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| * | USA300TCH1516_ALE | 2,373,531 | 0 | G | T | 8.2% | 1086.3 / 50.1 | 375 | A82E (GCG→GAG) | pbuG | Guanine/hypoxanthine permease PbuG |
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Only 100 of 382 total aligned reads displayed.
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1:3078732/1‑141 (MQ=255) ccTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACA‑AATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAACCTGTTCGTGGTGGTCGATTTTCATATCTTCTGATACGCCTTTAACACCTGCTAAACtt > 1:839169/1‑141 (MQ=255) tGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCAATCCTACA‑AATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCATTTTCATATCTTCTGATACGCCTTTAACACCTGCTAAACTTaa < 1:370468/141‑1 (MQ=255) ggTGCGAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACA‑AATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCATTTTCATATCTTCTGATACGCCTTTAACACCTGCTAAACTTaaa < 2:3034258/141‑1 (MQ=255) tAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACA‑AATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCATTTTCATATCTTCTGATACGCCTTTAACACCTGCTAAACTTAAAACTTg < 2:3400491/141‑1 (MQ=255) tAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACA‑AATGCTGCTAATGCAGTCACTACAAAAATGGCACCTTGGTCCATTTTCATATCTTCTGATACGCCTTTAACACCTGCTAAACTTAAAACTTg < 2:3893237/141‑1 (MQ=255) 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1:604737/141‑1 (MQ=255) cGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACA‑AATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCATTTTCATATCTTCTGATACGCCTTTAACACCTGCTAAACTTAAAACTTGCgg < 1:2526120/141‑1 (MQ=255) gCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACA‑AATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCATTTTCATATCTTCTGATACGCCTTTAACACCTGCTAAACTTAAAACTTGCggg < 1:1791712/141‑1 (MQ=255) | CCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATG‑CATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACA‑AATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCATTTTCATATCTTCTGATACGCCTTTAACACCTGCTAAACTTAAAACTTGCGGG > USA300TCH1516_ALE/2373391‑2373671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |