Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F210 I1 R1
|
4929 |
268.4 |
3907572 |
96.3% |
3762991 |
273.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,455,246 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,455,246 | 0 | A | T | 99.5%
| 515.5
/ NA
| 220 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (101/117); total (103/117) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.66e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,455,247 | 0 | G | C | 99.5%
| 505.2
/ NA
| 220 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (101/117); total (103/117) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.66e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
| * | CP042583 | 1,455,248 | 0 | C | G | 99.6%
| 519.4
/ NA
| 220 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (102/117); total (103/117) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.68e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
TGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTAGTAGCG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCAGCACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGAGTGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCAGCTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCAGTGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTAGCGTCATGAGTGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATATGATGATGGGTGGACTGGCTAACTTTGTTATT > CP042583/1454966‑1455527
|||
tGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTTTGGGCTCGTTGGTc < 1:587855/289‑1 (MQ=255)
attattCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCt > 1:1285017/1‑289 (MQ=255)
attattCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCt > 1:533916/1‑289 (MQ=255)
aTTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCg < 1:544252/289‑1 (MQ=255)
tttGTACTGATCACGCTGATGCGGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCa‑ctac < 2:1178100/289‑1 (MQ=255)
gttatgatgaCGCTGGTGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGa < 2:1125332/285‑1 (MQ=255)
aCTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGaaa > 1:820757/1‑289 (MQ=255)
gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGaaaaaa > 2:1111906/1‑289 (MQ=255)
gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGaaaaaa > 2:1482104/1‑289 (MQ=255)
gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAACAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATCCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGaaaaaa > 2:354426/1‑289 (MQ=255)
cACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCa < 1:105106/274‑1 (MQ=255)
gcgtatgatgTTGAAAAGCAAAGTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTc < 2:1509293/285‑1 (MQ=255)
gCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGt > 2:1158638/1‑288 (MQ=255)
gCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTc < 2:1411687/289‑1 (MQ=255)
gCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTc < 2:1325754/289‑1 (MQ=255)
gCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGGGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGt > 2:718583/1‑288 (MQ=255)
tGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGc > 2:1370423/1‑288 (MQ=255)
tGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGc > 1:641252/1‑288 (MQ=255)
tGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGc < 2:646267/288‑1 (MQ=255)
cTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCa > 1:498115/1‑289 (MQ=255)
ttttGAAAAGCAAATTCCCAAGCCAGTTGGTGGACGCCGGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAATGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCAt < 2:753727/287‑1 (MQ=255)
tGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCACGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTGCCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCAt < 2:565448/289‑1 (MQ=255)
ttGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCa > 1:407891/1‑286 (MQ=255)
ttGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCGTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CGACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCa > 2:1863708/1‑286 (MQ=255)
aaaacaaaaTTCCCCCGCCAGTTGGTGAACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTggg < 2:415078/283‑1 (MQ=255)
aaaGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTggg < 2:1285017/288‑1 (MQ=255)
aGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTa < 1:495254/289‑1 (MQ=255)
aaTTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGGTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTTAGAAGCTGAGGCGTTAAAAACCATCTCTTCTTACAGTATGGGCTCGTTGGTCGTTGACGTTCTTTGTGCCGCATATATTG‑AAAACATGGTACGGCCACTCTGGGTTaaggg > 2:1048247/1‑286 (MQ=255)
cagTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATCCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAAct < 1:354426/286‑1 (MQ=255)
tggtggACGCCCGCGTAACTAATGAGTTACCGCAAATGAACAGCGAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACt < 2:503996/289‑1 (MQ=255)
tggACGGCAGCGTAACTAATGAATGACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTgg < 2:1082728/288‑1 (MQ=255)
ggACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTAGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGc < 1:1046936/288‑1 (MQ=255)
cGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCAt > 1:937653/1‑255 (MQ=255)
ccAGCGTAACTAATGAATTACCGAAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTTGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTGTTAGGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTGATTACAGTATGGGCTCGTTGTTCTGCGTCTTTATTTTTGCTTAA‑TTACTGAAAAACATGGTCCGCCCCATCTGGGCTAATGTTGTAATCTCTTCACTTGCCACAAt > 2:281762/1‑289 (MQ=255)
cGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCgg < 2:1304620/244‑1 (MQ=255)
cGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAAc > 2:320631/1‑288 (MQ=255)
gTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTT‑TCATCGATACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATTCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTTTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAAcag < 1:252594/289‑1 (MQ=255)
aaCTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAAcagc < 1:1324352/288‑1 (MQ=255)
cTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAAcagcag > 2:1774780/1‑288 (MQ=255)
cTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACagcagc < 1:1158638/289‑1 (MQ=255)
aTTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATc < 1:996862/289‑1 (MQ=255)
aTTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATc < 1:1001044/289‑1 (MQ=255)
ccGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTa > 2:495699/1‑287 (MQ=255)
aaaTGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTa < 2:820757/289‑1 (MQ=255)
aaTGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTa > 1:1684576/1‑288 (MQ=255)
tGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTAccc < 1:1896142/289‑1 (MQ=255)
tGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTAccc < 2:274260/289‑1 (MQ=255)
tGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTAccc < 1:884189/289‑1 (MQ=255)
tGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTAccc < 1:1490158/289‑1 (MQ=255)
tGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTAccc < 1:1474451/289‑1 (MQ=255)
aaCAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTAccc < 2:15978/287‑1 (MQ=255)
acaggcaaCCGTTGGTCTGGCTGTAGGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTATCCGCTTTCTCGACCTGTTATGTAGTTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAAAAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCtt < 2:850367/282‑1 (MQ=255)
aCAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCtt < 1:1254041/288‑1 (MQ=255)
cAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTtc > 1:313353/1‑288 (MQ=255)
cAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTa < 1:947526/227‑1 (MQ=255)
cAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTcc > 1:1423145/1‑288 (MQ=255)
cAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATAATCTACCTGTAACCTTCTcc > 1:735461/1‑288 (MQ=255)
gctggAAGGTGTTTCATCGG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGcc > 2:1910519/1‑289 (MQ=255)
tgtttcatcgg‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCt < 2:1273836/277‑1 (MQ=255)
g‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGaaaaaaa > 2:1478269/1‑172 (MQ=255)
g‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATc > 2:941487/1‑186 (MQ=255)
ttCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTctca > 1:1031948/1‑285 (MQ=255)
ttCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTctca > 1:360035/1‑285 (MQ=255)
ttCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTAACCCTCTCCACTGGTTTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTctca > 2:1799748/1‑285 (MQ=255)
tgtAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCAt > 1:1802563/1‑174 (MQ=255)
tgtAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCAt < 2:1802563/174‑1 (MQ=255)
ccGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTggcg > 2:1244814/1‑288 (MQ=255)
ccGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTggcg > 2:919427/1‑288 (MQ=255)
ccGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTggcg > 2:451487/1‑288 (MQ=255)
ttctcgaCCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACagcagc < 2:22146/203‑1 (MQ=255)
ttctcgaCCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACagcagc > 1:22146/7‑209 (MQ=255)
ttctcgaCCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATc > 2:1311525/7‑216 (MQ=255)
ttctcgaCCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTTTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGCGCCTTTGTTGTCGGTTTCTCAGCATCTGGCGGCAttt > 2:1094647/7‑289 (MQ=255)
ttctcgaCCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCAttt > 1:1389687/7‑289 (MQ=255)
tggATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGACTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCAtgtcag > 1:675551/1‑285 (MQ=255)
tGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAaaagcaa > 1:1604882/1‑289 (MQ=255)
tGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTTGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCaaa < 2:1057083/289‑1 (MQ=255)
tatgtcagAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCAc < 1:1111906/281‑1 (MQ=255)
tatgtcagAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCAc < 1:702181/281‑1 (MQ=255)
tatgtcagAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCAc < 1:861442/281‑1 (MQ=255)
tatgtcagAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCAc < 1:1471223/281‑1 (MQ=255)
acggtcagAAGCTGAGCCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTTAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCAc < 1:800535/281‑1 (MQ=255)
atgtcagAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCa < 2:1670880/283‑1 (MQ=255)
tgtcagAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAg < 1:1012936/284‑1 (MQ=255)
aGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTAc < 1:1304844/151‑1 (MQ=255)
aGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTtat < 1:1121592/289‑1 (MQ=255)
tGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTAt < 2:839958/144‑1 (MQ=255)
tGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTAt > 1:839958/1‑144 (MQ=255)
aGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTtata > 2:613264/1‑285 (MQ=255)
aGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATatgat > 1:177167/1‑289 (MQ=255)
aGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATatgat > 1:43427/1‑289 (MQ=255)
ggCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATatgat < 1:389973/288‑1 (MQ=255)
tctcTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATATGATGATGGGTGGACTGGc < 2:1031948/289‑1 (MQ=255)
ctTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATATGATGATGGGTGGACTGGCTaa < 1:1370423/289‑1 (MQ=255)
attaCATTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATATGATGATGGGTGGACTGGCTAACtt < 1:1094647/289‑1 (MQ=255)
attaCAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATATGATGATGGGTGGACTGGCTAACtt < 1:1863708/289‑1 (MQ=255)
gTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCTATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATGGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCTTGTCAGAGTGTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCCACAGTATTTATATGATGATGGGTGGACTGGCTAACTTTGTTAt > 1:1732098/1‑289 (MQ=255)
gTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATATGATGATGGGTGGACTGGCTAACTTTGTTAt > 2:377868/1‑289 (MQ=255)
gTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATATGATGATGAGTGTACTGGCTAACTTTGTTAt > 1:1298900/1‑289 (MQ=255)
tATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATATGATGATGGGTGGACTGGCTAACTTTGTTAtt > 1:1217743/1‑289 (MQ=255)
|||
TGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTTAGTAGCG‑TACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCAGCACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGAGTGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCAGCTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCA‑CTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCAGTGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCGTTAGCGTCATGAGTGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATATGATGATGGGTGGACTGGCTAACTTTGTTATT > CP042583/1454966‑1455527
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A