New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 512620 = | 170 (0.760) | 110 (0.740) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAA |
58/166 | NT | 49.0% | intergenic (+688/‑6075) | recR/speA_2 | Recombination protein RecR/Arginine decarboxylase |
? | USA300TCH1516_ALE | 1998278 = | NA (NA) | intergenic (‑6/+3329) | USA300TCH1516_01882/USA300TCH1516_01883 | tRNA‑Val/tRNA‑Ala |
Only 100 of 358 total aligned reads displayed.
TCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTAT > USA300TCH1516_ALE/512487‑512752 | tCAGTACAGAAAAAATAGATCTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTa < 2:317952/134‑1 (MQ=255) gTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACACCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaaa > 1:1898162/1‑134 (MQ=255) gTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaaa > 2:139704/1‑134 (MQ=255) gTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaaa > 1:586257/1‑134 (MQ=255) catgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgattgtagtcgaacttacgttacactagcatagaacgttcccaggcagttttttaatcaaatttttgttaaaaaataaaatcgacaagatacACAAAGtt < 2:667680‑M1/8‑1 (MQ=255) aTGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAATAAAACAACTGAACTTAAGTAATAACTTGAATTTCGAACGAAAATCAATTTAAAAACATTAt > 2:590600/1‑134 (MQ=255) aTGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGACTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTCAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTAt < 2:1814173/134‑1 (MQ=255) tGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTAtt < 1:249495/134‑1 (MQ=255) ccgaacacagaaattaagcaccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagcacgttgccaggcagatttttaatcacatttacgttaaaaaataaaattaataagataaACAAATATATTg < 2:2201419‑M1/12‑1 (MQ=255) cgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGa < 2:377571‑M1/13‑1 (MQ=255) aCAAAGGTGTAATATTTACTGTTGTTAAACAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTCGAGGCAAACAAAAAAAGTAAAGTTAAGGAATAACTTTAAATGATAACGACAACTAATTTTAAAAAGTTAttta > 2:1020645/1‑132 (MQ=255) cAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGGAAACATAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGAc > 2:188632/1‑134 (MQ=255) cAAAGGTGTAATTTGTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGAc < 2:1472205/134‑1 (MQ=255) aaGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACtt > 1:1115114/1‑134 (MQ=255) ggTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTaa > 2:96061/1‑134 (MQ=255) tAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGTGGCAAACAAAACAAATCAACATAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGt > 1:2558512/1‑134 (MQ=255) agttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaactggaaaaaataaAAAAAGTTATTGAATTAAATGtt < 1:2367213‑M1/23‑1 (MQ=255) gttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATgttg < 2:2872858‑M1/24‑2 (MQ=255) ttttAATGTTGTTAAGCAGTTTGGAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaat < 2:406336/134‑1 (MQ=255) taagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAatgttgat > 1:146826‑M1/109‑131 (MQ=255) tttACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAACCAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGCTATTGACTTAAATGTtaata > 2:2565421/1‑134 (MQ=255) agctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTATATGTtgataa < 1:762394‑M1/28‑1 (MQ=255) gttgttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATAAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGt > 1:1967226/1‑134 (MQ=255) ttgttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGta < 1:441261/134‑1 (MQ=255) tagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgtcatgcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGtat > 1:1505397‑M1/100‑134 (MQ=255) gtcgatgttagtcgaacttacgttccgctagaggagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaatt > 2:2359268‑M1/96‑134 (MQ=255) gaaGTTTGTAATCTTGTATAGTATTTTTTTGTTGAGTCAAACAAAACAAATCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaattaa < 1:864872/132‑1 (MQ=255) gagtatagtcgaacttacggtccgctatagtagaactttgccaggcagttttttaatcaaattttgtttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaattaat > 2:1330064‑M1/93‑134 (MQ=255) aGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATaattaatt > 1:2770671/1‑134 (MQ=255) ggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCt < 2:508751‑M1/45‑1 (MQ=255) gtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaataaagaataaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCtt < 1:1384353‑M1/46‑1 (MQ=255) ttggcaaactcacgttccgatagagtagaagtttaccaggcagttttttaatgaaatttaggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTg > 2:2225114‑M1/88‑134 (MQ=255) agtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGt > 1:2737652‑M1/87‑134 (MQ=255) cgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcatattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCgg > 1:1935090‑M1/84‑134 (MQ=255) aGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCgg > 1:2179804/1‑134 (MQ=255) cttatgttcagctagagtataacgttgccaggtatttttttaatcatatttttgttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTGAAATGTTGATAAAATGGATAATTAATGCTTGTCGGTAAg > 1:379344‑M1/80‑134 (MQ=255) cttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaatttttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg < 1:1068516‑M1/55‑1 (MQ=255) ttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGa > 1:1838301‑M1/79‑134 (MQ=255) gtaagttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAATTGTTGACAAAAAGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGa < 1:1219882‑M1/56‑1 (MQ=255) tacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggtctagatttCTCCAGACATAGAATTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaa < 1:663590‑M1/57‑1 (MQ=255) aGTATTTATTTGTTGAGTCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGCAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaaaaa > 2:714211/1‑134 (MQ=255) ccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACATAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGa > 1:1852347‑M1/72‑134 (MQ=255) atttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCACCCTAAGAAATAACTTGACTTACTGACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGAATTAGAAGTTAATAGAGTGTACATTTAATTGTTGTAGGTAAGAAAAATGAACAt > 2:2634542/1‑134 (MQ=255) gagtagaaagttacaaagctttgttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTg < 2:1765824‑M1/69‑1 (MQ=255) agtagaacgttgccagtcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGa > 2:761473‑M1/65‑134 (MQ=255) agtagaacggtgccaggcagttttataatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTATGAAAAATGAACATTGa > 2:787722‑M1/65‑134 (MQ=255) ttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATACCTTGCAGGACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTCAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGaaa < 1:1483405/134‑1 (MQ=255) agaacgctgctaggcagttttttaagttaagtgtggttagaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGaaaa > 2:1778444‑M1/62‑134 (MQ=255) aacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATACAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt > 2:2341453‑M1/60‑134 (MQ=255) aGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt > 2:1226653/1‑134 (MQ=255) ggCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg > 2:857150/1‑134 (MQ=255) acgttgccaggcagtttttgaatcaaattttggttataaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGGTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg > 2:2114926‑M1/59‑134 (MQ=255) gCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGATATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGa > 2:2556961/1‑134 (MQ=255) cgttgccaggcatttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGa > 2:2461193‑M1/58‑134 (MQ=255) cgttcccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataatatggataagataaAAATAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATGCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGa > 1:482379‑M1/58‑134 (MQ=255) caaaacaaTTCAAATTTAGAAATAATTTGAATCACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGAc < 1:618583/134‑1 (MQ=255) aaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACTAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACaa < 1:808165/134‑1 (MQ=255) aaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAAGTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTAAATTACaa > 2:2742494/1‑134 (MQ=255) aacaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAATGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAat < 1:1692371/134‑1 (MQ=255) aacaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTAGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAat > 2:817691/1‑134 (MQ=255) taactcatctTAAGAAATAACTTGAATTACTAAAGAAAATTAATTTTAACACGTTCTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTTTCTGTATGCCAATTGGATGTTGAAAACCGAATGACAatat < 2:1185320/133‑1 (MQ=255) cagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAATAATGAACATTGAAAACTGAATGACAatat > 2:1083153‑M1/48‑134 (MQ=255) caactcaactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATATTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAatat > 1:1635393/1‑134 (MQ=255) agttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATg < 1:1562151‑M1/88‑1 (MQ=255) aactcaactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTCACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTTCTTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAATATTGAAAACTGAATGACAATATg > 1:1269955/1‑134 (MQ=255) tttttaatcaaattttagttaaaaaataaaatggacaatataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCa > 1:2120129‑M1/44‑134 (MQ=255) tttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAAc > 1:1402879‑M1/42‑134 (MQ=255) tAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGATAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTAAAccata > 2:2284392/1‑130 (MQ=255) caaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGATTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAt > 1:925917‑M1/36‑134 (MQ=255) caaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAt < 2:1585267‑M1/99‑1 (MQ=255) aattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTc < 1:22330‑M1/101‑1 (MQ=255) attttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTTATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTcc > 1:1886045‑M1/33‑134 (MQ=255) tttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGATTTAAATTTTAATAAAATGTATAATTAAGTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa > 1:2842463‑M1/31‑134 (MQ=255) tAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGATAATATGTCAACGTTAATTCaaa > 2:2410383/1‑134 (MQ=255) tAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa < 2:2814906/134‑1 (MQ=255) gaCTTGAGATACTTACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaa < 2:303625/133‑1 (MQ=255) aaCTTGAATTACTAACGAAAATTATTTTTAAAAAGTTATTGACTTAATGGCGAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaa > 1:2417528/1‑134 (MQ=38) aaCTTGAATTACTAACAAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaa < 2:1264672/134‑1 (MQ=255) ttGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaaa < 2:1115114/134‑1 (MQ=255) gttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaaa < 1:509465‑M1/108‑1 (MQ=255) tGAATTACTAACGAAAATTAATTATAAAAAGGTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTAAAAAAAAc > 2:1936089/1‑134 (MQ=255) aaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATTAACATTGAATTCTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGt > 1:1456633‑M1/24‑134 (MQ=255) ttACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTaa > 1:722150/1‑134 (MQ=255) ttACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTAACTTAAATGTTAATAAAATGTAAAATTAATTCTCATCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTCAATGACAATACGTCAACGTTAATTCAAAAAACCGTaa > 2:1424843/1‑134 (MQ=255) aaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACtata < 1:310060‑M1/118‑1 (MQ=255) taaaaTTAATTTTTAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGt < 2:447965/133‑1 (MQ=255) gAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTTACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGt < 2:1824864/134‑1 (MQ=255) tggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGtt > 2:113804‑M1/13‑134 (MQ=255) tggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGtt > 1:1751808‑M1/13‑134 (MQ=255) aaaaTTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGtt < 1:2625981/134‑1 (MQ=255) ataagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCCGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACa > 2:2106528‑M1/10‑134 (MQ=255) acaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTTATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACa > 1:895827‑M1/10‑134 (MQ=255) acaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAATATATGTAACa < 1:1334816‑M1/125‑1 (MQ=255) aagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCAGTAAGAAAAATGAACATTGATAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaaa > 1:100081‑M1/8‑134 (MQ=255) aattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAACTGAACATTGAAAACTAAATGACAATATTTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAAc > 1:1809668/1‑134 (MQ=255) aattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCAAAAAAACGTAACTATAAGCTACAAAc > 2:2014346/1‑134 (MQ=255) gataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTAAATGACAATATGTAAACGTTAATTCAAAAAAACGTAAATATAAGTTACAAACa < 1:2666936‑M1/129‑1 (MQ=255) taaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACatt > 2:1529766‑M1/4‑134 (MQ=255) ttAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACatta < 1:1038098/134‑1 (MQ=255) aaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACatta < 1:1786860‑M1/132‑1 (MQ=255) | TCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTAT > USA300TCH1516_ALE/512487‑512752 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |