New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2082639 = | 149 (0.820) | 8 (0.050) | 8/242 | NT | 5.5% | intergenic (+280/+44) | aspC/USA300HOU_RS10520 | Aspartate aminotransferase/65 kDa membrane protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 2082667 = | 135 (0.780) | intergenic (+308/+16) | aspC/USA300HOU_RS10520 | Aspartate aminotransferase/65 kDa membrane protein |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
AGATGAAAAGTAAAAAACTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCATTTTTAAAATACACTTTATACACTG > USA300TCH1516_ALE/2082528‑2082807 | aGATGAAAAGTAAAAAACTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCttat > 4:185963/1‑141 (MQ=255) aGATGAAAAGTAAAAAACTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCttat > 2:160162/1‑141 (MQ=255) tGAAAAGTAAAAAACTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTtattat < 4:707015/141‑1 (MQ=255) aaatatgtagacttaaaaactgagtataaagatgaaagagtatttaaagcaactgacattaaaaaggtagatattgaacttaaattctaatctttaattttataataaggcaccccacgattgtgagatgccttATTATaa < 1:1002069‑M2/7‑1 (MQ=255) aaaaGTAAAAAACTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATaa > 1:894484/1‑141 (MQ=255) aaaaGTAAAAAACTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATaa > 2:1548340/1‑141 (MQ=255) aaaGTAAAAAACTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATaaa > 1:157820/1‑141 (MQ=255) tAAAAAACTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTa < 3:697137/141‑1 (MQ=255) tAAAAAACTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTa < 2:199830/141‑1 (MQ=255) aaaaaaCTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTaa > 2:107386/1‑141 (MQ=255) aaaaaaCTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTaa > 4:560797/1‑141 (MQ=255) aaaaaCTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTaaa > 2:505622/1‑141 (MQ=255) aaaaaCTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACACCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTaaa > 1:1434632/1‑141 (MQ=255) aaCTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGAt > 1:344076/1‑141 (MQ=255) aCTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGAtt < 3:488050/141‑1 (MQ=255) aCTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGAtt < 2:688032/141‑1 (MQ=255) tttttCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATATATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAg > 3:192270/1‑141 (MQ=255) tttCTATCAGTCCGATTTCTTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGaa < 1:1261715/141‑1 (MQ=255) tATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTa > 1:256133/1‑141 (MQ=255) cAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGt < 1:1181172/141‑1 (MQ=255) cAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGt > 4:177645/1‑141 (MQ=255) gTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTc < 3:495466/141‑1 (MQ=255) tCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCa > 2:379935/1‑141 (MQ=255) gATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAata < 2:971629/141‑1 (MQ=255) ttattaTAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCt > 4:690289/1‑141 (MQ=255) ttatAGNACCAATTTATNNAACTTTTGGCAAATNACTNCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTAcc > 3:664028/1‑141 (MQ=255) ataGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCtt < 1:279108/141‑1 (MQ=255) ataGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCtt > 1:33919/1‑141 (MQ=255) taGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCttt < 4:418608/141‑1 (MQ=255) aaCCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTa > 2:532043/1‑141 (MQ=255) atttaaagcaactgacattaaaaaggtagatattgaacttaaattctaatctttaattttataataaggcaccccacgattgtgagatgccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTaa < 1:447976‑M2/48‑1 (MQ=255) cAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATg < 3:64330/141‑1 (MQ=255) aTTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTc < 2:89387/141‑1 (MQ=255) aTTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTc > 2:184657/1‑141 (MQ=255) tttATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCa < 1:1240752/141‑1 (MQ=255) tttATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTGTAATGTCa > 1:654558/1‑141 (MQ=255) tatataACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGt < 4:226385/141‑1 (MQ=255) atataACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTCTTTAATGTCAGtt > 2:742693/1‑141 (MQ=255) tataACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTg < 2:769021/141‑1 (MQ=255) ataACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGc > 1:749759/1‑141 (MQ=255) taACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCt < 1:389450/141‑1 (MQ=255) ttttGGCAAATCACTTCAAACAGTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTaa < 1:1515127/141‑1 (MQ=255) tttGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGTCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTaaa < 3:594017/141‑1 (MQ=255) tttGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTaaa < 2:644139/141‑1 (MQ=255) tGGCAACTCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATa < 1:348091/141‑1 (MQ=255) ggCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATAc > 2:1157635/1‑141 (MQ=255) cAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATActc > 1:943965/1‑141 (MQ=255) tCACTTCAAACATTCAAGCATTCCATCTCTACAAATTTAAAATGCACCTCACGATTGTGATTTGCCTTATTATAATATTAAATATTAGAATTTAAGTTTAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTc < 4:586957/141‑1 (MQ=255) tCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTTAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTc < 1:178219/141‑1 (MQ=255) cAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCt > 2:248193/1‑104 (MQ=255) aCATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTtata < 4:261778/141‑1 (MQ=255) cATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATAc < 1:860896/141‑1 (MQ=255) ttCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTc < 2:475745/141‑1 (MQ=255) tCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCa > 1:1324694/1‑141 (MQ=255) tCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATCAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTAGCTATAAATACTCTCTCATCTTTATACTCa > 4:294397/1‑141 (MQ=255) aGCATGACAACTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTGAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAGATACTCTTTCATCTTTGTACTTAGtt > 2:202640/1‑141 (MQ=255) gCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGttt > 2:244609/1‑141 (MQ=255) cATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGtttt > 2:191743/1‑141 (MQ=255) ctaatctttaattttataatAAGGCATCTCACAATCGTGGGGTGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTAAACTTGTTACTCAGTTTTTa < 1:924411‑M1/121‑1 (MQ=255) caTCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGt > 2:1632192/1‑141 (MQ=255) aTCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTc < 1:1471452/141‑1 (MQ=255) aTCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTc < 2:1215337/141‑1 (MQ=255) ctctACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTa > 1:432136/1‑141 (MQ=255) ctctACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTa < 4:157078/141‑1 (MQ=255) ctctACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGAAGCCTTATTATAAAAATAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTa < 1:1241917/141‑1 (MQ=255) aCAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACata > 1:82862/1‑141 (MQ=255) aCAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACata < 2:1185788/141‑1 (MQ=255) aaaTGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATAtt > 1:775225/1‑141 (MQ=255) ttataatAAGGCATCTCACAATCGTGGGGTGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATAttt < 1:1002069‑M1/134‑1 (MQ=255) aaTGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATAttt > 2:776766/1‑141 (MQ=255) gTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGa > 3:140884/1‑141 (MQ=255) tAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGAc < 1:1632192/141‑1 (MQ=255) aaaaGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAANTTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACg > 1:305589/1‑141 (MQ=255) AGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACa > 2:1442964‑M1/1‑128 (MQ=255) AGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAAc < 2:1139877‑M1/141‑1 (MQ=255) catctcacaatcgtggggtgccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCAt > 1:220234‑M2/25‑141 (MQ=255) ccccACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCAttt < 2:566343/141‑1 (MQ=255) cccACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCAtttt < 3:245500/141‑1 (MQ=255) cccACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCAtttt < 3:430891/141‑1 (MQ=255) cccACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCAtttt > 2:1324679/1‑141 (MQ=255) cccACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCAtttt < 2:336668/141‑1 (MQ=255) cccACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCAtttt < 2:48839/141‑1 (MQ=255) ccACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAGGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCAttttt > 1:519691/1‑141 (MQ=255) ccACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCAttttt < 1:1393593/141‑1 (MQ=255) ccACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCAttttt < 2:894484/141‑1 (MQ=255) cGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCATTTTTaaa < 3:169777/141‑1 (MQ=255) gATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATGTTTTGACGAACCATTTTTaaaa < 2:1658993/141‑1 (MQ=255) gATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCATTTTTaaaa > 1:246239/1‑141 (MQ=255) aatcgtggggtgccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCa > 4:653069‑M2/17‑132 (MQ=255) aTTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCATTTTTAAAAt < 1:107386/141‑1 (MQ=255) ttGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCATTTTTAAAATa > 3:475811/1‑141 (MQ=255) ttGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCATTTTTAAAATa > 1:1435637/1‑141 (MQ=255) tgtgAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCATTTTTAAAATac > 1:725216/1‑141 (MQ=255) tgtgAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCATTTTTAAAATac > 2:274643/1‑141 (MQ=255) gtgAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCATTTTTAAAATaca > 2:964145/1‑141 (MQ=255) gagaTGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCATTTTTAAAATACACt > 2:1291087/1‑141 (MQ=255) aTGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCATTTTTAAAATACACTTta < 1:916028/141‑1 (MQ=255) aTGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCATTTTTAAAATACACTTta > 2:1112332/1‑141 (MQ=255) gccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCATTTTTAAAATACACTTtata > 1:534923‑M2/6‑141 (MQ=255) attatAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATAGTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCATTTTTAAAATACACTTTATACACTg > 2:839372/1‑141 (MQ=255) | AGATGAAAAGTAAAAAACTTTTTCTATCAGTCCGATTTATTATAGAACCAATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTTTAAGTCTACATATTTTGACGAACCATTTTTAAAATACACTTTATACACTG > USA300TCH1516_ALE/2082528‑2082807 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |