Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,128,011 |
C→T |
A199A (GCC→GCT) |
metL → |
aspartokinase II |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,128,011 | 0 | C | T | 100.0%
| 800.8
/ NA
| 220 | A199A (GCC→GCT) | metL | aspartokinase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (102/118); total (102/118) |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTG > NC_000913/4127921‑4128100
|
aGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTgg > 1:4573381/1‑93 (MQ=255)
aGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTgg < 1:3884179/93‑1 (MQ=255)
aGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTgg > 2:3423920/1‑93 (MQ=255)
gCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGa < 2:3804858/93‑1 (MQ=255)
gCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGa > 1:3814755/1‑93 (MQ=255)
gtttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGaa < 1:3729335/92‑1 (MQ=255)
tttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGaaa > 2:3145836/1‑93 (MQ=255)
tttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGaaa < 2:4361171/93‑1 (MQ=255)
ttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAc < 1:4532174/93‑1 (MQ=255)
tCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACg > 2:1371629/1‑93 (MQ=255)
tCTTACCCGTGCCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCACAACAACGCTGGTGAAACg < 2:4566007/93‑1 (MQ=255)
cTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACgg < 1:4115416/93‑1 (MQ=255)
cTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGCGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGACTTATCAGCGGCAACAACGCTGGGGAAACgg > 1:747387/1‑93 (MQ=255)
ttACGCGTTGCTGCAACAGCTGCTGCTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGCCCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGt < 2:203963/93‑1 (MQ=255)
ttACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGt > 1:4379468/1‑93 (MQ=255)
ttACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGt < 2:2187838/93‑1 (MQ=255)
ttACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGt < 2:2979720/93‑1 (MQ=255)
ttACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGt > 2:1030512/1‑93 (MQ=255)
tACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtg < 1:2315218/93‑1 (MQ=255)
tACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtg > 1:444370/1‑93 (MQ=255)
tcccGTTGCCGGAACAGCTTCTGGTCCAAACTCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgc < 2:1884428/92‑1 (MQ=255)
aCCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgc < 1:4351326/93‑1 (MQ=255)
aCCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgc > 1:719316/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGctgctg > 1:1223718/1‑93 (MQ=255)
tgctgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTgg < 1:526578/93‑1 (MQ=255)
tgctgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTgg < 2:1828786/93‑1 (MQ=255)
gctgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTggg < 1:2567109/93‑1 (MQ=255)
tgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGc > 2:2326736/1‑93 (MQ=255)
tgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGc > 1:2433826/1‑93 (MQ=255)
gcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCg < 2:802547/93‑1 (MQ=255)
cAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGt > 1:2800240/1‑93 (MQ=255)
aaCAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTa < 2:4369960/93‑1 (MQ=255)
cAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAAc < 2:3632401/93‑1 (MQ=255)
gctgctGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTTAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACgg > 1:565049/1‑93 (MQ=255)
tgctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGtt > 1:1259044/1‑93 (MQ=255)
ctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTcc < 2:3386514/93‑1 (MQ=255)
ggTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTccta > 2:1203116/1‑91 (MQ=255)
gTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGAc < 2:476558/93‑1 (MQ=255)
tGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACt > 1:2863989/1‑93 (MQ=255)
gCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTa > 2:1547906/1‑93 (MQ=255)
gCAACATCCGCCCAGCCGTCTGGTGGTAACCGGATTTAGCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTa < 2:2656558/93‑1 (MQ=255)
aaCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAtt > 1:3464274/1‑93 (MQ=255)
aaCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAtt < 1:1757280/93‑1 (MQ=255)
aaCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAtt < 1:3044774/93‑1 (MQ=255)
aCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTc > 2:2544834/1‑93 (MQ=255)
aCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTc > 1:4294389/1‑93 (MQ=255)
aCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTc < 1:1043724/93‑1 (MQ=255)
cATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTcc > 1:3207647/1‑93 (MQ=255)
cATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTcc < 2:3866351/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGATTATTCcg > 2:3091513/1‑93 (MQ=255)
aTCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCcg > 1:1518511/1‑93 (MQ=255)
tCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCcgc > 1:2652424/1‑93 (MQ=255)
cGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGa < 2:2157259/93‑1 (MQ=255)
gggCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGac > 1:3193904/1‑93 (MQ=255)
gggCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGac > 2:3560161/1‑93 (MQ=255)
gCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGacac < 2:2866579/93‑1 (MQ=255)
cAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGAcaca < 2:2301911/93‑1 (MQ=255)
cAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGAcaca > 1:1179865/1‑93 (MQ=255)
cAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGAcaca > 2:4040077/1‑93 (MQ=255)
aaCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaaa > 2:3734073/1‑93 (MQ=255)
aaCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaaa < 1:2265747/93‑1 (MQ=255)
aCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAAt < 2:1493828/93‑1 (MQ=255)
aCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAAt > 2:135949/1‑93 (MQ=255)
cGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATc < 1:1878894/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCgg > 1:1785447/1‑93 (MQ=255)
tCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCgg < 1:4349382/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGt < 2:1525741/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGt < 1:936811/93‑1 (MQ=255)
tggtggTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAANTCGGTg > 1:621608/1‑93 (MQ=255)
tggtgACAAGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGCCTATTCCGCGACACAAATCGGTgcgc < 2:833587/93‑1 (MQ=255)
ggtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCt > 2:3994250/1‑93 (MQ=255)
ggtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCt < 1:484945/93‑1 (MQ=255)
gtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTg < 1:3357953/93‑1 (MQ=255)
tgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTgg > 2:2788432/1‑93 (MQ=255)
gACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGc > 1:1964572/1‑93 (MQ=255)
gACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGc > 1:3298497/1‑93 (MQ=255)
aCCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCg > 1:1913807/1‑93 (MQ=255)
ccGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCgg > 2:659692/1‑93 (MQ=255)
gATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCggggg > 1:1813803/1‑91 (MQ=255)
gATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgtg > 2:2705858/1‑93 (MQ=255)
aTTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgtgt < 1:3919062/93‑1 (MQ=255)
aTTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgggt > 1:2490396/1‑93 (MQ=255)
tttATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGtt > 2:1145558/1‑93 (MQ=255)
tATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTtc > 2:3873469/1‑93 (MQ=255)
tCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTtctc > 1:1621401/1‑93 (MQ=255)
tCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTtctc < 1:3023410/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGGGTTtctc > 1:888446/1‑93 (MQ=255)
gCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTcgcg > 2:2670979/1‑93 (MQ=255)
cGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTa < 2:2414820/93‑1 (MQ=255)
cGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTa < 2:3434218/93‑1 (MQ=255)
caacaaCGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAAc < 2:4254856/93‑1 (MQ=255)
aacaacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAAcc > 1:2102590/1‑93 (MQ=255)
acaacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCa < 1:4195183/93‑1 (MQ=255)
acaacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGCAACCa > 2:2114583/1‑93 (MQ=255)
aacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATc < 2:4487137/93‑1 (MQ=255)
acGCTGGTGAGGCGGTGCTGCTGGGTCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCt < 2:4060025/93‑1 (MQ=255)
acGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCt > 1:1327106/1‑93 (MQ=255)
cGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGTGTGTTTCTCGCGTAACCATATg < 2:2026885/93‑1 (MQ=255)
cGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTg < 1:3150971/93‑1 (MQ=255)
cGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTg < 1:4031403/93‑1 (MQ=255)
|
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTG > NC_000913/4127921‑4128100
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAGC > NC_000913/4127918‑4128104
|
TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCT < SRR4302535.404196/94‑1 (MQ=60)
TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCT < SRR4302535.4181999/94‑1 (MQ=60)
TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCT < SRR4302535.3102712/94‑1 (MQ=60)
TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCT > SRR4302535.3122745/1‑94 (MQ=60)
GAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTG > SRR4302535.2914522/1‑94 (MQ=60)
GAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTG > SRR4302535.4621859/1‑94 (MQ=60)
GAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTG < SRR4302535.2329493/94‑1 (MQ=60)
AAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGG < SRR4302535.2957324/94‑1 (MQ=60)
AAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGG > SRR4302535.4604556/1‑94 (MQ=60)
AAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGG > SRR4302535.1230920/1‑94 (MQ=60)
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGT < SRR4302535.3910826/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGA > SRR4302535.3841077/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGA > SRR4302535.1815297/1‑94 (MQ=60)
GCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAA > SRR4302535.616427/1‑94 (MQ=60)
ttttcttgcccgtgaCTGCAAGAGCTGCTGGTGCATCATGCGGGCAATCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCCCAACAACGCTGGTGAAA < SRR4302535.1188331/79‑1 (MQ=60)
GTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAA < SRR4302535.3755162/94‑1 (MQ=60)
TTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACG > SRR4302535.516676/1‑94 (MQ=60)
TTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACG < SRR4302535.4563194/94‑1 (MQ=60)
TTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGGGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACG > SRR4302535.665112/1‑94 (MQ=60)
TCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGCGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGACTTATCAGCGGCAACAACGCTGGGGAAACGG > SRR4302535.752645/1‑94 (MQ=60)
CTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGT > SRR4302535.3419916/1‑94 (MQ=60)
CTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGT < SRR4302535.4143586/94‑1 (MQ=60)
CTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGT < SRR4302535.1262933/94‑1 (MQ=60)
CTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGT < SRR4302535.1865841/94‑1 (MQ=60)
CTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGT > SRR4302535.4409434/1‑94 (MQ=60)
TTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTG > SRR4302535.3378326/1‑94 (MQ=60)
TTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTG > SRR4302535.447479/1‑94 (MQ=60)
TACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGC < SRR4302535.2331783/94‑1 (MQ=60)
TACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGC > SRR4302535.724373/1‑94 (MQ=60)
ACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCT > SRR4302535.4212661/1‑94 (MQ=60)
ACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCT < SRR4302535.2295923/94‑1 (MQ=60)
ACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCT < SRR4302535.2406284/94‑1 (MQ=60)
ACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCT < SRR4302535.4381099/94‑1 (MQ=60)
ACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCT < SRR4302535.1301959/94‑1 (MQ=60)
ACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCT > SRR4302535.2719931/1‑94 (MQ=60)
ACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGGGCT > SRR4302535.4224114/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCT > SRR4302535.4139500/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCT < SRR4302535.910389/94‑1 (MQ=60)
GTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTG < SRR4302535.2339465/94‑1 (MQ=60)
GTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTG > SRR4302535.1232474/1‑94 (MQ=60)
GTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTG > SRR4302535.737117/1‑94 (MQ=60)
GTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTG < SRR4302535.4006661/94‑1 (MQ=60)
GTTGCTGCAACAGCGGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTG < SRR4302535.2663501/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGG < SRR4302535.167174/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGG < SRR4302535.530256/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGG < SRR4302535.2594459/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCAACAGCTGCTGCTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGG < SRR4302535.4360783/94‑1 (MQ=60)
GCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGG < SRR4302535.2585578/94‑1 (MQ=60)
CTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGC > SRR4302535.4246852/1‑94 (MQ=60)
CTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGC > SRR4302535.2451359/1‑94 (MQ=60)
GCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGT > SRR4302535.2820161/1‑94 (MQ=60)
ACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAAC < SRR4302535.4380091/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACG < SRR4302535.228111/94‑1 (MQ=60)
AGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTTAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGG > SRR4302535.569007/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTT > SRR4302535.1268052/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTT > SRR4302535.4552425/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTT > SRR4302535.3771485/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCC < SRR4302535.539493/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCG < SRR4302535.4397533/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCG < SRR4302535.2996432/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGAC < SRR4302535.1348706/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGAC < SRR4302535.3131683/94‑1 (MQ=60)
GTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACT > SRR4302535.2884281/1‑94 (MQ=60)
GTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACT < SRR4302535.320816/94‑1 (MQ=60)
CAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATT > SRR4302535.3488352/1‑94 (MQ=60)
AACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTC > SRR4302535.3227510/1‑94 (MQ=60)
AACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTC < SRR4302535.3066101/94‑1 (MQ=60)
AACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTC < SRR4302535.1769982/94‑1 (MQ=60)
AACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTC > SRR4302535.4323773/1‑94 (MQ=60)
ACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCC < SRR4302535.1051122/94‑1 (MQ=60)
ACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCC > SRR4302535.3229865/1‑94 (MQ=60)
CATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCG > SRR4302535.3833910/1‑94 (MQ=60)
CATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCG > SRR4302535.1529448/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGC > SRR4302535.2671426/1‑94 (MQ=60)
CGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGAC > SRR4302535.3216002/1‑94 (MQ=60)
CGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGAC < SRR4302535.547024/94‑1 (MQ=60)
GGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACA < SRR4302535.2055663/94‑1 (MQ=60)
GGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACA < SRR4302535.1185966/94‑1 (MQ=60)
GGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACAC < SRR4302535.12818/94‑1 (MQ=60)
GCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACA > SRR4302535.1188284/1‑94 (MQ=60)
GCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACA < SRR4302535.1003220/94‑1 (MQ=60)
CAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAA > SRR4302535.4586398/1‑94 (MQ=60)
CAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAA > SRR4302535.2490904/1‑94 (MQ=60)
AAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGATGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAA > SRR4302535.2525728/1‑94 (MQ=60)
AACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAAT < SRR4302535.2281892/94‑1 (MQ=60)
ACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATC < SRR4302535.3212306/94‑1 (MQ=60)
CGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAAGGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCG < SRR4302535.209767/94‑1 (MQ=60)
CGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCG < SRR4302535.1892432/94‑1 (MQ=60)
CGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCG > SRR4302535.1919969/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGG > SRR4302535.1798368/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGG < SRR4302535.3379239/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGT < SRR4302535.4379136/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGT < SRR4302535.4712536/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAANTCGGTG > SRR4302535.625924/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTG < SRR4302535.943447/94‑1 (MQ=60)
TGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCT < SRR4302535.1595633/94‑1 (MQ=60)
GGTGACCGTATTGATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTG < SRR4302535.1785679/94‑1 (MQ=60)
GGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTG > SRR4302535.3256521/1‑94 (MQ=60)
GGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTG < SRR4302535.488344/94‑1 (MQ=60)
GTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGG < SRR4302535.3381330/94‑1 (MQ=60)
TGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGC > SRR4302535.1978734/1‑94 (MQ=60)
TGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGC > SRR4302535.3321433/1‑94 (MQ=60)
TGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGC > SRR4302535.3628391/1‑94 (MQ=60)
GACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCG > SRR4302535.1948248/1‑94 (MQ=60)
GACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCG > SRR4302535.1927600/1‑94 (MQ=60)
GACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCG < SRR4302535.4584668/94‑1 (MQ=60)
ACCGGGTTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGG > SRR4302535.844722/1‑94 (MQ=60)
GGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTG > SRR4302535.391331/1‑94 (MQ=60)
GGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTG < SRR4302535.3841469/94‑1 (MQ=60)
GGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGGG > SRR4302535.1826918/1‑94 (MQ=60)
GATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGT > SRR4302535.1836349/1‑94 (MQ=60)
GATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGGGT > SRR4302535.2508359/1‑94 (MQ=60)
ATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTT < SRR4302535.3945866/94‑1 (MQ=60)
ATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGGT > SRR4302535.2866336/1‑94 (MQ=60)
TTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTT < SRR4302535.2904784/94‑1 (MQ=60)
TTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTC > SRR4302535.3979828/1‑94 (MQ=60)
TATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCT < SRR4302535.1722566/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTC > SRR4302535.1633101/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGGGTTTCTC > SRR4302535.894740/1‑94 (MQ=60)
TCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCG < SRR4302535.3044579/94‑1 (MQ=60)
AGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGGAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGGG > SRR4302535.4425894/1‑94 (MQ=60)
CGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAA > SRR4302535.3057717/1‑94 (MQ=60)
GCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAAC < SRR4302535.731871/94‑1 (MQ=60)
CAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACC > SRR4302535.2117753/1‑94 (MQ=60)
ACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCAT < SRR4302535.4223890/94‑1 (MQ=60)
ACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCAT < SRR4302535.4393672/94‑1 (MQ=60)
AACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCT > SRR4302535.1336576/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGG < SRR4302535.3172869/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGG < SRR4302535.4058982/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGAAACGGAGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAG > SRR4302535.1881950/1‑94 (MQ=60)
TGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAGC > SRR4302535.1108714/1‑94 (MQ=60)
TGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAGC > SRR4302535.3469965/1‑94 (MQ=60)
TGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAGC < SRR4302535.2725778/94‑1 (MQ=60)
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TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAGC > NC_000913/4127918‑4128104
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
