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* | USA300TCH1516_ALE | 618,714 | 0 | G | A | 6.4% | 1093.9 / 9.1 | 437 | S1272S (TCG→TCA) | sdrD | Serine‑aspartate repeat‑containing protein D |
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AGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCGGATAGTG‑ATTCA‑GACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGA > USA300TCH1516_ALE/618574‑618854 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |