) gAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACat > 3:286418/1‑141 (MQ=255) aaaCTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACata < 1:1182432/141‑1 (MQ=255) aaaCTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACata < 1:457004/141‑1 (MQ=255) ctactTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCa < 2:1175890/141‑1 (MQ=255) ctactTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCa < 2:1095391/141‑1 (MQ=255) tactTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGTTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCaa < 2:1590170/141‑1 (MQ=255) ttCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCg < 1:1501378/141‑1 (MQ=255) catcaACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAat > 2:859031/1‑76 (MQ=255) catcaACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGtt < 4:124138/141‑1 (MQ=255) caACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGttttt < 1:787685/141‑1 (MQ=255) tCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATg < 3:680316/141‑1 (MQ=255) tATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAg > 2:1359029/1‑141 (MQ=255) aTTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTAtt > 2:582196/1‑93 (MQ=255) aTTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGc > 1:1037859/1‑141 (MQ=255) cAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCata < 4:264758/141‑1 (MQ=255) ttCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCt < 4:380444/141‑1 (MQ=255) cATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCttt > 4:489025/1‑141 (MQ=255) aGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGGTATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTg > 3:71769/1‑141 (MQ=255) aGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTAAATGTCATGCTACGAATATTGCGCAAGATATTAAAGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATATATGACATATCAACCGATTTTCAATAAGCCATATTCTTTTTg > 1:413454/1‑141 (MQ=255) gTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTgg < 4:572006/141‑1 (MQ=255) aaTTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGtata > 3:472167/1‑141 (MQ=255) aTTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTTAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATaa > 2:1314385/1‑141 (MQ=255) aTTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATaa > 2:624808/1‑141 (MQ=255) tttAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATaaa < 3:651109/141‑1 (MQ=255) aaaTGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATg > 1:1628849/1‑139 (MQ=255) aaTGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACg < 2:381103/141‑1 (MQ=255) aTGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATg < 3:357129/49‑1 (MQ=255) aTGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATg > 4:357129/1‑49 (MQ=255) gAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGATTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCAt > 4:626347/1‑141 (MQ=255) aTACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATgg > 3:88875/1‑141 (MQ=255) acacTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAgg > 4:55738/1‑52 (MQ=255) ctaAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGc < 2:744112/103‑1 (MQ=255) AAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGc < 1:1218012‑M1/141‑1 (MQ=255) AAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGc < 3:628783‑M1/141‑1 (MQ=255) | TGTTGATAAGCAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGC > USA300TCH1516_ALE/2508298‑2508578 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |