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                                    aaCTCCTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTAt                       >  2:5424194/1‑110 (MQ=38)
                                    aaCTCCTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCga             >  2:5424141/1‑120 (MQ=37)
                                    aaCTCCTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCGAGACCa        <  2:5423848/125‑1 (MQ=35)
                                      cTCCTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCGAGACCa        <  2:5423850/123‑1 (MQ=34)
                                      cTCCTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCGAGACCa        <  1:5423849/123‑1 (MQ=34)
                                      cTCCTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCGAGACCAg       <  1:5423851/124‑1 (MQ=34)
                                      cTCCTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCGAGACCAGc      >  2:5424187/1‑125 (MQ=34)
                                      cTCCTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCGAGACCAGc      >  1:5424082/1‑125 (MQ=34)
                                      cTCCTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCGAGACCAGc      >  1:5424257/1‑125 (MQ=34)
                                       tCCTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACAGCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATc               >  2:5424206/1‑115 (MQ=18)
                                        ccTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCgag            >  1:5424189/1‑117 (MQ=32)
                                        ccTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCGGGACCAGcc     <  1:5423856/124‑1 (MQ=17)
                                        ccTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCGAGACCAGccc    >  1:5424280/1‑125 (MQ=32)
                                        ccTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCGAGACCAGccc    >  2:5424088/1‑125 (MQ=32)
                                        ccTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTACCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCGAGACCAGcc     <  2:5423855/124‑1 (MQ=17)
                                        ccTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGCTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCGAGAc          >  2:5424200/1‑119 (MQ=17)
                                         cTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCGAGACCAGCCCg   <  1:5423858/125‑1 (MQ=31)
                                         cTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCGAGACCAGCCCg   <  2:5423857/125‑1 (MQ=31)
                                                                                                                            |                                          
ATGAAGACGGTGCCTGCGACTTTCTTGCCCATGGGCAACTCCTATCGAGTAGGAGGCGGATTCACACCCGCCGTCCTCTCACACCACCGTGCGTACGGTTCCGTACACGGCGGTTCAGGTTACGCGGCTAAGCCGGTTAATCGTATCCAGTATCGAGACCAGCCCGA  >  AE015451/4391479‑4391645

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: