Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,875,671 |
G→A |
T4I (ACC→ATC) |
dnaN ← |
DNA polymerase III, beta subunit |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,875,671 | 0 | G | A | 100.0%
| 925.8
/ NA
| 274 | T4I (ACC→ATC) | dnaN | DNA polymerase III, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (122/152); total (122/152) |
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
ATTTCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACGCATCGCCAAT > CP009273/3875524‑3875817
|
tttCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATaa < 2:1639424/150‑1 (MQ=255)
tttCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATaa < 2:176331/150‑1 (MQ=255)
tttCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATaa < 2:1238080/150‑1 (MQ=255)
ttCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATaaa > 2:3340212/1‑150 (MQ=255)
ttCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATaaa > 2:3341036/1‑150 (MQ=255)
tCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAAt > 1:1111136/1‑150 (MQ=255)
tCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAAt > 1:2396775/1‑150 (MQ=255)
tCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAAt > 1:642193/1‑150 (MQ=255)
ccATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAAtt < 1:2652212/150‑1 (MQ=255)
cATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAAttt < 1:853442/150‑1 (MQ=255)
cGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAg > 1:1853457/1‑150 (MQ=255)
cGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAg < 2:1352242/150‑1 (MQ=255)
cGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAg < 2:720823/150‑1 (MQ=255)
aTCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGttt < 2:3281140/150‑1 (MQ=255)
tACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGAt < 1:958001/150‑1 (MQ=255)
tACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGAt < 2:1432927/150‑1 (MQ=255)
ccGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGa < 2:2882608/150‑1 (MQ=255)
cGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGAc < 1:3685972/150‑1 (MQ=255)
tCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAAt > 1:2822003/1‑150 (MQ=255)
cAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATg > 2:108625/1‑150 (MQ=255)
cAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATg < 2:353130/150‑1 (MQ=255)
gCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGtt < 2:6680/150‑1 (MQ=255)
gCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGtt < 1:1046047/150‑1 (MQ=255)
gCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGtt < 1:906742/150‑1 (MQ=255)
cGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTc < 2:1499584/150‑1 (MQ=255)
gACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCt < 2:40700/150‑1 (MQ=255)
aCAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTg < 1:778326/150‑1 (MQ=255)
aCAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTg < 2:394776/150‑1 (MQ=255)
aaCGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGAt < 1:2903644/150‑1 (MQ=255)
aaCGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGAt < 2:636943/150‑1 (MQ=255)
cGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTa > 1:1276211/1‑150 (MQ=255)
cGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTa > 1:3175259/1‑150 (MQ=255)
gTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTaa > 1:3340096/1‑150 (MQ=255)
gTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTaa > 2:3213165/1‑150 (MQ=255)
cGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAAttt < 1:2764878/150‑1 (MQ=255)
cGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAAttt < 2:1248248/150‑1 (MQ=255)
cGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAAttt < 2:2510653/150‑1 (MQ=255)
tCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGa > 2:2858445/1‑150 (MQ=255)
cAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGaa < 2:2676231/150‑1 (MQ=255)
aGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGaaa < 1:3113063/150‑1 (MQ=255)
cAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGaaaaa < 2:1543702/150‑1 (MQ=255)
aCCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAAtc > 2:3566867/1‑150 (MQ=255)
ccTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAAtct > 1:2187068/1‑150 (MQ=255)
cTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAAtctt < 2:3084489/150‑1 (MQ=255)
cTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAAtctt > 2:834675/1‑150 (MQ=255)
gTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAAtcttct < 1:1847320/150‑1 (MQ=255)
tAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATcttctt < 1:616849/150‑1 (MQ=255)
tAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATcttctt < 1:2490958/150‑1 (MQ=255)
tAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATcttctt < 1:1399415/150‑1 (MQ=255)
tAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATcttctt > 1:3467541/1‑150 (MQ=255)
aCAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTg < 2:3128516/150‑1 (MQ=255)
agcagATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGat < 1:3609353/150‑1 (MQ=255)
agcagATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGat < 1:524117/150‑1 (MQ=255)
agcagATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGat < 2:2607574/150‑1 (MQ=255)
gcagATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGata < 1:3529223/150‑1 (MQ=255)
gcagATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGata > 1:1360943/1‑150 (MQ=255)
cagATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGatat < 2:3681805/150‑1 (MQ=255)
cagATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGatat < 1:1428384/150‑1 (MQ=255)
ttACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTg > 2:2449323/1‑150 (MQ=255)
tACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTgg < 2:2707723/150‑1 (MQ=255)
tACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTgg < 2:1111136/150‑1 (MQ=255)
aCCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGc < 2:131175/150‑1 (MQ=255)
gaATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGctctct > 1:1972470/1‑150 (MQ=255)
cGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCAc < 1:3801408/150‑1 (MQ=255)
cGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCAc < 1:72838/150‑1 (MQ=255)
ggTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACg > 1:1464142/1‑150 (MQ=255)
aGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCaa > 2:1387153/1‑150 (MQ=255)
aGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCaa > 2:1386308/1‑150 (MQ=255)
aGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCaa > 2:1062048/1‑150 (MQ=255)
aGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCaa > 2:1851643/1‑150 (MQ=255)
aGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCt < 2:48963/150‑1 (MQ=255)
acgacCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGa < 1:425190/150‑1 (MQ=255)
gacCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATc < 2:2226920/150‑1 (MQ=255)
accaccTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCt < 1:2323180/150‑1 (MQ=255)
ccTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAACTGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATCGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACg < 2:1615877/150‑1 (MQ=255)
ccTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACg < 2:678736/150‑1 (MQ=255)
cGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACggcagg > 1:2091309/1‑150 (MQ=255)
cGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACggcagg < 1:1195554/150‑1 (MQ=255)
aCCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCAt < 2:3458547/150‑1 (MQ=255)
ccGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATg > 2:1025077/1‑150 (MQ=255)
ccGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATg < 1:3213165/150‑1 (MQ=255)
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tCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGc < 1:2579665/150‑1 (MQ=255)
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TAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTT > SRR19973061.2191766/1‑150 (MQ=60)
AACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTT < SRR19973061.863308/150‑1 (MQ=60)
AACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTT > SRR19973061.2115702/1‑150 (MQ=60)
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CAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGA < SRR19973061.2400126/150‑1 (MQ=60)
CAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGA < SRR19973061.1393434/150‑1 (MQ=60)
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AGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGAT > SRR19973061.3635733/1‑150 (MQ=60)
AGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGAT < SRR19973061.3618592/150‑1 (MQ=60)
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GCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATA < SRR19973061.3538262/150‑1 (MQ=60)
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TACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGG < SRR19973061.648590/150‑1 (MQ=60)
ACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGC > SRR19973061.2366877/1‑150 (MQ=60)
CCGAGATTCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCT < SRR19973061.2548284/150‑1 (MQ=60)
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TAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGC > SRR19973061.3036137/1‑150 (MQ=60)
GGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTC > SRR19973061.2075223/1‑150 (MQ=60)
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GACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATC > SRR19973061.698331/1‑150 (MQ=60)
ACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCT < SRR19973061.2329076/150‑1 (MQ=60)
CCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTT < SRR19973061.1657254/150‑1 (MQ=60)
CCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACG > SRR19973061.1552653/1‑150 (MQ=60)
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GATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACGCATCGCCAATCT > SRR19973061.2505227/1‑150 (MQ=60)
GATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACGCATCGCCAATCT > SRR19973061.3058823/1‑150 (MQ=60)
GATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACGCATCGCCAATCT > SRR19973061.3058811/1‑150 (MQ=60)
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CATTTCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACGCATCGCCAATCT > CP009273/3875523‑3875819
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |