New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 895785 = | 59 (0.950) | 12 (0.220) | 10/226 | NT | 18.7% | coding (806/822 nt) | metQ_2 | Methionine‑binding lipoprotein MetQ |
? | USA300TCH1516_ALE | = 909740 | 53 (0.990) | intergenic (‑663/‑371) | USA300HOU_RS04500/csbD_1 | hypothetical protein/Stress response protein CsbD |
AAGTGCGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACAAAAAAAT > USA300TCH1516_ALE/895645‑895924 | ggttgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaat > 1:650517‑M1/141‑141 (MQ=255) ggttgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaat > 1:753244‑M1/141‑141 (MQ=255) ttgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatttggctaatta < 2:29869‑M1/3‑1 (MQ=255) ttgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatcttgctaattt < 2:360612‑M1/3‑2 (MQ=255) ttgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcataaataacaatgcatggatttcccttgaacttccttgataatctggataatta < 2:369452‑M1/3‑1 (MQ=255) gTGCGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTa > 1:126083/1‑141 (MQ=255) tGCGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTAt < 1:704168/141‑1 (MQ=255) cGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTc > 1:85187/1‑141 (MQ=255) aaaGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCt > 2:651889/1‑141 (MQ=255) aaGATAATCATTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATAAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATAATACAGTTATTCATg > 2:646160/1‑141 (MQ=255) aaaaaaaaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGc > 2:280618‑M1/132‑141 (MQ=255) aGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTACTCCTGc < 2:67923/141‑1 (MQ=255) aagtgcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcattattatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCt > 1:709892‑M1/131‑141 (MQ=255) aggaaaaaaaaagggaataattgtgaaaaaaagggctaggatatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataagaatgttttgattgctcttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTa > 2:462048‑M1/130‑141 (MQ=255) gggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTaa > 1:231557‑M1/129‑141 (MQ=255) aaTCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTaaa < 2:727396/141‑1 (MQ=255) tCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAaata > 1:724876/1‑141 (MQ=255) aaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAaata > 2:504969‑M1/126‑141 (MQ=255) gCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGTAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCaa > 2:337704/1‑141 (MQ=255) aCTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATtaa > 2:639559/1‑141 (MQ=255) cTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATtaaa > 1:549786/1‑141 (MQ=255) taatattgataaaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATtaaat > 2:1848‑M1/113‑141 (MQ=255) aaTTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATtaaataa < 1:62809/141‑1 (MQ=255) ttGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATaaaa > 2:428552/1‑141 (MQ=255) ttGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGAATTCCATAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATaaaa > 2:370244/1‑141 (MQ=255) ttGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGACATACAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACTAATTAAATaaaa > 2:88569/1‑141 (MQ=255) gTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATAcc > 1:463694/1‑141 (MQ=255) aacaaaggtcaatggtattaataataaattatcttgaaaattttataactgcatatataaccatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATAcc > 2:541401‑M1/104‑141 (MQ=255) aacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttcctttataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATAcc > 2:203977‑M1/104‑141 (MQ=255) aaaGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCtt < 1:504570/141‑1 (MQ=255) aagaagGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCttt > 1:741683/1‑141 (MQ=255) aTCAAGAAAATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATaacaac < 2:555505/141‑1 (MQ=255) tCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACg > 1:460028/1‑141 (MQ=255) cAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGa > 2:173539/1‑141 (MQ=255) aaGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTACTGCTAAATAATACAAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGAt > 2:358944/1‑141 (MQ=255) gatgatAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGTTTa > 1:451569/1‑141 (MQ=255) atgatAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTACTAACAACGAtcca > 2:724119/1‑138 (MQ=255) atAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAggg > 1:190859/1‑141 (MQ=255) atAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGAAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGCTTAAggg > 2:407207/1‑141 (MQ=255) aaGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATGTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACAAATTAAATAAAAATACCATTTAATAACAAAGATTAAGGGGt < 2:361714/141‑1 (MQ=255) aaGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTACATATGAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGt < 2:165793/141‑1 (MQ=255) aaGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGt < 2:14494/141‑1 (MQ=255) aaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgatcatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAATAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGtt < 2:319516‑M1/63‑1 (MQ=255) aGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGtt < 1:728203/141‑1 (MQ=255) aGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGtt > 1:659266/1‑141 (MQ=255) gAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTa < 1:331989/141‑1 (MQ=255) gAAAATCAAAGAATTAATTGAAGTAATACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTa < 2:41474/141‑1 (MQ=255) aattatcttgacaatattacagaggcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTa > 1:101228‑M1/78‑141 (MQ=255) aaaTCAAAGCATTAATAGAAAGATTACAACCTAAAGAAATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTAtt < 1:325384/141‑1 (MQ=255) aaTCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTAttt < 1:477177/141‑1 (MQ=255) aaTCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTAttt < 1:431692/141‑1 (MQ=255) aTCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTAtttt < 1:78895/141‑1 (MQ=255) aTCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTAtttt > 2:188525/1‑141 (MQ=255) cttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAATAATACCCTTTACTAACAACGATTAAGGTGTTatttttt < 2:680439‑M1/70‑2 (MQ=255) aaGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCTTTTAATAACAACGATTAAGGAGTTATTATtgtg > 2:181306/1‑141 (MQ=255) atttAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATCCCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTa < 1:424338/139‑1 (MQ=255) aatgcatatataacaatgttgtgattgcccttgaacttacttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATaa > 2:331641‑M1/57‑141 (MQ=255) gTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATaaa < 1:639559/141‑1 (MQ=255) gTATTAAAATCTAAAGATATTCAATACTTCATTAATTAAAAATACAAAGGTGCAGTTATTCCTGCTAAAGAATACAAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATaaa < 2:297579/141‑1 (MQ=255) cAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTACGGAGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAggg > 2:30000/1‑141 (MQ=255) aaTCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGc < 1:408789/141‑1 (MQ=255) tCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGTTATTGAAAATAAAAAAGGGcaa > 1:336351/1‑140 (MQ=255) tCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGcac > 2:545791/1‑141 (MQ=255) caaaaGATAATCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGcaca < 2:601570/139‑1 (MQ=255) aaaGATATTTAAGAATTAATTAATGAAAAATAGAATGGTGTAGTTATTCTTGTTAAATAATACTAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACaaa < 1:399617/141‑1 (MQ=255) aatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACaaaa > 1:490223‑M1/43‑141 (MQ=255) aaaataaTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATAGTGCAGTTATTACTGCTAAATAATACAAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGAATAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACaaaa < 2:213305/138‑1 (MQ=255) aGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGGGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAg > 1:523499/1‑141 (MQ=255) aGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGAGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATACAAACGGGCACaaacg > 2:403006/1‑139 (MQ=255) gATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGAGCACAAAAgg > 2:475276/1‑141 (MQ=255) atatTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTATTATGGTATTGAAAATAAAAAAGAGCACAAAAgtg > 2:417494/1‑139 (MQ=255) ttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAgggg > 1:645706‑M1/39‑141 (MQ=255) tatTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAgggg < 1:522109/141‑1 (MQ=255) tatTCAAGACTGTATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAgggg < 1:435584/141‑1 (MQ=255) ttCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCa > 1:98779/1‑141 (MQ=255) gattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATGAATTGGTTATAATTCTGGTTTTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGt < 2:369346‑M1/107‑1 (MQ=255) gattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACAATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAACGAGCAAAAAAGGGGCAGt < 2:23572‑M1/107‑1 (MQ=255) cATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCaa < 1:88467/141‑1 (MQ=255) aTTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCaaa < 2:549786/141‑1 (MQ=255) aTTAATGAAAAATACAATAGCGCAGTTAATATTTTTAAATAATACAAATTAAATAATAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGAGGATATTTTTGTGGTATAGAAAAAAAAAAAGTGAACAAAAGGGGCAGTatatcacaa > 2:420694/1‑136 (MQ=255) ttAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAAt > 2:21809/1‑141 (MQ=255) cttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGaa < 1:257286‑M1/124‑1 (MQ=255) aaTACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATAAAAAGATAATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCACATTATCGAAtt > 1:29183/1‑141 (MQ=255) gCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGCATTTTTATCcaaaa > 1:193377/1‑141 (MQ=255) gCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCATTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATAGAAACTAAAAAATTGTTCAAAAGGAGCAGTGGAGGCAAATTATAGAATTTTaaaaacaga > 1:104696/1‑135 (MQ=255) gTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACAAAAAAAt > 2:675605/1‑141 (MQ=255) | AAGTGCGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACAAAAAAAT > USA300TCH1516_ALE/895645‑895924 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |