Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,137,208 |
A→G |
T27T (ACT→ACC) |
talC ← |
putative transaldolase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,137,208 | 0 | A | G | 99.4%
| 1119.8
/ ‑5.3
| 361 | T27T (ACT→ACC) | talC | putative transaldolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/0); new base G (173/185); total (176/185) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.36e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 395 total aligned reads displayed.
AAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCCGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCC > NC_000913/4137118‑4137297
|
aaCAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGggttggtt < 1:4233315/93‑1 (MQ=255)
aaCAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGggttggtt > 1:6151642/1‑93 (MQ=255)
aCAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGgttggttg > 1:1947647/1‑93 (MQ=255)
cAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGt > 1:6390905/1‑93 (MQ=255)
aGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTc > 1:2022175/1‑93 (MQ=255)
gAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGtta > 1:74242/1‑91 (MQ=255)
gAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGtga > 2:149804/1‑91 (MQ=255)
gAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCa > 2:7378570/1‑93 (MQ=255)
gAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCa > 2:5253737/1‑93 (MQ=255)
aaTGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCAc > 2:1430627/1‑93 (MQ=255)
catccCCAAGCCTTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCaa < 1:895635/93‑1 (MQ=255)
catcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCaa > 2:5145702/1‑93 (MQ=255)
atcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAAt > 2:4400394/1‑93 (MQ=255)
caCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATgg < 1:2130944/93‑1 (MQ=255)
cccAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATggg < 1:3075490/92‑1 (MQ=255)
aCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATggg > 1:3485646/1‑93 (MQ=255)
ccAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATgggg < 2:3496584/93‑1 (MQ=255)
aTCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCTGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCTCCCTGGCAATGGGGAat > 2:7048383/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAat < 1:6899444/93‑1 (MQ=255)
aTCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAat > 2:2639719/1‑93 (MQ=255)
tCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAata > 1:508158/1‑93 (MQ=255)
tCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTAGCAATGGGGAata > 1:1325168/1‑93 (MQ=255)
cGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAatat < 1:3718160/93‑1 (MQ=255)
cGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACCTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAatat < 2:6365026/93‑1 (MQ=255)
gCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATg < 2:7500534/93‑1 (MQ=255)
cTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGc > 2:5072729/1‑93 (MQ=255)
cTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGc > 2:3789957/1‑93 (MQ=255)
tttttGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCg > 1:6782327/1‑93 (MQ=255)
tttttGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCg > 2:4449003/1‑93 (MQ=255)
tttttGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCg > 1:1140641/1‑93 (MQ=255)
ttttGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGt > 1:5569406/1‑93 (MQ=255)
ttttGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGt < 1:3140458/93‑1 (MQ=255)
tttGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTg < 1:1388284/93‑1 (MQ=255)
ttGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGc < 1:3015445/93‑1 (MQ=255)
tGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGcc < 2:6785410/93‑1 (MQ=255)
gCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCa < 2:3155302/93‑1 (MQ=255)
cAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAg < 1:7671499/93‑1 (MQ=255)
aCGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACg < 1:4696175/93‑1 (MQ=255)
aCGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACg > 1:3247632/1‑93 (MQ=255)
cgcgGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGt > 1:5589134/1‑93 (MQ=255)
gcgGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGtt > 2:3616017/1‑93 (MQ=255)
gcgGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGtt > 2:1651058/1‑93 (MQ=255)
gcgGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGtt < 1:2316960/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCg > 2:4214955/1‑93 (MQ=255)
gcagcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGa < 1:798769/93‑1 (MQ=255)
gcagcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGa > 1:477417/1‑93 (MQ=255)
gcagcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCAACCCGGCAATGGGGCATATGCGTGCCAGACGTTCgt > 2:2480858/1‑92 (MQ=255)
cagcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGAc < 1:4318011/93‑1 (MQ=255)
gcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACtt > 1:4424094/1‑93 (MQ=255)
caCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTc < 1:2710606/93‑1 (MQ=255)
caCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTc < 2:4067876/93‑1 (MQ=255)
caCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTc < 1:6259206/93‑1 (MQ=255)
cTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTg < 2:853016/93‑1 (MQ=255)
cTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTg < 2:5596410/93‑1 (MQ=255)
cTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTg > 2:298290/1‑93 (MQ=255)
cccATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGa < 2:657310/93‑1 (MQ=255)
cccATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGa < 1:5679585/93‑1 (MQ=255)
cccATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGa > 2:5730337/1‑93 (MQ=255)
cccATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGa > 2:3347639/1‑93 (MQ=255)
ccATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGAc > 2:7674322/1‑93 (MQ=255)
cATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACg > 1:3949384/1‑93 (MQ=255)
tGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAg > 2:5970098/1‑93 (MQ=255)
ggACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGc > 2:7574844/1‑93 (MQ=255)
ggACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCCGCGACGTTAGc > 2:4712212/1‑93 (MQ=255)
gACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCg > 1:4969547/1‑93 (MQ=255)
aCTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCATGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCgg < 2:157255/93‑1 (MQ=255)
cTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGgt > 2:1912244/1‑93 (MQ=255)
cTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGgt < 1:1636019/93‑1 (MQ=255)
tCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGgtg > 1:3842939/1‑93 (MQ=255)
tCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGgtg > 2:2370451/1‑93 (MQ=255)
ccTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGgtgt > 2:1254439/1‑93 (MQ=255)
cTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTc > 1:1781412/1‑93 (MQ=255)
cTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTc > 2:7152641/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCa < 1:1426360/93‑1 (MQ=255)
tGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCa < 2:7769817/93‑1 (MQ=255)
tGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCa > 2:3267518/1‑93 (MQ=255)
cTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGa < 1:3977063/93‑1 (MQ=255)
cTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGa < 2:2851234/93‑1 (MQ=255)
cTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGa < 1:169350/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGAt < 2:1053476/93‑1 (MQ=255)
gCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATAc < 1:6043294/93‑1 (MQ=255)
cAGCTATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACa < 1:7594491/93‑1 (MQ=255)
cAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGGGTCCAGATACa > 1:1024102/1‑93 (MQ=255)
gCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGt < 1:588381/93‑1 (MQ=255)
gCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGt > 2:6736576/1‑93 (MQ=255)
gATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTc < 2:6098218/93‑1 (MQ=255)
gATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTc > 2:622699/1‑93 (MQ=255)
gATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTc < 1:2491229/93‑1 (MQ=255)
aTAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTcc > 1:6727652/1‑93 (MQ=255)
tAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCa > 1:6517953/1‑93 (MQ=255)
tGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCatga < 1:7048384/93‑1 (MQ=255)
tGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCatga < 1:7311425/93‑1 (MQ=255)
cTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCatgatg < 2:2800750/93‑1 (MQ=255)
tCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGt < 1:5370561/93‑1 (MQ=255)
tCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGt > 1:661992/1‑93 (MQ=255)
cGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGtt < 2:6940007/93‑1 (MQ=255)
ggttggttGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTc < 2:2187027/93‑1 (MQ=255)
ggttggttGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTc > 1:2872021/1‑93 (MQ=255)
gttggttgTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTcc < 2:5810108/93‑1 (MQ=255)
gttggttgTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTcc > 2:5515692/1‑93 (MQ=255)
|
AAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCCGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCC > NC_000913/4137118‑4137297
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 217 total aligned reads displayed.
AGCAAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCCGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTT > NC_000913/4137115‑4137301
|
AGCAAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTG > SRR4302543.522134/1‑94 (MQ=60)
AGCAAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTG > SRR4302543.5739506/1‑94 (MQ=60)
AGCAAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTG < SRR4302543.588100/94‑1 (MQ=60)
GCAAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGG < SRR4302543.4764388/94‑1 (MQ=60)
GCAAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGG < SRR4302543.2654495/94‑1 (MQ=60)
GCAAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGG < SRR4302543.2654496/94‑1 (MQ=60)
GCAAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGG > SRR4302543.2738829/1‑94 (MQ=60)
GCAAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGG < SRR4302543.228591/94‑1 (MQ=60)
AAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTT < SRR4302543.7411387/94‑1 (MQ=60)
AAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTT > SRR4302543.619861/1‑94 (MQ=60)
AAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTT > SRR4302543.2845986/1‑94 (MQ=60)
AAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTT > SRR4302543.6209883/1‑94 (MQ=60)
AACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTG > SRR4302543.1965127/1‑94 (MQ=60)
ACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGT > SRR4302543.6451062/1‑94 (MQ=60)
ACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGT > SRR4302543.3587051/1‑94 (MQ=60)
CAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTC > SRR4302543.6473406/1‑94 (MQ=60)
CAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTC > SRR4302543.2040345/1‑94 (MQ=60)
CAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTC < SRR4302543.244236/94‑1 (MQ=60)
AGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTTA > SRR4302543.74918/1‑94 (MQ=60)
AGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCA > SRR4302543.6286696/1‑94 (MQ=60)
AGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGGTGTCA > SRR4302543.4332278/1‑94 (MQ=60)
GAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCAC > SRR4302543.3692730/1‑94 (MQ=60)
AATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACC > SRR4302543.6948667/1‑94 (MQ=60)
AATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACC < SRR4302543.3185218/94‑1 (MQ=60)
ATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCC > SRR4302543.270334/1‑94 (MQ=60)
TGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT < SRR4302543.426019/94‑1 (MQ=60)
CCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGG < SRR4302543.3074461/94‑1 (MQ=60)
CCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGC < SRR4302543.4363005/94‑1 (MQ=60)
CCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGC < SRR4302543.2498717/94‑1 (MQ=60)
CCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGC < SRR4302543.871232/94‑1 (MQ=60)
CTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCA > SRR4302543.5399290/1‑94 (MQ=60)
catccccaagcctTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAAT < SRR4302543.903545/81‑1 (MQ=60)
CATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAAT < SRR4302543.5681621/94‑1 (MQ=60)
CATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAAT < SRR4302543.4755819/94‑1 (MQ=60)
ATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATG > SRR4302543.4029047/1‑94 (MQ=60)
ATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATG > SRR4302543.5693015/1‑94 (MQ=60)
TCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGG < SRR4302543.3430575/94‑1 (MQ=60)
CACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGG > SRR4302543.3516857/1‑94 (MQ=60)
CACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGG < SRR4302543.7714306/94‑1 (MQ=60)
CACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGG < SRR4302543.2150020/94‑1 (MQ=60)
CCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGG < SRR4302543.3103149/94‑1 (MQ=60)
ACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGG < SRR4302543.2035591/94‑1 (MQ=60)
CAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAA < SRR4302543.4859069/94‑1 (MQ=60)
CAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAA > SRR4302543.3990505/1‑94 (MQ=60)
AATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAAT > SRR4302543.7133689/1‑94 (MQ=60)
AATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAAT > SRR4302543.4453253/1‑94 (MQ=60)
ATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATA > SRR4302543.512880/1‑94 (MQ=60)
ATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATA < SRR4302543.6964281/94‑1 (MQ=60)
ATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTAGCAATGGGGAATA > SRR4302543.1336932/1‑94 (MQ=60)
TCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATAT < SRR4302543.843686/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATG > SRR4302543.1778575/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATG < SRR4302543.1469456/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATG < SRR4302543.3828937/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATG < SRR4302543.3750858/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCGCATATGGACTCCTTGCTTGCAGCGATAATGCTCGGTTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGTAATATGC < SRR4302543.1397030/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGC < SRR4302543.1989382/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTCGCAATGGGGAATATGC > SRR4302543.3935729/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCG > SRR4302543.6846379/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCG > SRR4302543.1151031/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCG > SRR4302543.1342083/1‑94 (MQ=60)
TTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGT < SRR4302543.6283088/94‑1 (MQ=60)
TTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGT > SRR4302543.563307/1‑94 (MQ=60)
TTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGT > SRR4302543.5620081/1‑94 (MQ=60)
TTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCGATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTG < SRR4302543.3168703/94‑1 (MQ=60)
TTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTG < SRR4302543.3168704/94‑1 (MQ=60)
TTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGC < SRR4302543.1033334/94‑1 (MQ=60)
TTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGC < SRR4302543.1400779/94‑1 (MQ=60)
TTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCC < SRR4302543.3042730/94‑1 (MQ=60)
TCAGACGCGGCAGCACTTCGCATATGGACGCCGTGCTGGGCGCCATAATGCTCGGGTTGGGTGTCCCCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAG < SRR4302543.5324393/94‑1 (MQ=40)
GCAGACGCTGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGATGGCAGCGATCATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAG < SRR4302543.1932515/94‑1 (MQ=60)
GCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAG < SRR4302543.5324395/94‑1 (MQ=60)
CAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGA > SRR4302543.733680/1‑94 (MQ=60)
CAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGA > SRR4302543.6941841/1‑94 (MQ=60)
CAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGA < SRR4302543.2074165/94‑1 (MQ=60)
CAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGA < SRR4302543.7744189/94‑1 (MQ=60)
CAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGA < SRR4302543.7744190/94‑1 (MQ=60)
AGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGAC > SRR4302543.1589400/1‑94 (MQ=60)
AGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGAC > SRR4302543.4761588/1‑94 (MQ=60)
AGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGAC < SRR4302543.7202001/94‑1 (MQ=60)
GACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACG > SRR4302543.3276991/1‑94 (MQ=60)
ACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGT > SRR4302543.5640048/1‑94 (MQ=60)
ACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGT < SRR4302543.7415840/94‑1 (MQ=60)
CGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTT > SRR4302543.507377/1‑94 (MQ=60)
GCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTC < SRR4302543.2338025/94‑1 (MQ=60)
GCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTC < SRR4302543.7954323/94‑1 (MQ=60)
GGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGA < SRR4302543.5895434/94‑1 (MQ=60)
GGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGA > SRR4302543.481829/1‑94 (MQ=60)
GGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGA > SRR4302543.6974713/1‑94 (MQ=60)
GCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGAC < SRR4302543.805794/94‑1 (MQ=60)
CAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACT < SRR4302543.4357225/94‑1 (MQ=60)
AGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTT > SRR4302543.4464186/1‑94 (MQ=60)
GCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGAAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTC < SRR4302543.7065230/94‑1 (MQ=60)
CACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGCCTTCT > SRR4302543.2282846/1‑94 (MQ=60)
CACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCT < SRR4302543.6318242/94‑1 (MQ=60)
CACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCT > SRR4302543.1405422/1‑94 (MQ=60)
CACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCT < SRR4302543.325673/94‑1 (MQ=60)
CACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCT < SRR4302543.2735219/94‑1 (MQ=60)
ACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTG > SRR4302543.1370718/1‑94 (MQ=60)
ACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTG > SRR4302543.3997381/1‑94 (MQ=60)
CTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGC > SRR4302543.6823190/1‑94 (MQ=60)
CTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGC > SRR4302543.6797542/1‑94 (MQ=60)
CTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGC > SRR4302543.5886791/1‑94 (MQ=60)
TTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCG > SRR4302543.2568517/1‑94 (MQ=60)
TCCCATATGGACTCCTCGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGA < SRR4302543.1686022/94‑1 (MQ=60)
CCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGAC < SRR4302543.655790/94‑1 (MQ=60)
CCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGAC < SRR4302543.115643/94‑1 (MQ=60)
CCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGAC < SRR4302543.5731430/94‑1 (MQ=60)
CCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACG > SRR4302543.3984314/1‑94 (MQ=60)
CATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGT > SRR4302543.1157374/1‑94 (MQ=60)
ATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTT > SRR4302543.2035323/1‑94 (MQ=60)
ATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTT < SRR4302543.3040042/94‑1 (MQ=60)
ATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTT < SRR4302543.4619484/94‑1 (MQ=60)
ATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTT > SRR4302543.6280825/1‑94 (MQ=60)
ATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGCTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGCTCGACTTCTGCGACGTT > SRR4302543.3154712/1‑94 (MQ=60)
TATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTA < SRR4302543.7740482/94‑1 (MQ=60)
TATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTA < SRR4302543.1101638/94‑1 (MQ=60)
TATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTA < SRR4302543.2819135/94‑1 (MQ=60)
TATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTA < SRR4302543.6189202/94‑1 (MQ=60)
TATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTA < SRR4302543.4295545/94‑1 (MQ=60)
TATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTA < SRR4302543.4656269/94‑1 (MQ=60)
TATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTA > SRR4302543.4767745/1‑94 (MQ=60)
TATGCACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCGCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTA < SRR4302543.6188961/94‑1 (MQ=60)
ATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAG < SRR4302543.3432960/94‑1 (MQ=60)
ATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAG < SRR4302543.1841516/94‑1 (MQ=60)
ATGGACTCCGTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAG < SRR4302543.2145837/94‑1 (MQ=60)
TGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGC > SRR4302543.7992356/1‑94 (MQ=60)
TGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGC > SRR4302543.7563726/1‑94 (MQ=60)
GGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCG > SRR4302543.5014775/1‑94 (MQ=60)
GGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCG < SRR4302543.5634044/94‑1 (MQ=60)
GACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGG > SRR4302543.4126168/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTG < SRR4302543.2196541/94‑1 (MQ=60)
CTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTG < SRR4302543.6816054/94‑1 (MQ=60)
CTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTG > SRR4302543.7534179/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTG < SRR4302543.244720/94‑1 (MQ=60)
CTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTG < SRR4302543.6470335/94‑1 (MQ=60)
CTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTG < SRR4302543.1650614/94‑1 (MQ=60)
CTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTG > SRR4302543.3071178/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTG < SRR4302543.2180391/94‑1 (MQ=60)
CTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTG > SRR4302543.3876875/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTG > SRR4302543.6724848/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTG > SRR4302543.6724849/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTG > SRR4302543.4831248/1‑94 (MQ=60)
TCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGT > SRR4302543.7030215/1‑94 (MQ=60)
CCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTC < SRR4302543.5658744/94‑1 (MQ=60)
CCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTC > SRR4302543.1797341/1‑94 (MQ=60)
CCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTC > SRR4302543.3919934/1‑94 (MQ=60)
CCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTC > SRR4302543.1678268/1‑94 (MQ=60)
CCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTC > SRR4302543.877268/1‑94 (MQ=60)
CCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTC > SRR4302543.3064952/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAG < SRR4302543.1439267/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAG < SRR4302543.3388105/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGAT < SRR4302543.4012329/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGAT < SRR4302543.170801/94‑1 (MQ=60)
GCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACA < SRR4302543.4329354/94‑1 (MQ=60)
GCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACA < SRR4302543.6100494/94‑1 (MQ=60)
GCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACA > SRR4302543.3104407/1‑94 (MQ=60)
GCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGGGTCCAGATACA > SRR4302543.1033167/1‑94 (MQ=60)
CAGCTATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAG < SRR4302543.7666644/94‑1 (MQ=60)
CAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAG < SRR4302543.5590394/94‑1 (MQ=60)
CAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAG < SRR4302543.2976757/94‑1 (MQ=60)
AGCGATAATGCTTGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGT > SRR4302543.6420153/1‑94 (MQ=60)
AGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGT > SRR4302543.7650758/1‑94 (MQ=60)
AGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGT > SRR4302543.6023118/1‑94 (MQ=60)
GCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTT < SRR4302543.6950693/94‑1 (MQ=60)
GCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTT < SRR4302543.593759/94‑1 (MQ=60)
GCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTT < SRR4302543.5225987/94‑1 (MQ=60)
GCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCCGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTT > SRR4302543.5869017/1‑94 (MQ=60)
CGATAATGCTCGGGTTGGTTGNCNCCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTC < SRR4302543.1587950/94‑1 (MQ=60)
GATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCC < SRR4302543.2795582/94‑1 (MQ=60)
GATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCC < SRR4302543.2513809/94‑1 (MQ=60)
GATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCC > SRR4302543.6791214/1‑94 (MQ=60)
ATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCA < SRR4302543.5024402/94‑1 (MQ=60)
ATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCA > SRR4302543.6579335/1‑94 (MQ=60)
TAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCAT < SRR4302543.7427799/94‑1 (MQ=60)
TAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCAT > SRR4302543.1405586/1‑94 (MQ=60)
AATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATG < SRR4302543.3890308/94‑1 (MQ=60)
AATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATG < SRR4302543.3702937/94‑1 (MQ=60)
ATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGG > SRR4302543.609674/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCGGGTTGGTTGTCGCCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGA < SRR4302543.6445383/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGAT < SRR4302543.5529116/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGAT < SRR4302543.4927089/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGAT < SRR4302543.4426446/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGAT < SRR4302543.7381900/94‑1 (MQ=60)
GCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATG > SRR4302543.1716826/1‑94 (MQ=60)
CTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGT > SRR4302543.668074/1‑94 (MQ=60)
CTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGT > SRR4302543.1865630/1‑94 (MQ=60)
TCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTT < SRR4302543.5419188/94‑1 (MQ=60)
CGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTT > SRR4302543.660418/1‑94 (MQ=60)
GGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTC > SRR4302543.1664805/1‑94 (MQ=60)
GGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTC > SRR4302543.4647425/1‑94 (MQ=60)
GGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTC > SRR4302543.2898173/1‑94 (MQ=60)
GGGTTAGTGATCACCCCGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTC < SRR4302543.6619860/94‑1 (MQ=60)
GGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCC < SRR4302543.5454987/94‑1 (MQ=60)
GGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCC < SRR4302543.3997788/94‑1 (MQ=60)
GGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCC < SRR4302543.1151353/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCT > SRR4302543.3138724/1‑94 (MQ=60)
TGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTT < SRR4302543.1452308/94‑1 (MQ=60)
TGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTT < SRR4302543.2253366/94‑1 (MQ=60)
GGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTT > SRR4302543.5925433/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTT < SRR4302543.2859226/94‑1 (MQ=60)
|
AGCAAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCCGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTT > NC_000913/4137115‑4137301
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |