Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,594,520 |
A→G |
S531P (TCC→CCC) |
ydeK ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,594,520 | 0 | A | G | 99.5%
| 613.4
/ NA
| 191 | S531P (TCC→CCC) | ydeK | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (87/102); total (88/103) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
ATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACA > NC_000913/1594430‑1594608
|
aTACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGgggg > 2:4334980/1‑93 (MQ=255)
aTACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGgggg < 1:2728656/93‑1 (MQ=255)
tACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGc > 1:1522956/1‑93 (MQ=255)
acCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCAtt > 1:4926777/1‑93 (MQ=255)
acCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCAtt < 2:4797709/93‑1 (MQ=255)
acCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCAtt > 2:1544586/1‑93 (MQ=255)
ccGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCAttt < 1:1158281/93‑1 (MQ=255)
ccGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCAttt < 1:6294254/93‑1 (MQ=255)
cGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTtc < 1:6072202/93‑1 (MQ=255)
gACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTtcc > 1:5362626/1‑93 (MQ=255)
aCCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTtcct > 2:2246506/1‑93 (MQ=255)
aCCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTtcct > 2:296082/1‑93 (MQ=255)
cTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTtcctcc < 1:1680175/93‑1 (MQ=255)
tGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCg > 2:382381/1‑93 (MQ=255)
tAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGAt < 2:1842296/93‑1 (MQ=255)
tAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGAt < 2:6061023/93‑1 (MQ=255)
tAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGAt < 2:2609021/93‑1 (MQ=255)
aGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATa > 1:6013346/1‑93 (MQ=255)
gCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACAGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATaa > 1:3383220/1‑93 (MQ=255)
aaTTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAAt < 1:445618/93‑1 (MQ=255)
aTTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATc > 2:2804508/1‑93 (MQ=255)
aTTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATc < 1:5236684/93‑1 (MQ=255)
aTTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATc > 1:2062393/1‑93 (MQ=255)
ttGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATcc < 2:685802/93‑1 (MQ=255)
ttGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATcc > 2:3986075/1‑93 (MQ=255)
tgtgCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCa < 1:5031989/93‑1 (MQ=255)
gtgCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCAt < 1:776128/93‑1 (MQ=255)
gtgCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCAt < 2:1100769/93‑1 (MQ=255)
tgCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATa > 1:5841937/1‑93 (MQ=255)
gCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAg < 2:5851721/93‑1 (MQ=255)
gTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGcc > 1:2146425/1‑93 (MQ=255)
ttAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGccc < 2:493770/93‑1 (MQ=255)
ttAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGccc > 2:2369630/1‑93 (MQ=255)
tagtagATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCg > 1:2903793/1‑93 (MQ=255)
tagtagATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCg < 1:1802955/93‑1 (MQ=255)
tagtagATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCg < 1:3873506/93‑1 (MQ=255)
gtagATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGtt < 2:1373062/93‑1 (MQ=255)
gatgatGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGaa > 2:5439506/1‑93 (MQ=255)
gatgatGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGaa > 2:4269351/1‑93 (MQ=255)
gatgatGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGaa > 2:1670533/1‑93 (MQ=255)
tgatgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAAtt < 1:2080903/93‑1 (MQ=255)
tgatgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAAtt < 1:1927620/93‑1 (MQ=255)
gatgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTa > 1:3674411/1‑93 (MQ=255)
gatgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTa > 1:6243666/1‑93 (MQ=255)
atgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTaa < 2:5742829/93‑1 (MQ=255)
atgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTaa > 2:6228342/1‑93 (MQ=255)
tgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAg < 1:5743106/93‑1 (MQ=255)
tgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAg < 1:2256160/93‑1 (MQ=255)
ttCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAgg < 1:1248610/92‑1 (MQ=255)
gTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCACCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAgg < 1:1544044/93‑1 (MQ=255)
tCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAggg < 2:3940414/93‑1 (MQ=255)
tttAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAgggcg > 1:3971783/1‑91 (MQ=255)
tttAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTg < 1:4125582/93‑1 (MQ=255)
tAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGc > 2:3242267/1‑93 (MQ=255)
aTTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGcc < 1:3074850/93‑1 (MQ=255)
ttCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCa > 2:4963557/1‑93 (MQ=255)
tCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCAt > 1:2502441/1‑93 (MQ=255)
cAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTa > 1:1779331/1‑93 (MQ=255)
cAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTa > 2:2656409/1‑93 (MQ=255)
agagACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTAc > 2:4666960/1‑93 (MQ=255)
gaCTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGa < 2:1894861/93‑1 (MQ=255)
gaCTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGa > 2:4216800/1‑93 (MQ=255)
cTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGAct > 2:3163967/1‑92 (MQ=255)
cTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACa < 1:330020/93‑1 (MQ=255)
tGTCGGTTGAAATA‑TAACTAACCCCCTAACGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCAGAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACAtt < 2:2840293/93‑1 (MQ=255)
tGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACAt > 2:351905/1‑93 (MQ=255)
tGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACAt > 1:4682490/1‑93 (MQ=255)
gTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACAtt < 2:4918717/93‑1 (MQ=255)
gTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACAtt > 1:938313/1‑93 (MQ=255)
ccGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTa < 1:4553226/93‑1 (MQ=255)
cGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTAc < 2:303143/93‑1 (MQ=255)
gTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACg < 2:1502581/93‑1 (MQ=255)
gTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACg > 2:1169750/1‑93 (MQ=255)
ttGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGa > 2:889837/1‑93 (MQ=255)
ttGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGa < 1:6207843/93‑1 (MQ=255)
ttGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGa > 2:3578610/1‑93 (MQ=255)
tGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGAt > 1:4535978/1‑93 (MQ=255)
gAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATa < 2:4648384/93‑1 (MQ=255)
gAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATa < 1:3550681/93‑1 (MQ=255)
gAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATa > 2:3217814/1‑93 (MQ=255)
aaaTATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATAc > 1:5556301/1‑93 (MQ=255)
aaTATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATAcc < 1:992639/93‑1 (MQ=255)
aaTATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATAcc < 2:764703/93‑1 (MQ=255)
ttACCTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTa < 1:1738811/93‑1 (MQ=255)
ttAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTa > 2:2065291/1‑93 (MQ=255)
cTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCaa > 2:1827470/1‑93 (MQ=255)
cTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCaa > 1:130030/1‑93 (MQ=255)
tATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCaaa < 1:5903750/93‑1 (MQ=255)
tATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCaaa < 2:5628300/93‑1 (MQ=255)
tATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCaaa > 2:550141/1‑93 (MQ=255)
aTCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCaaaa > 1:5184038/1‑93 (MQ=255)
cccTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTa > 1:6154521/1‑93 (MQ=255)
ccTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTAc < 1:5050761/93‑1 (MQ=255)
ccTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTAc < 2:212301/93‑1 (MQ=255)
cTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTAcc < 1:5222250/93‑1 (MQ=255)
ttACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTAcca > 2:1642458/1‑92 (MQ=255)
ttACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCg < 2:1386035/93‑1 (MQ=255)
tACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGa < 2:5703255/93‑1 (MQ=255)
tccGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGAc < 2:2631377/92‑1 (MQ=255)
aCCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGAc < 1:5431537/93‑1 (MQ=255)
|
ATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACA > NC_000913/1594430‑1594608
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGAT > NC_000913/1594427‑1594613
|
CTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGG < SRR4302533.3681284/94‑1 (MQ=60)
CTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGG > SRR4302533.2407300/1‑94 (MQ=60)
CTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGG > SRR4302533.5445647/1‑94 (MQ=60)
TAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTTTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGG < SRR4302533.126192/94‑1 (MQ=60)
TAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGG < SRR4302533.3511379/94‑1 (MQ=60)
TAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGCTAGTAGATGGCGTCTTTAAATTCCAGAGACTGACCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGG > SRR4302533.5829522/1‑94 (MQ=60)
ATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGC > SRR4302533.4937858/1‑94 (MQ=60)
ATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGC < SRR4302533.2745395/94‑1 (MQ=60)
ATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGC > SRR4302533.1532120/1‑94 (MQ=60)
TACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCA < SRR4302533.1741914/94‑1 (MQ=60)
TACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCA > SRR4302533.2398144/1‑94 (MQ=60)
CACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATT > SRR4302533.4956615/1‑94 (MQ=60)
ACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTT > SRR4302533.1767176/1‑94 (MQ=60)
CCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTC < SRR4302533.6331775/94‑1 (MQ=60)
CCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTC < SRR4302533.3264655/94‑1 (MQ=60)
CCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTC < SRR4302533.1165232/94‑1 (MQ=60)
CGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCC > SRR4302533.5900730/1‑94 (MQ=60)
CGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCC < SRR4302533.6108937/94‑1 (MQ=60)
CGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCC > SRR4302533.5394833/1‑94 (MQ=60)
ACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTC > SRR4302533.681911/1‑94 (MQ=60)
CTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCG < SRR4302533.1690353/94‑1 (MQ=60)
TAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATA > SRR4302533.6049781/1‑94 (MQ=60)
AGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACAGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAA > SRR4302533.3404108/1‑94 (MQ=60)
AATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATC > SRR4302533.2075110/1‑94 (MQ=60)
AATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATC < SRR4302533.6327593/94‑1 (MQ=60)
AATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATC < SRR4302533.448284/94‑1 (MQ=60)
AATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATC > SRR4302533.982001/1‑94 (MQ=60)
ATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCC > SRR4302533.6249886/1‑94 (MQ=60)
ATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCC < SRR4302533.5268170/94‑1 (MQ=60)
ATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCC < SRR4302533.1812542/94‑1 (MQ=60)
TGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCAT < SRR4302533.5062455/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATA > SRR4302533.4203358/1‑94 (MQ=60)
GTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATA < SRR4302533.6225126/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATA < SRR4302533.780688/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATA > SRR4302533.5877258/1‑94 (MQ=60)
CGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCC > SRR4302533.2159646/1‑94 (MQ=60)
TTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCG > SRR4302533.2921628/1‑94 (MQ=60)
TAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGT < SRR4302533.1813931/94‑1 (MQ=60)
TAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGT < SRR4302533.3897150/94‑1 (MQ=60)
AGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTT > SRR4302533.1268398/1‑94 (MQ=60)
GTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTG > SRR4302533.6047539/1‑94 (MQ=60)
AGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAA < SRR4302533.5414737/94‑1 (MQ=60)
GATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAAT < SRR4302533.1601779/94‑1 (MQ=60)
GATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAAT < SRR4302533.884249/94‑1 (MQ=60)
TGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTA < SRR4302533.2093709/94‑1 (MQ=60)
TGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTA > SRR4302533.6281039/1‑94 (MQ=60)
TGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTA < SRR4302533.1939381/94‑1 (MQ=60)
TGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTA > SRR4302533.3696995/1‑94 (MQ=60)
TGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGG < SRR4302533.4575794/94‑1 (MQ=60)
TGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGG < SRR4302533.5777764/94‑1 (MQ=60)
TGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGG < SRR4302533.2270118/94‑1 (MQ=60)
TTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGG < SRR4302533.1256070/94‑1 (MQ=60)
GTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCACCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGG < SRR4302533.1553344/94‑1 (MQ=60)
CTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTG < SRR4302533.5812074/94‑1 (MQ=60)
CTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTG < SRR4302533.1898845/94‑1 (MQ=60)
CTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGCG > SRR4302533.3995973/1‑94 (MQ=60)
TTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGG < SRR4302533.570760/94‑1 (MQ=60)
TTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGG < SRR4302533.4150626/94‑1 (MQ=60)
TTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGC > SRR4302533.2137264/1‑94 (MQ=60)
AATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCC > SRR4302533.3569206/1‑94 (MQ=60)
ATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCA < SRR4302533.3093723/94‑1 (MQ=60)
TTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCAT > SRR4302533.2517875/1‑94 (MQ=60)
CCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTA > SRR4302533.1790166/1‑94 (MQ=60)
AGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACT < SRR4302533.2943362/94‑1 (MQ=60)
GAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTG < SRR4302533.4963129/94‑1 (MQ=60)
TACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGAC < SRR4302533.6084107/94‑1 (MQ=60)
GACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGAC > SRR4302533.1966719/1‑94 (MQ=60)
ACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACA < SRR4302533.2791851/94‑1 (MQ=60)
CTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACAT > SRR4302533.4710860/1‑94 (MQ=60)
CTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACAT < SRR4302533.332036/94‑1 (MQ=60)
TGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATT > SRR4302533.943825/1‑94 (MQ=60)
TGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATT < SRR4302533.2078542/94‑1 (MQ=60)
TGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATT < SRR4302533.6182389/94‑1 (MQ=60)
GTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTT > SRR4302533.5119543/1‑94 (MQ=60)
TCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTA > SRR4302533.5310458/1‑94 (MQ=60)
CCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTAC < SRR4302533.4580841/94‑1 (MQ=60)
GTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGA > SRR4302533.4708667/1‑94 (MQ=60)
ATTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGA < SRR4302533.3353950/94‑1 (MQ=60)
TTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGAT > SRR4302533.4563442/1‑94 (MQ=60)
TTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGAT < SRR4302533.6245076/94‑1 (MQ=60)
TTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGAT < SRR4302533.3732884/94‑1 (MQ=60)
TTGAAATATTAACTATCCCCCTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGAT < SRR4302533.5249781/94‑1 (MQ=60)
GAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATAC > SRR4302533.5589880/1‑94 (MQ=60)
GAAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATAC < SRR4302533.3572555/94‑1 (MQ=60)
AAATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACC < SRR4302533.4072979/94‑1 (MQ=60)
AATATTAACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCG < SRR4302533.998442/94‑1 (MQ=60)
TTACCTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTAC < SRR4302533.1749356/94‑1 (MQ=60)
AACTATCCCCTTACCGGGGCCATTCCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCA < SRR4302533.4555424/94‑1 (MQ=60)
ACTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAA > SRR4302533.130843/1‑94 (MQ=60)
CTATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAA > SRR4302533.5523305/1‑94 (MQ=60)
TATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAA < SRR4302533.3899714/94‑1 (MQ=60)
TATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAA > SRR4302533.5215332/1‑94 (MQ=60)
TATCCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAA < SRR4302533.5939405/94‑1 (MQ=60)
CCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTA > SRR4302533.6191552/1‑94 (MQ=60)
CCCCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTA > SRR4302533.3674163/1‑94 (MQ=60)
CCTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACC < SRR4302533.5081305/94‑1 (MQ=60)
CTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCG < SRR4302533.5253672/94‑1 (MQ=60)
CTTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCG < SRR4302533.2734142/94‑1 (MQ=60)
TTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGA > SRR4302533.219555/1‑94 (MQ=60)
TTACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGA < SRR4302533.1543060/94‑1 (MQ=60)
TTACCGGGCGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGA < SRR4302533.1385043/94‑1 (MQ=60)
ACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACA > SRR4302533.5071134/1‑94 (MQ=60)
ACCGGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACA < SRR4302533.5464246/94‑1 (MQ=60)
GGGGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTG > SRR4302533.3776981/1‑94 (MQ=60)
GGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGCGGCGCCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGAT > SRR4302533.5721839/1‑94 (MQ=60)
|
CTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGAT > NC_000913/1594427‑1594613
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
