Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F224 I0 R1
|
1457 |
284.0 |
9290224 |
95.7% |
8890744 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,882,020 |
G→T |
51.3% |
intergenic (+151/‑70) |
tnaC → / → tnaA |
tryptophanase leader peptide/tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,882,020 | 0 | G | T | 51.3%
| 99.7
/ inf
| 259 | intergenic (+151/‑70) | tnaC/tnaA | tryptophanase leader peptide/tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (59/67); new base T (69/64); total (128/131) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.56e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.04e-01 |
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
GCCCTTCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTATCG > CP009273/3881873‑3882169
|
cTTCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTa < 2:2865783/150‑1 (MQ=255)
cTTCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTa < 2:2905179/150‑1 (MQ=255)
tCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCtaattaat > 1:57551/1‑150 (MQ=255)
tCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAAt > 2:3253689/1‑150 (MQ=255)
tCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAAt < 1:2044281/150‑1 (MQ=255)
aGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCTTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGta < 1:4397187/150‑1 (MQ=255)
aGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGta > 1:118844/1‑150 (MQ=255)
aGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGta < 1:2758247/150‑1 (MQ=255)
gCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGtat < 2:4294739/150‑1 (MQ=255)
ccATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGtata < 2:3916087/150‑1 (MQ=255)
aTCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGc > 2:67667/1‑150 (MQ=255)
aTCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGc > 1:1228859/1‑150 (MQ=255)
tCACCAGATCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCa < 1:4462720/150‑1 (MQ=255)
ccAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGAt < 1:325836/150‑1 (MQ=255)
cAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATg < 2:3009726/150‑1 (MQ=255)
gagCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTa > 1:4047728/1‑150 (MQ=255)
gagCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTa < 2:14429/150‑1 (MQ=255)
agCCTAACCGATTAGATTCTATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTTCTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGTTATAGCAGATGtta < 1:1944509/150‑3 (MQ=255)
agCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTaa < 2:3994892/150‑1 (MQ=255)
ccAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAata < 1:679547/150‑1 (MQ=255)
cAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAatat > 1:443642/1‑150 (MQ=255)
aaCCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTc < 1:4574388/150‑1 (MQ=255)
cGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTcaca > 2:3257248/1‑150 (MQ=255)
gATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAg > 1:835309/1‑150 (MQ=255)
gATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAg > 1:768654/1‑150 (MQ=255)
aTTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAgg < 2:594485/150‑1 (MQ=255)
ttAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAggg < 2:4618287/150‑1 (MQ=255)
ttAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAggg < 1:1887070/150‑1 (MQ=255)
tAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGa > 2:2971854/1‑150 (MQ=255)
tAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGa < 2:4220522/150‑1 (MQ=255)
aGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGAt > 1:1094512/1‑150 (MQ=255)
gATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATc > 1:369177/1‑150 (MQ=255)
gATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATc < 2:2453953/150‑1 (MQ=255)
ttCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATGAc < 2:4202614/150‑1 (MQ=255)
tgtgATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTaa > 1:1506691/1‑150 (MQ=255)
tgtgATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTaa > 2:4403664/1‑150 (MQ=255)
gtgATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAAt < 1:2562923/150‑1 (MQ=255)
aTCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTaa > 1:4565268/1‑150 (MQ=255)
tgtttgCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAaaataaat > 2:4190735/1‑150 (MQ=255)
tataTCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGAt > 2:66264/1‑150 (MQ=255)
tataTCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGAt > 2:3875393/1‑150 (MQ=255)
tataTCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGAt > 1:1629935/1‑150 (MQ=255)
atCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTAt < 1:4203856/150‑1 (MQ=255)
tCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATg > 1:1195910/1‑150 (MQ=255)
tAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTaa > 1:705500/1‑150 (MQ=255)
aTTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATg < 2:50284/150‑1 (MQ=255)
aTTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATg < 1:2444429/150‑1 (MQ=255)
tGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGaaa > 2:1697745/1‑150 (MQ=255)
tGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGaaa > 2:4449763/1‑150 (MQ=255)
tGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGaaa > 1:1344878/1‑150 (MQ=255)
gCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGaaaa < 1:168085/150‑1 (MQ=255)
ccTTTTGCAAAGGTCATCTATCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAAc > 2:1578826/1‑150 (MQ=255)
cTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTAGTTACTGGTTTTAGTAAATGCTGGTGCTTGCAGATAGATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCCCAGGGATCACTGTAAGGCAAATAAATGAAGGAGGATGTAATGGAACACt > 2:3732796/1‑150 (MQ=255)
ttttGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACtt < 1:1023086/150‑1 (MQ=255)
tttGCAAAGGTCATCTCTCGTTGATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACttt < 1:3796884/150‑1 (MQ=255)
ttGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTa < 1:2142642/150‑1 (MQ=255)
tGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTaa > 1:2104013/1‑150 (MQ=255)
cAAAGGTCATCTCTCGTATATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCAGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAAc > 2:1821374/1‑150 (MQ=255)
aaaGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACa > 2:3732478/1‑150 (MQ=255)
cATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTccc > 2:1683611/1‑150 (MQ=255)
aTCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCt > 1:3415786/1‑150 (MQ=255)
aTCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCt < 2:357206/150‑1 (MQ=255)
tcGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAAcc < 2:2999091/150‑1 (MQ=255)
cGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCg > 1:452186/1‑150 (MQ=255)
cGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCg < 2:4334607/150‑1 (MQ=255)
gTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGt > 1:2331964/1‑150 (MQ=255)
gTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGt > 2:3442649/1‑150 (MQ=255)
tttatttaCTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGtt < 1:3825011/150‑1 (MQ=255)
tatttaCTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTcc < 1:3557008/150‑1 (MQ=255)
tatttaCTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTcc > 2:523752/1‑150 (MQ=255)
atttaCTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCg < 2:2290236/150‑1 (MQ=255)
ttaCTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCa > 2:2104642/1‑150 (MQ=255)
ttaCTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCa > 2:4248676/1‑150 (MQ=255)
ttGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCg < 1:2995818/150‑1 (MQ=255)
tttAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGtt < 1:3886768/150‑1 (MQ=255)
tttAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGtt < 2:768654/150‑1 (MQ=255)
gTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTg > 2:1019253/1‑150 (MQ=255)
gTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGTTCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTg < 1:146388/150‑1 (MQ=255)
gTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTg < 2:160835/150‑1 (MQ=255)
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aaTGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGc > 1:181005/1‑150 (MQ=255)
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GGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTA > SRR19973072.4392003/1‑150 (MQ=60)
GCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTAT > SRR19973072.1073819/1‑150 (MQ=60)
GCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTAT > SRR19973072.1073813/1‑150 (MQ=60)
TAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTATCG > SRR19973072.3084325/1‑150 (MQ=60)
GAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTATCG > SRR19973072.1203158/1‑150 (MQ=60)
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CCCTTCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTATCG > CP009273/3881874‑3882169
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
