Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | USA300TCH1516_ALE | 1,732,797 | 0 | G | A | 6.0% | 527.7 / 3.1 | 163 | E333K (GAA→AAA) | limB_2 | Limonene 1,2‑monooxygenase |
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Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
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1:1430664/1‑141 (MQ=255) gAATGTTATAAATCAGATAAATGAAAAAAACACTTTA‑T‑AATGTGATAAATAAACTAAGTGAAAGTATGTATCCATAATATTAATAAAAATATACAGTAACAGCATTTTGAATGAAAGATGTCTTTATTGTTCAATCattta > 2:1210774/1‑141 (MQ=255) gAATGTTATAAATCAGATAAATAAAAAAAACACTTTA‑T‑AATGTGATAAATAAACTAAGTGAAAGTATGTATCCATAATATTAATAAAAATATACAGTAACAGCATTTTGAATGAAAGATGTCTTTATTGTTCAATCattta > 1:1268163/1‑141 (MQ=255) aaTGTTATAAATCAGATAAATGAAAAAAACACTTTA‑T‑AATGTGATAAATAAACTAAGTGAAAGTATGTATCCATAATATTAATAAAAATATACAGTAACAGCATTTTGAATGAAAGATGTCTTTATTGTTCAATCatttat < 2:63469/141‑1 (MQ=255) gTTATAAATCAGATAAATGAAAAAAACACTTTA‑T‑AATGTGATAAATAAACTAAGTGAAAGTATGTATCCATAATATTAATAAAAATATACAGTAACAGCATTTTGAATGAAAGATGTCTTTATTGTTCAATCATTTAtttt > 1:1110511/1‑141 (MQ=255) gTTATAAATCAGATAAATGAAAAAAACACTTTA‑T‑AATGTGATAAATAAACTAAGTGAAAGTATGTATCCATAATATTAATAAAAATATACAGTAACAGCATTTTGAATGAAAGATGTCTTTATTGTTCAATCATTTAtttt > 4:632349/1‑141 (MQ=255) 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1:487467/141‑1 (MQ=255) aTAAATGAAAAAAACACTTTA‑T‑AATGTGATAAATAAACTAAGTGAAAGTATGTATCCATAATATTAATAAAAATATACAGTAACAGCATTTTGAATGAAAGATGTCTTTATTGTTCAATCATTTATTTTAGTAATGATTCa > 4:357269/1‑141 (MQ=255) tAAATGAAAAAAACACTTTA‑T‑AATGTGATAAATAAACTAAGTGAAAGTATGTATCCATAATATTAATAAAAATATACAGTAACAGCATTTTGAATGAAAGATGTCTTTATTGTTCAATCATTTATTTTAGTAATGATTCaa < 2:1277853/141‑1 (MQ=255) aaTGAAAAAAACACTTTA‑T‑AATGTGATAAATAAACTAAGTGAAAGTATGTATCCATAATATTAATAAAAATATACAGTAACAGCATTTTGAATGAAAGATGTCTTTATTGTTCAATCATTTATTTTAGTAATGATTCAAAt > 4:494579/1‑141 (MQ=255) | TACTGTTCAACAAAAAATTCAAGATTTTATGGAAACTTATGGTGAAGTCAACGAAATTATGGCAATAAGTTATATTTATGATAAAGATATGCAA‑TTAGACTCTTATCGTCGGTTCAAGAATGTTATAAATCAGATAAATGAAAAAAACACTTTA‑T‑AATGTGATAAATAAACTAAGTGAAAGTATGTATCCATAATATTAATAAAAATATACAGTAACAGCATTTTGAATGAAAGATGTCTTTATTGTTCAATCATTTATTTTAGTAATGATTCAAATTC > USA300TCH1516_ALE/1732658‑1732936 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |