Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F181 I0 R1
|
1262 |
323.1 |
10297870 |
97.5% |
10040423 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,882,020 |
G→T |
10.5% |
intergenic (+151/‑70) |
tnaC → / → tnaA |
tryptophanase leader peptide/tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,882,020 | 0 | G | T | 10.5%
| 1110.6
/ 72.2
| 320 | intergenic (+151/‑70) | tnaC/tnaA | tryptophanase leader peptide/tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (149/137); new base T (20/14); total (169/151) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 321 total aligned reads displayed.
TGCCCTTCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTATCG > CP009273/3881872‑3882169
|
tGCCCTTCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGa > 2:278926/1‑150 (MQ=255)
gCCCTTCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGaa > 2:663760/1‑150 (MQ=255)
ccTTCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAAtt > 1:1731929/1‑150 (MQ=255)
cTTCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTa < 1:2923264/150‑1 (MQ=255)
tCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAAt < 1:1204660/150‑1 (MQ=255)
cTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATc > 2:341840/1‑150 (MQ=255)
cTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATc > 2:1323735/1‑150 (MQ=255)
tGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCg < 2:4310817/150‑1 (MQ=255)
tGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCg < 2:1067714/150‑1 (MQ=255)
tGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCg < 2:72174/150‑1 (MQ=255)
tAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGt < 2:1417754/150‑1 (MQ=255)
aGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGta > 2:1599191/1‑150 (MQ=255)
ccATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGtata > 1:3926836/1‑150 (MQ=255)
aCCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGa > 1:719675/1‑150 (MQ=255)
ccAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGAt < 1:2982113/150‑1 (MQ=255)
cAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATg < 2:405785/150‑1 (MQ=255)
cAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATg < 2:1056342/150‑1 (MQ=255)
gagCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTa < 1:1858923/150‑1 (MQ=255)
gATTAGATTCAATGTGATCTCTGTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCGCTCGTTTCTTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCGTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTCTAGCAGATGTAATATTCACAg > 2:1100928/1‑150 (MQ=255)
ttAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAggg < 2:396938/150‑1 (MQ=255)
tAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGa < 1:590583/150‑1 (MQ=255)
aGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGAt > 1:4979392/1‑150 (MQ=255)
aGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGAt < 2:2313094/150‑1 (MQ=255)
cAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTg < 1:4930713/150‑1 (MQ=255)
aTGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTa > 1:442450/1‑150 (MQ=255)
aTCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTaa > 1:4844691/1‑150 (MQ=255)
aTCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTaa < 2:3692864/150‑1 (MQ=255)
tCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTaaa > 2:1201594/1‑150 (MQ=255)
tCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTaaa < 2:4300058/150‑1 (MQ=255)
tCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTaaa > 2:2726452/1‑150 (MQ=255)
tCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTaaa > 1:1146978/1‑150 (MQ=255)
cTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTaaaa > 2:201514/1‑150 (MQ=255)
aTTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAaaata < 1:3823864/150‑1 (MQ=255)
ttgtttgCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAaaataaa > 1:964131/1‑150 (MQ=255)
ttgtttgCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAaaataaa < 2:76810/150‑1 (MQ=255)
gtttgCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATg > 1:2477735/1‑150 (MQ=255)
ttgCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGaa > 1:3070976/1‑150 (MQ=255)
ttgCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGaa > 1:3832107/1‑150 (MQ=255)
ttgCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGaa < 2:1866423/150‑1 (MQ=255)
gCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAgg > 1:559295/1‑150 (MQ=255)
cTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGa > 1:2685679/1‑150 (MQ=255)
atatCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGAtt > 1:1272151/1‑150 (MQ=255)
tatCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTa < 1:862136/150‑1 (MQ=255)
atCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTAt > 2:3677062/1‑150 (MQ=255)
cTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGt < 1:668608/150‑1 (MQ=255)
ttAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGTGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTa < 1:1024828/150‑1 (MQ=255)
aTTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATg > 1:1405188/1‑150 (MQ=255)
ttttGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATgg > 1:833274/1‑150 (MQ=255)
ttttGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATgg > 1:3737461/1‑150 (MQ=255)
ttttGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATgg < 2:1638139/150‑1 (MQ=255)
tttGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGa > 1:4377890/1‑150 (MQ=255)
tttGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGa < 1:2301024/150‑1 (MQ=255)
ttGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGaa < 1:4879929/150‑1 (MQ=255)
ttGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGaa < 2:4406170/150‑1 (MQ=255)
tGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGaaa > 2:514273/1‑150 (MQ=255)
tGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGaaa > 2:2156084/1‑150 (MQ=255)
ccTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAAc > 1:398467/1‑150 (MQ=255)
ttGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTa < 2:4684871/150‑1 (MQ=255)
tGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTaa > 1:2540897/1‑150 (MQ=255)
tGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTaa < 1:331566/150‑1 (MQ=255)
gTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACAtctc > 1:2593861/1‑150 (MQ=255)
gTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACAtctc < 2:2113122/150‑1 (MQ=255)
gTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACAtctc < 1:4529650/150‑1 (MQ=255)
gTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACAtctc > 1:3612908/1‑150 (MQ=255)
taaTCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTcc > 1:2092437/3‑150 (MQ=255)
tCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTcc > 2:4792264/1‑150 (MQ=255)
cATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTccc > 2:3276619/1‑150 (MQ=255)
cATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTccc > 2:3891552/1‑150 (MQ=255)
aTCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCt < 2:2353612/150‑1 (MQ=255)
tctctcGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTg > 1:3180438/1‑150 (MQ=255)
ctctcGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGa < 2:2657379/150‑1 (MQ=255)
ctcGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAAc > 1:4274825/1‑150 (MQ=255)
ttatttaCTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTc < 2:3055689/150‑1 (MQ=255)
tatttaGTTGTTTTAGTTTATTATGGTGCTTTAATATATATCTGGCGTATTAATCTGTATAGAAGATGTAATATTCTAATTTATCACTGTAATTAAAATAAATTAAGTATTATGTAATGGAAAACTTTAAAAATCTCCCTGAACCGTTcc < 2:1502968/150‑1 (MQ=255)
atttaCTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCg < 1:2809592/150‑1 (MQ=255)
ttaCTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCa < 1:1092971/150‑1 (MQ=255)
taCTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCAt < 2:3822836/150‑1 (MQ=255)
cTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTc > 1:1971950/1‑150 (MQ=255)
tGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCgt > 1:3212351/1‑150 (MQ=255)
aGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAGCATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTAtt > 1:2224146/1‑150 (MQ=255)
aGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTAtt > 2:2859887/1‑150 (MQ=255)
aGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTAtt > 2:5077131/1‑150 (MQ=255)
aGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGACGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTCATGGACAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTAtt > 1:3672560/1‑150 (MQ=255)
gTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATGCGTGTTATTg > 1:1019599/1‑150 (MQ=255)
tAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGa > 1:2188822/1‑150 (MQ=255)
aaTGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGc > 2:176250/1‑150 (MQ=255)
tgatgGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCa < 2:891034/150‑1 (MQ=255)
gatgGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAg > 1:3643189/1‑150 (MQ=255)
tgttGCTTTAATATATATCTGTCGAATTAATCGGTATAGCATATGTAATATTCACAGTTATCACTGTAATTAAAATATATGAAGGATTATGTAATTGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTa < 2:1575208/147‑1 (MQ=255)
ggTGCTTGCATATATATCTGGCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTaa > 1:3575112/1‑150 (MQ=255)
ggTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTaa > 2:1357430/1‑150 (MQ=255)
gCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAAc < 2:361235/150‑1 (MQ=255)
ttGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGt < 2:1565536/150‑1 (MQ=255)
tatatatCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCAc < 2:4831893/150‑1 (MQ=255)
atatatCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACt < 2:2685907/150‑1 (MQ=255)
ggCTAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTa > 2:4510912/1‑150 (MQ=255)
ggCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTTATATAAATGAAGTATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTa < 1:1559555/150‑1 (MQ=255)
ggCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTa < 2:392143/150‑1 (MQ=255)
cGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTATc < 2:4852134/150‑1 (MQ=255)
gAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTATCg > 2:2579752/1‑150 (MQ=255)
|
TGCCCTTCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTATCG > CP009273/3881872‑3882169
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
