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* | USA300TCH1516_ALE | 1,435,073 | 0 | G | A | 10.0% | 725.1 / 15.4 | 279 | G144S (GGT→AGT) ‡ | dapH | 2,3,4,5‑tetrahydropyridine‑2,6‑dicarboxylate N‑acetyltransferase |
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Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
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tggtCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGgtgt > 1:3511365/1‑141 (MQ=255) gggtCGTGCTACAACTAGTAAGAAGGTACATGTAGGGGATGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGgtgt < 2:3934608/140‑1 (MQ=255) ggtTGTGCTACAACTGGTAAAAATGTGCATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCATGTGTGATTGATCCCCCTAGTGGTGCATTTGTGATATTCGAGGAGGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTa < 2:1124798/141‑1 (MQ=255) ggtCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTa < 1:4044576/141‑1 (MQ=255) ggtCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAACAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTa > 1:954025/1‑141 (MQ=255) ggtCGTGCTACAACGGGTAAAAATGTAGATGTAGGGGCTGGCGCAGGATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAAGCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTa < 1:251301/141‑1 (MQ=255) gggcGTGGTACAACTGGTAAAAATGTACAGGTAGGGGCTGGCGCAGTATTATCAGGTGTGAGTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAAGCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTa < 2:732132/138‑1 (MQ=255) gTGATAGAACTAGTAAAAAGGTGGTGGTAGGGGCTGGCGGAGTATTAGGAGGTGTGATTGAACCGCCTAGTGCGTGACCGGTTATAAGGGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACgtg < 2:23144/141‑1 (MQ=255) tACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTgg < 1:4324355/141‑1 (MQ=255) tACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTgg < 1:1846644/141‑1 (MQ=255) cAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTGGTa < 1:2597840/141‑1 (MQ=255) tcTGGTAAAAATGTATATGTAGTTGCTGTCGCAGTATGAGCAGGTGTGATTGATCCCCCTAGTGGTTCACTGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTGGTaaa < 2:3479182/140‑1 (MQ=255) ggTAAAAAGGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTGGTAAAGGt < 1:16289/141‑1 (MQ=255) | GGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTAT‑TGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTGGTAAAGGT > USA300TCH1516_ALE/1434935‑1435213 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |