Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | AE015451 | 1,499,508 | +C | intergenic (+85/‑79) | trpS → / → zapE | Tryptophan‑‑tRNA ligase/putative enzyme with nucleoside triphosphate hydrolase domain |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AE015451 | 1,499,506 | 1 | . | C | 99.4% | 316.7 / ‑0.9 | 317 | intergenic (+83/‑81) | trpS/zapE | Tryptophan‑‑tRNA ligase/putative enzyme with nucleoside triphosphate hydrolase domain |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base C (128/186); total (129/188) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
TTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCCACGGCTTTGCCGGTGTT‑T‑CGGGCAC‑G‑C‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGT > AE015451/1499383‑1499625 | cAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAc‑g‑c‑c < 2:2057644/125‑1 (MQ=25) gagCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAc‑g‑c‑cc > 1:2058227/1‑123 (MQ=21) gCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAc‑g‑c‑c < 2:2057649/121‑1 (MQ=21) ccTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGACCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGTGACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAc‑g‑c < 1:2057650/119‑1 (MQ=21) cGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCccca > 2:2057825/1‑124 (MQ=18) cGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCcac > 2:2057914/1‑123 (MQ=18) gAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CAGGCAC‑GCC‑CGCTCCcac > 1:2058402/1‑122 (MQ=18) aaGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGAc < 2:2057655/125‑1 (MQ=18) aGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGATGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAg < 1:2057656/122‑1 (MQ=18) gCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCcac > 2:2058146/1‑119 (MQ=17) gCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCcac > 1:2058248/1‑119 (MQ=17) ccTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGa < 2:2057660/125‑1 (MQ=18) ggCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAGCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGAt < 1:2057667/122‑1 (MQ=17) ggCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGGGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTccc < 2:2057665/112‑1 (MQ=17) ccacAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCAtt < 1:2057673/125‑1 (MQ=18) cacaGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTa > 2:2058055/1‑125 (MQ=18) cacaGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCa < 1:2057678/122‑1 (MQ=18) cacaGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCAt < 2:2057676/123‑1 (MQ=18) cacaGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGCGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTg > 1:2058129/1‑115 (MQ=17) cagcagGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCa > 2:2058195/1‑120 (MQ=18) gcagGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGGACGG‑C‑CGCTCACACAGACTGATTg > 1:2058297/1‑115 (MQ=17) agGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTg > 2:2058255/1‑113 (MQ=17) ggACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGc < 1:2057682/125‑1 (MQ=18) taCTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGcc > 1:2057888/2‑125 (MQ=18) gACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGa > 2:2058159/1‑108 (MQ=14) gACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGcc > 1:2058024/1‑125 (MQ=18) gACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGcc < 2:2057684/125‑1 (MQ=18) aCTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCt > 1:2058059/1‑125 (MQ=18) gAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATc < 2:2057693/125‑1 (MQ=18) gAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTAt < 1:2057689/124‑1 (MQ=18) gAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTAt < 1:2057694/124‑1 (MQ=18) aGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCg > 1:2058003/1‑125 (MQ=18) ggCTGCCAAACGGTGGGGGCGGGCGTGCCCGCGAGACAGGCGCCGCCGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGCCAC‑GCC‑CGCTCTCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGc < 1:2057697/125‑1 (MQ=18) ggCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGc < 2:2057699/125‑1 (MQ=18) gCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGc > 2:2057858/1‑124 (MQ=18) gCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGAt < 1:2057704/102‑1 (MQ=14) tGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCt > 2:2058023/1‑123 (MQ=18) ccAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCt > 2:2058016/1‑121 (MQ=17) ccAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAg < 2:2057709/125‑1 (MQ=18) cAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTAc > 2:2057996/1‑122 (MQ=18) cAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGt < 1:2057710/125‑1 (MQ=18) aaaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGt > 1:2058541/1‑124 (MQ=18) aaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGa < 1:2057719/125‑1 (MQ=18) aaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGa < 2:2057715/125‑1 (MQ=18) aaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGa < 2:2057718/125‑1 (MQ=18) ggTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACgg < 2:2057727/125‑1 (MQ=18) ggTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACgg < 1:2057725/125‑1 (MQ=18) tGGGACCGGTCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCACGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGATCCCGCAGACTGATTGCCATTAAGCg > 2:2058436/1‑102 (MQ=14) gggAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGGCTATCGCTACAGTGACGGcc < 1:2057731/124‑1 (MQ=17) gggAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGccc < 2:2057736/125‑1 (MQ=18) gggAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGcc < 1:2057737/124‑1 (MQ=18) gAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCgg < 2:2057740/125‑2 (MQ=18) gCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGTGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGtt < 1:2057744/124‑1 (MQ=18) cGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGtttt < 1:2057748/125‑1 (MQ=21) gggCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGttttt < 2:2057751/125‑1 (MQ=21) ggCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGtttttt < 2:2057754/125‑1 (MQ=21) ggCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGtttttt > 2:2058135/1‑125 (MQ=21) tGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttgttg < 2:2057760/125‑1 (MQ=21) 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cgGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGa < 2:2057793/124‑1 (MQ=25) cgGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGAc > 2:2058099/1‑125 (MQ=25) gTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTc < 2:2057796/125‑1 (MQ=37) gCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTccc < 1:2057798/125‑1 (MQ=37) tggcaccGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTa < 2:2057804/119‑1 (MQ=37) tggcaccGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTa > 1:2057938/7‑125 (MQ=37) ggcaccGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAg < 2:2057810/120‑1 (MQ=37) ccGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACg < 1:2057805/124‑1 (MQ=38) cGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGc < 2:2057815/125‑1 (MQ=38) ggCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGaa < 1:2057817/121‑1 (MQ=38) gCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACg > 2:2058177/1‑122 (MQ=38) gCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCt > 2:2058282/1‑124 (MQ=38) cTTTGCCGGTGTT‑CGCGGCCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGACCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCACGACTCCCTTGGAACGCTAt < 1:2057821/125‑1 (MQ=37) tttGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATc > 2:2058331/1‑125 (MQ=38) tttGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATc > 1:2058365/1‑125 (MQ=38) tGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCaa > 2:2058084/1‑125 (MQ=39) tGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGATACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCaa > 2:2058237/1‑125 (MQ=38) tcgcGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTg > 1:2058093/4‑125 (MQ=255) cgcGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATc < 2:2057835/120‑1 (MQ=255) cgcGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGa < 2:2057840/123‑1 (MQ=255) cGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGaaa < 1:2057834/125‑1 (MQ=255) gggCAC‑G‑CTCGCTCCCACAGACGGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGaa < 1:2057845/123‑1 (MQ=255) ggCAC‑GCC‑CGCTCGCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACg > 1:2058263/1‑125 (MQ=255) gCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGt < 2:2057849/125‑1 (MQ=255) | TTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCCACGGCTTTGCCGGTGTT‑T‑CGGGCAC‑G‑C‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGT > AE015451/1499383‑1499625 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |