Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,121,069 |
C→T |
G323D (GGC→GAC) |
cytR ← |
CytR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,121,069 | 0 | C | T | 100.0%
| 846.4
/ NA
| 241 | G323D (GGC→GAC) | cytR | CytR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (134/107); total (134/107) |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
TTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGCCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGTTGTC > NC_000913/4120979‑4121158
|
tGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCAc < 2:1405333/93‑1 (MQ=255)
tGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCAc > 1:3339213/1‑93 (MQ=255)
tGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCAc < 2:3878102/93‑1 (MQ=255)
gACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACt > 2:4661698/1‑93 (MQ=255)
gACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACt < 1:3082883/93‑1 (MQ=255)
ccAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGc < 1:1521590/93‑1 (MQ=255)
ccAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGc < 2:1514648/93‑1 (MQ=255)
aGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCa > 1:4058438/1‑93 (MQ=255)
gTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCaa < 2:4289156/93‑1 (MQ=255)
cACGGCATTCTTAAAGGTTTACTGTAAGTTAGCGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTGGCAGTCCATTAACCGAGAGTCACTGCCAACg < 2:2307312/93‑1 (MQ=255)
aCGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACgt < 1:2062160/93‑1 (MQ=255)
cGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACgtg < 2:3383839/93‑1 (MQ=255)
cGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACgtg < 1:2739723/93‑1 (MQ=255)
ggCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACgtgt > 1:1097881/1‑93 (MQ=255)
ggCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACgtgt > 2:2063021/1‑93 (MQ=255)
ggCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACgtgt > 1:1931831/1‑93 (MQ=255)
gTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGcc > 2:1100656/1‑93 (MQ=255)
ttttAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAAGCACTGCCAACGTGTTGccc > 2:3046701/3‑93 (MQ=255)
cTTAAAGTTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGcccc < 2:1743474/93‑1 (MQ=255)
ttAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCt > 2:3548731/1‑93 (MQ=255)
ttAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCt > 2:3832877/1‑93 (MQ=255)
tAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTg > 2:4036918/1‑93 (MQ=255)
aaGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCa < 1:506598/93‑1 (MQ=255)
aaGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCa > 2:2549348/1‑93 (MQ=255)
aaGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCa < 2:1457275/93‑1 (MQ=255)
aGGTTTACTTTAAGGTAACGCGTGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCAt < 2:2051879/93‑1 (MQ=255)
ggTTTACTTTAAGTTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCAtt < 2:2814246/93‑1 (MQ=255)
ggTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCAtt > 1:4287048/1‑93 (MQ=255)
aCTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATc < 1:2501647/93‑1 (MQ=255)
cTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCa > 1:2141106/1‑93 (MQ=255)
tttAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCaa < 2:704812/93‑1 (MQ=255)
tttAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCaa > 2:1022373/1‑93 (MQ=255)
tttAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCaa < 1:1147097/93‑1 (MQ=255)
tttAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCaa < 1:1644106/93‑1 (MQ=255)
tttAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGATCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCaa > 2:4166733/1‑93 (MQ=255)
ttAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAg > 2:4369312/1‑93 (MQ=255)
ttAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAg > 2:1613179/1‑93 (MQ=255)
aGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCaa > 2:4630974/1‑93 (MQ=255)
aGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCaa < 2:3368108/93‑1 (MQ=255)
aGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCaa > 2:1208400/1‑93 (MQ=255)
gTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATa < 2:2970844/93‑1 (MQ=255)
gTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATa > 2:1950618/1‑93 (MQ=255)
tAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATaa < 1:3242949/93‑1 (MQ=255)
aaCGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAAc > 1:2276041/1‑93 (MQ=255)
aaCGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAAc < 2:2691060/93‑1 (MQ=255)
aCGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACa < 2:89610/93‑1 (MQ=255)
aCGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACa > 2:3642368/1‑93 (MQ=255)
aCGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACa < 1:4281279/93‑1 (MQ=255)
cacgTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCa < 1:2860970/91‑1 (MQ=255)
gcgTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCAt < 2:1972534/93‑1 (MQ=255)
ctttttGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTCGATCAAGCAATAACAGCATa < 2:4513196/89‑1 (MQ=255)
gtgtTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAg > 1:2188330/1‑93 (MQ=255)
gtgtTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAg > 1:137521/1‑93 (MQ=255)
tgtTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGc > 1:3946164/1‑93 (MQ=255)
tgtTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGc > 1:4481523/1‑93 (MQ=255)
gtTGACCCCCGGATGATAGGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAAGAACAGCATAGCt < 2:4649566/93‑1 (MQ=255)
ttGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCtt > 1:541089/1‑93 (MQ=255)
ttGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCtt > 2:846397/1‑93 (MQ=255)
tGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTc < 2:3085896/93‑1 (MQ=255)
gATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTcc > 1:2018310/1‑93 (MQ=255)
tCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCccg > 2:3261610/1‑93 (MQ=255)
cGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCccgaccg > 2:3688720/1‑93 (MQ=255)
atgatAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGAtt < 2:434577/93‑1 (MQ=255)
tgatAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGAttt < 1:70430/93‑1 (MQ=255)
tgatAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGAttt > 2:2942918/1‑93 (MQ=255)
tgatAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGAttt > 2:3598702/1‑93 (MQ=255)
tgatAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGAttt > 1:2917156/1‑93 (MQ=255)
agatAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGAttt < 2:1171103/92‑1 (MQ=255)
gatAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTc < 1:4017611/93‑1 (MQ=255)
atAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGTCCCTGCATTTGATCAAGCAATCACAGCCTAGCTTCCCGACCGATTTCg > 2:1865659/1‑93 (MQ=255)
aaGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTa < 1:3768251/93‑1 (MQ=255)
aGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTaa > 1:1213251/1‑93 (MQ=255)
ttCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAAcg < 1:2652799/93‑1 (MQ=255)
tCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAAcgc > 2:2189181/1‑93 (MQ=255)
cGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAAcgcg > 2:3286498/1‑93 (MQ=255)
gCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCgg > 1:2595241/1‑93 (MQ=255)
gCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCgg > 1:2406009/1‑93 (MQ=255)
gCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCgg > 2:636783/1‑93 (MQ=255)
cAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGc > 2:1792166/1‑93 (MQ=255)
cAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGc < 2:1264266/93‑1 (MQ=255)
aGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCt > 1:388920/1‑93 (MQ=255)
aGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCt < 2:3418300/93‑1 (MQ=255)
gTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTg > 1:3465981/1‑93 (MQ=255)
tCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTgc < 2:2732890/93‑1 (MQ=255)
cATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTgcgc > 2:2122397/1‑93 (MQ=255)
cATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTgcgc > 2:1892553/1‑93 (MQ=255)
cATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTgcgc < 1:3838789/93‑1 (MQ=255)
ttAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGa < 2:2324665/93‑1 (MQ=255)
ttAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGa < 1:2765735/93‑1 (MQ=255)
ttAAACGAGAGTCACTGCCAACGCGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGa > 1:3096489/1‑93 (MQ=255)
tAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGAt < 1:3426686/93‑1 (MQ=255)
tAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGAt > 1:786431/1‑93 (MQ=255)
tAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGAt < 1:4340509/93‑1 (MQ=255)
tAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTGCGTAACGCGGCTGCGCGAt < 2:4562058/93‑1 (MQ=255)
aaaCGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGGCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATg > 1:1699608/1‑93 (MQ=255)
aaCGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATgg < 2:505435/93‑1 (MQ=255)
aCGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGt < 1:919215/93‑1 (MQ=255)
gagaGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGTTg > 2:4070331/1‑93 (MQ=255)
agagTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGTTGt < 1:3655262/93‑1 (MQ=255)
agagTCACAGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGTTGt > 1:884545/1‑93 (MQ=255)
|
TTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGCCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGTTGTC > NC_000913/4120979‑4121158
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGCCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGTTGTCAGCG > NC_000913/4120976‑4121162
|
CTTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTGGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGT < SRR4302535.819696/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGT < SRR4302535.4467899/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGT < SRR4302535.3341981/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGT > SRR4302535.2042419/1‑94 (MQ=60)
CCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGT < SRR4302535.981679/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGT < SRR4302535.648231/94‑1 (MQ=60)
CTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTC < SRR4302535.644436/94‑1 (MQ=60)
CTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTC > SRR4302535.1988386/1‑94 (MQ=60)
CTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTC > SRR4302535.514113/1‑94 (MQ=60)
CTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTC > SRR4302535.2371916/1‑94 (MQ=60)
TTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCAC > SRR4302535.3362473/1‑94 (MQ=60)
TGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACT < SRR4302535.820875/94‑1 (MQ=60)
GACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTG < SRR4302535.3104366/94‑1 (MQ=60)
CCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCC < SRR4302535.1532549/94‑1 (MQ=60)
CAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCA > SRR4302535.4086217/1‑94 (MQ=60)
CAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCA < SRR4302535.3114279/94‑1 (MQ=60)
AGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAA > SRR4302535.268357/1‑94 (MQ=60)
GTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAAC < SRR4302535.872554/94‑1 (MQ=60)
GTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAAC > SRR4302535.939377/1‑94 (MQ=60)
GTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAAC > SRR4302535.1368511/1‑94 (MQ=60)
CACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGT > SRR4302535.1159222/1‑94 (MQ=60)
ACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTG < SRR4302535.2077027/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGT < SRR4302535.2759255/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGT > SRR4302535.1945752/1‑94 (MQ=60)
CGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGT > SRR4302535.1105696/1‑94 (MQ=60)
GGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTT < SRR4302535.154907/94‑1 (MQ=60)
CAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGC > SRR4302535.1565792/1‑94 (MQ=60)
GTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCC > SRR4302535.3796961/1‑94 (MQ=60)
CTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCT < SRR4302535.2753042/94‑1 (MQ=60)
CTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCT < SRR4302535.2596897/94‑1 (MQ=60)
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TTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTG > SRR4302535.1320071/1‑94 (MQ=60)
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TAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGC > SRR4302535.3444896/1‑94 (MQ=60)
TAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGC > SRR4302535.1665417/1‑94 (MQ=60)
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GGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTT > SRR4302535.2897417/1‑94 (MQ=60)
GTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTG < SRR4302535.373975/94‑1 (MQ=60)
TTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGA > SRR4302535.3994496/1‑94 (MQ=60)
TTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGAT > SRR4302535.1899108/1‑94 (MQ=60)
TACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATC > SRR4302535.2190121/1‑94 (MQ=60)
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ACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCA > SRR4302535.2156517/1‑94 (MQ=60)
CTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAA > SRR4302535.4041303/1‑94 (MQ=60)
CTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAA > SRR4302535.2761695/1‑94 (MQ=60)
TTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAG < SRR4302535.1155270/94‑1 (MQ=60)
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TAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCA > SRR4302535.2190120/1‑94 (MQ=60)
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GTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAA < SRR4302535.3354110/94‑1 (MQ=60)
TAGCGCGCGTGTTGATGCCCGGATTATAAGTCCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAAC < SRR4302535.4312848/94‑1 (MQ=60)
TAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAAC > SRR4302535.2292292/1‑94 (MQ=60)
TAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAAC > SRR4302535.3421298/1‑94 (MQ=60)
TAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAAC > SRR4302535.2292291/1‑94 (MQ=60)
TAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAAC < SRR4302535.89736/94‑1 (MQ=60)
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ACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAG < SRR4302535.4310573/94‑1 (MQ=60)
CGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGC > SRR4302535.1111732/1‑94 (MQ=60)
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CGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTGGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCAT < SRR4302535.4099532/94‑1 (MQ=60)
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CGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCAT < SRR4302535.2521399/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCAT < SRR4302535.2812030/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCAT < SRR4302535.204251/94‑1 (MQ=60)
CACGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCAT < SRR4302535.2881238/94‑1 (MQ=60)
CGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAG > SRR4302535.138484/1‑94 (MQ=60)
CGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAG > SRR4302535.2203916/1‑94 (MQ=60)
CGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAG < SRR4302535.2501427/94‑1 (MQ=60)
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GTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGC > SRR4302535.3973112/1‑94 (MQ=60)
GTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGC > SRR4302535.1819023/1‑94 (MQ=60)
TGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGAAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCT < SRR4302535.4568505/94‑1 (MQ=60)
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GTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTT > SRR4302535.3023084/1‑94 (MQ=60)
TGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCC > SRR4302535.2032853/1‑94 (MQ=60)
ATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCG < SRR4302535.619684/94‑1 (MQ=60)
CCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGAC > SRR4302535.3867462/1‑94 (MQ=60)
CGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGA < SRR4302535.4144863/94‑1 (MQ=60)
GGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGAT > SRR4302535.2251527/1‑94 (MQ=60)
ATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTT > SRR4302535.2937748/1‑94 (MQ=60)
TGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTC < SRR4302535.70946/94‑1 (MQ=60)
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AGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAAC > SRR4302535.519763/1‑94 (MQ=60)
AGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAAC < SRR4302535.4429232/94‑1 (MQ=60)
GTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACG < SRR4302535.3887608/94‑1 (MQ=60)
TTCGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGC < SRR4302535.2671803/94‑1 (MQ=60)
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CGCAGTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGG > SRR4302535.2423325/1‑94 (MQ=60)
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GTCCATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGC > SRR4302535.3079547/1‑94 (MQ=60)
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ATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGA > SRR4302535.2840330/1‑94 (MQ=60)
ATTAAACGAGAGTCACTGCCAACGCGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGA > SRR4302535.3118053/1‑94 (MQ=60)
TTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGAT < SRR4302535.2785431/94‑1 (MQ=60)
TTAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGAT > SRR4302535.791943/1‑94 (MQ=60)
TAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGGCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATG > SRR4302535.1711890/1‑94 (MQ=60)
TAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATG < SRR4302535.3450510/94‑1 (MQ=60)
TAAACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATG < SRR4302535.4370197/94‑1 (MQ=60)
AGACGAGAGTCACTTCCAACGTGTTGCCCATGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGG < SRR4302535.3731420/94‑1 (MQ=60)
AACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGT > SRR4302535.4050779/1‑94 (MQ=60)
AACGAGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGT < SRR4302535.3489746/94‑1 (MQ=60)
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GAGAGTCACAGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGTTGT > SRR4302535.890803/1‑94 (MQ=60)
AGAGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGTTGTC < SRR4302535.3680563/94‑1 (MQ=60)
AGTCACTGCCAACGTTTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAACAAAGCTTCCCGACCGATTTCATAACGCGGCTGCGCGATGGTTGTCAG < SRR4302535.1423304/94‑1 (MQ=60)
AGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGTTGTCAG > SRR4302535.4216871/1‑94 (MQ=60)
AGTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGTTGTCAG < SRR4302535.2486781/94‑1 (MQ=60)
GTCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGTTGTCAGC < SRR4302535.2396971/94‑1 (MQ=60)
TCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGTTGTCAGCG > SRR4302535.3657060/1‑94 (MQ=60)
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CCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGCCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGATCAAGCAATAACAGCATAGCTTCCCGACCGATTTCGTAACGCGGCTGCGCGATGGTTGTCAGCG > NC_000913/4120976‑4121162
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
